More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0230 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02837  two-component system sensor protein required for AvrXa21activity H2 (raxH2)  77.07 
 
 		 456 aa  703    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1841  two-component system, sensor protein  73.09 
 
 		 482 aa  667    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.775188  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 475 aa  955    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.587392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1772  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  72.67 
 
 		 482 aa  664    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.480782  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1263  ATP-binding region, ATPase-like protein  32.31 
 
 		 474 aa  250  3e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000081586  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0281  sensor histidine kinase  30.27 
 
 		 475 aa  241  2e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.012454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1131  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 		 442 aa  237  3e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0167  histidine kinase  36.8 
 
 		 429 aa  231  3e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0243  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 		 440 aa  229  8e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.37468  normal  0.182435 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3247  sensor histidine kinase  31.26 
 
 		 469 aa  226  8e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000098482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4345  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 		 454 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0442368  normal  0.692011 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3304  sensor histidine kinase  34.48 
 
 		 466 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.232472 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 		 454 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0526543  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3354  ribose 5-phosphate isomerase  31.73 
 
 		 456 aa  218  1e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000158163  normal  0.115638 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2936  histidine kinase  28.24 
 
 		 517 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00120898  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4141  histidine kinase  31.39 
 
 		 454 aa  216  7e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1957  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 		 443 aa  215  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0083917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2696  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 		 484 aa  211  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000110077  normal  0.128468 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4648  sensor histidine kinase  31.03 
 
 		 454 aa  209  7e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1389  sensor protein PhoQ  30.13 
 
 		 470 aa  207  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.812387  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3818  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.4 
 
 		 454 aa  207  4e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00854299  decreased coverage  0.0034747 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3909  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.4 
 
 		 454 aa  207  4e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000571443  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4026  ATPase domain-containing protein  30.89 
 
 		 454 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3853  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.78 
 
 		 454 aa  197  3e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3684  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 		 455 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.714122  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2504  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.26 
 
 		 443 aa  196  8.000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 		 471 aa  194  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1684  histidine kinase  31.91 
 
 		 471 aa  192  8e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.091412  normal  0.96111 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1409  ATPase domain-containing protein  31.91 
 
 		 471 aa  192  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.137041 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02298  sensor histidine kinase  30.97 
 
 		 443 aa  191  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4990  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 		 472 aa  189  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000206747 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3381  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 		 466 aa  188  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00620745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4239  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 		 450 aa  187  5e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1434  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.72 
 
 		 465 aa  186  7e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2975  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.69 
 
 		 460 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.241819 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0895  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 		 461 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3068  putative two-component sensor histidine kinase  28.75 
 
 		 458 aa  184  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.691387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003785  signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 		 441 aa  180  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0077957  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 		 459 aa  180  4e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3708  sensor histidine kinase  32.4 
 
 		 448 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.642299  hitchhiker  0.00152873 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1978  signal transduction protein, histidine kinase  29.16 
 
 		 444 aa  177  3e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1680  sensor protein PhoQ  32.54 
 
 		 448 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 		 442 aa  176  8e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000150109  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0621  sensor histidine kinase  37.12 
 
 		 442 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1245  sensor histidine kinase  33.55 
 
 		 462 aa  175  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000271676  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2841  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 		 445 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0615  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.37 
 
 		 442 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.27687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3415  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.37 
 
 		 442 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.147478  normal  0.210462 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0614  ATPase domain-containing protein  37.37 
 
 		 442 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.617782  normal  0.375325 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2487  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 		 450 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3876  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.7 
 
 		 442 aa  173  5e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.213045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3453  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 		 464 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3693  histidine kinase  36.7 
 
 		 442 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.7 
 
 		 442 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139912  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1188  Signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 		 465 aa  171  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.89 
 
 		 439 aa  171  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3750  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 442 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02659  hypothetical protein  28.57 
 
 		 449 aa  168  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.01 
 
 		 448 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.95 
 
 		 448 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1217  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.01 
 
 		 448 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 465 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.374305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2127  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.56 
 
 		 463 aa  166  8e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2349  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.42 
 
 		 449 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000892956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0604  sensor histidine kinase  29.62 
 
 		 436 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1607  sensor protein PhoQ  36.4 
 
 		 484 aa  164  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0605  sensor histidine kinase  29.86 
 
 		 432 aa  164  4.0000000000000004e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.972928  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4170  histidine kinase  30.8 
 
 		 490 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1714  sensor protein PhoQ  36.4 
 
 		 468 aa  164  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2856  sensor protein PhoQ  36.4 
 
 		 484 aa  163  5.0000000000000005e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1831  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.15 
 
 		 458 aa  163  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0398387  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0918  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 		 467 aa  163  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.123629 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1067  histidine kinase  30.9 
 
 		 467 aa  163  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0659  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 		 441 aa  162  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000460347  hitchhiker  0.000037431 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0582  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 		 445 aa  162  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.684402  normal  0.489398 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1938  sensor protein PhoQ  35.4 
 
 		 483 aa  162  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5129  putative two-component sensor histidine kinase  29.87 
 
 		 448 aa  162  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1723  ATPase domain-containing protein  33.44 
 
 		 449 aa  161  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.124766 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2067  sensor protein PhoQ  35.79 
 
 		 483 aa  162  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.194184  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0631  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 		 459 aa  161  3e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0181536  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0435  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 481 aa  160  5e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.711544 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1945  sensor protein PhoQ  33.77 
 
 		 449 aa  160  6e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2673  histidine kinase  29.11 
 
 		 436 aa  160  6e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.46 
 
 		 463 aa  159  7e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1199  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 		 448 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1849  histidine kinase  32.47 
 
 		 449 aa  159  9e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00571096  hitchhiker  0.00108599 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5100  histidine kinase  35.81 
 
 		 482 aa  159  9e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.368053  normal  0.11003 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2495  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 		 449 aa  159  9e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.796582  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2615  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 		 449 aa  159  9e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0121943 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1359  two component sensor kinase  30.79 
 
 		 471 aa  159  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0937  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 		 461 aa  159  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.159129 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3512  histidine kinase  28.76 
 
 		 441 aa  158  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00937623  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1541  sensor protein PhoQ  33.77 
 
 		 450 aa  158  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2502  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 		 449 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1654  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.12 
 
 		 449 aa  158  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0689547  hitchhiker  0.00033988 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1790  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 		 451 aa  158  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1579  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.12 
 
 		 449 aa  157  3e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.15351 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4435  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 490 aa  157  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.713299 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2012  sensor protein PhoQ  35.45 
 
 		 485 aa  157  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0783662 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2256  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 		 449 aa  156  8e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>