More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0895 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0895  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 461 aa  917    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2673  histidine kinase  53.62 
 
 		 436 aa  457  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0604  sensor histidine kinase  54.52 
 
 		 436 aa  454  1.0000000000000001e-126  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0605  sensor histidine kinase  53.44 
 
 		 432 aa  446  1.0000000000000001e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.972928  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0918  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.02 
 
 		 467 aa  418  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.123629 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1067  histidine kinase  49.24 
 
 		 467 aa  418  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1359  two component sensor kinase  48.92 
 
 		 471 aa  412  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0429  sensor histidine kinase FeuQ  46.92 
 
 		 473 aa  413  1e-114  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.43 
 
 		 461 aa  392  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.21 
 
 		 459 aa  319  6e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3453  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.87 
 
 		 464 aa  296  6e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1434  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.11 
 
 		 465 aa  294  2e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1831  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.11 
 
 		 458 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0398387  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2127  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.38 
 
 		 463 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.87 
 
 		 465 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.374305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3068  putative two-component sensor histidine kinase  37.8 
 
 		 458 aa  281  3e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.691387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1188  Signal transduction histidine kinase  38.16 
 
 		 465 aa  280  4e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0435  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.11 
 
 		 481 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.711544 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 		 463 aa  272  8.000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.31 
 
 		 471 aa  271  2e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1684  histidine kinase  39.31 
 
 		 471 aa  270  5e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.091412  normal  0.96111 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1409  ATPase domain-containing protein  39.31 
 
 		 471 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.137041 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3177  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.69 
 
 		 475 aa  267  2.9999999999999995e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0501501 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4990  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.79 
 
 		 472 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000206747 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4435  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.28 
 
 		 490 aa  252  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.713299 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4170  histidine kinase  40.14 
 
 		 490 aa  241  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3895  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 		 460 aa  239  8e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.378674  normal  0.194122 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0937  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.27 
 
 		 461 aa  233  5e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.159129 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0802  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 		 463 aa  230  4e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00906644 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.81 
 
 		 445 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0398387  normal  0.0265162 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3443  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 		 478 aa  219  5e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131083  normal  0.673106 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3188  histidine kinase  36.56 
 
 		 456 aa  218  1e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10722  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02659  hypothetical protein  31.88 
 
 		 449 aa  219  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.14 
 
 		 446 aa  218  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.741916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003785  signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 		 441 aa  218  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0077957  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.14 
 
 		 446 aa  217  4e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0175865 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5129  putative two-component sensor histidine kinase  31.57 
 
 		 448 aa  216  9e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5100  histidine kinase  34.54 
 
 		 482 aa  214  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.368053  normal  0.11003 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1978  signal transduction protein, histidine kinase  32.69 
 
 		 444 aa  211  2e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2065  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.37 
 
 		 467 aa  209  6e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1245  sensor histidine kinase  32.41 
 
 		 462 aa  203  6e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000271676  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0631  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.97 
 
 		 459 aa  197  3e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0181536  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1886  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.57 
 
 		 484 aa  196  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4082  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 		 455 aa  192  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.154716 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3430  histidine kinase  32.97 
 
 		 464 aa  192  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.17 
 
 		 439 aa  190  5e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5126  two component sensor kinase  32.61 
 
 		 456 aa  187  4e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4931  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 		 450 aa  186  7e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.231481 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6193  histidine kinase  34.48 
 
 		 452 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1038  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 		 474 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.596315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3059  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 		 453 aa  184  4.0000000000000006e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4113  ATPase domain-containing protein  36.41 
 
 		 448 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal  0.819443 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4481  histidine kinase  35.93 
 
 		 448 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.410421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1772  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 482 aa  178  2e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.480782  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4693  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 		 452 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1841  two-component system, sensor protein  31.75 
 
 		 482 aa  177  4e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.775188  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4047  sensor histidine kinase  36.31 
 
 		 317 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 		 475 aa  174  3.9999999999999995e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.587392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4325  hypothetical protein  35.37 
 
 		 411 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.36321 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5572  putative two-component sensor histidine kinase  32.48 
 
 		 471 aa  171  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.118515 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4403  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 		 454 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 		 456 aa  169  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02837  two-component system sensor protein required for AvrXa21activity H2 (raxH2)  31.16 
 
 		 456 aa  167  4e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4594  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 460 aa  163  6e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3354  ribose 5-phosphate isomerase  28.69 
 
 		 456 aa  161  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000158163  normal  0.115638 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0167  histidine kinase  30.67 
 
 		 429 aa  159  7e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 		 458 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4111  sodium/glutamate symporter  42.65 
 
 		 369 aa  156  9e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.381154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1131  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.37 
 
 		 442 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2975  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 460 aa  153  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.241819 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3007  sensor histidine kinase  30.02 
 
 		 445 aa  151  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0659  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.04 
 
 		 441 aa  151  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000460347  hitchhiker  0.000037431 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1948  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 		 439 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.014264 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3304  sensor histidine kinase  29.85 
 
 		 466 aa  149  8e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.232472 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3778  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 462 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2064  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 		 441 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0576592 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2504  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 		 443 aa  148  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3693  histidine kinase  30.97 
 
 		 442 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 		 442 aa  147  5e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000150109  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3876  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 		 442 aa  147  5e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.213045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 		 442 aa  147  5e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139912  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2544  putative two-component sensor  37.59 
 
 		 444 aa  147  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0961662  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 		 439 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.98279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3295  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.16 
 
 		 444 aa  145  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.183643  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3876  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 		 441 aa  145  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000107272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3750  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.75 
 
 		 442 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2936  histidine kinase  31.94 
 
 		 517 aa  144  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00120898  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0203  two component sensor kinase  30.8 
 
 		 451 aa  144  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4804  histidine kinase  29.3 
 
 		 446 aa  144  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.631947  normal  0.828013 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3247  sensor histidine kinase  28.51 
 
 		 469 aa  143  5e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000098482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3512  histidine kinase  28.29 
 
 		 441 aa  143  6e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00937623  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3512  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 		 447 aa  143  7e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0621  sensor histidine kinase  30.8 
 
 		 442 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2616  histidine kinase  34.38 
 
 		 474 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29740  putative two-component sensor  36.6 
 
 		 445 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02298  sensor histidine kinase  32.79 
 
 		 443 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2349  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 		 449 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000892956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 		 439 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0848259  normal  0.136137 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3157  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 		 447 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0710965 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0614  ATPase domain-containing protein  30.54 
 
 		 442 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.617782  normal  0.375325 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>