More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4435 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4170  histidine kinase  93.47 
 
 		 490 aa  827    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4435  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 490 aa  958    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.713299 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4990  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  77.58 
 
 		 472 aa  688    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000206747 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1409  ATPase domain-containing protein  76.36 
 
 		 471 aa  680    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.137041 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  76.36 
 
 		 471 aa  679    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1684  histidine kinase  76.14 
 
 		 471 aa  679    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.091412  normal  0.96111 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.39 
 
 		 463 aa  461  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3068  putative two-component sensor histidine kinase  50.77 
 
 		 458 aa  436  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.691387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0435  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.74 
 
 		 481 aa  432  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.711544 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2127  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.87 
 
 		 463 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3453  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  51.42 
 
 		 464 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1831  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  49.23 
 
 		 458 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0398387  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1434  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  49.57 
 
 		 465 aa  418  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1188  Signal transduction histidine kinase  50.55 
 
 		 465 aa  409  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  49.56 
 
 		 465 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.374305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3177  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.11 
 
 		 475 aa  365  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0501501 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.06 
 
 		 459 aa  334  2e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1067  histidine kinase  39.96 
 
 		 467 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0918  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.92 
 
 		 467 aa  282  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.123629 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0895  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 		 461 aa  280  4e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1359  two component sensor kinase  39.36 
 
 		 471 aa  273  6e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0604  sensor histidine kinase  39.64 
 
 		 436 aa  263  8e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0605  sensor histidine kinase  39.86 
 
 		 432 aa  261  3e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.972928  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0429  sensor histidine kinase FeuQ  36.62 
 
 		 473 aa  258  1e-67  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3895  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.48 
 
 		 460 aa  256  9e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.378674  normal  0.194122 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2673  histidine kinase  37.16 
 
 		 436 aa  250  4e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0937  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.58 
 
 		 461 aa  249  5e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.159129 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0631  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 		 459 aa  238  2e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0181536  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2616  histidine kinase  36.62 
 
 		 474 aa  237  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.12 
 
 		 456 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 		 461 aa  234  4.0000000000000004e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003785  signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 		 441 aa  228  3e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0077957  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02659  hypothetical protein  34.66 
 
 		 449 aa  226  5.0000000000000005e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1245  sensor histidine kinase  32.68 
 
 		 462 aa  226  7e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000271676  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0802  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 		 463 aa  226  7e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00906644 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.04 
 
 		 445 aa  226  8e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0398387  normal  0.0265162 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3059  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.81 
 
 		 453 aa  224  2e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3430  histidine kinase  37.45 
 
 		 464 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4082  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.39 
 
 		 455 aa  221  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.154716 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5129  putative two-component sensor histidine kinase  35.24 
 
 		 448 aa  219  7e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5126  two component sensor kinase  35.23 
 
 		 456 aa  219  8.999999999999998e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.74 
 
 		 446 aa  216  5e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0175865 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.74 
 
 		 446 aa  216  5.9999999999999996e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.741916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5100  histidine kinase  37.75 
 
 		 482 aa  206  6e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.368053  normal  0.11003 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3188  histidine kinase  36.88 
 
 		 456 aa  205  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10722  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2065  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.66 
 
 		 467 aa  204  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3443  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.34 
 
 		 478 aa  202  8e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131083  normal  0.673106 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4047  sensor histidine kinase  40.75 
 
 		 317 aa  201  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2064  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 		 441 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0576592 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.22 
 
 		 439 aa  199  7.999999999999999e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1978  signal transduction protein, histidine kinase  31.74 
 
 		 444 aa  198  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02837  two-component system sensor protein required for AvrXa21activity H2 (raxH2)  31.91 
 
 		 456 aa  198  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1038  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.58 
 
 		 474 aa  197  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.596315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5572  putative two-component sensor histidine kinase  33.48 
 
 		 471 aa  194  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.118515 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6193  histidine kinase  35.5 
 
 		 452 aa  187  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 		 475 aa  181  2.9999999999999997e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.587392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1772  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 482 aa  180  4.999999999999999e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.480782  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1841  two-component system, sensor protein  30.25 
 
 		 482 aa  179  9e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.775188  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3778  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 		 462 aa  179  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4113  ATPase domain-containing protein  35.48 
 
 		 448 aa  179  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal  0.819443 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4481  histidine kinase  35.22 
 
 		 448 aa  178  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.410421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1886  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 		 484 aa  178  3e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0203  two component sensor kinase  31.39 
 
 		 451 aa  175  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4325  hypothetical protein  36.57 
 
 		 411 aa  170  6e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.36321 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2696  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 		 484 aa  169  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000110077  normal  0.128468 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4931  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 		 450 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.231481 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4345  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.99 
 
 		 454 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0442368  normal  0.692011 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1131  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 442 aa  168  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3354  ribose 5-phosphate isomerase  26.78 
 
 		 456 aa  165  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000158163  normal  0.115638 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 		 454 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0526543  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29740  putative two-component sensor  37.45 
 
 		 445 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1355  Signal transduction histidine kinase  34.97 
 
 		 441 aa  163  8.000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4594  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.84 
 
 		 460 aa  163  8.000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0167  histidine kinase  38.93 
 
 		 429 aa  162  9e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4403  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.41 
 
 		 454 aa  162  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0281  sensor histidine kinase  28.57 
 
 		 475 aa  161  3e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.012454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4141  histidine kinase  27.99 
 
 		 454 aa  160  4e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2544  putative two-component sensor  31.69 
 
 		 444 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0961662  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3304  sensor histidine kinase  31.32 
 
 		 466 aa  159  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.232472 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1948  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 		 439 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.014264 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 458 aa  158  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4693  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 		 452 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3684  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 455 aa  154  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.714122  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1263  ATP-binding region, ATPase-like protein  29.25 
 
 		 474 aa  154  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000081586  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3853  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 		 454 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4111  sodium/glutamate symporter  40.37 
 
 		 369 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.381154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28570  sensory histidine protein kinase  36.43 
 
 		 440 aa  154  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.380534  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02298  sensor histidine kinase  33.21 
 
 		 443 aa  154  4e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3818  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 		 454 aa  152  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00854299  decreased coverage  0.0034747 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3909  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 		 454 aa  151  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000571443  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3381  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 		 466 aa  152  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00620745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3007  sensor histidine kinase  31.54 
 
 		 445 aa  150  4e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 		 439 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0848259  normal  0.136137 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2615  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 		 449 aa  149  8e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0121943 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2495  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 		 449 aa  149  8e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.796582  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2349  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.14 
 
 		 449 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000892956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 		 439 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.98279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3157  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 		 447 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0710965 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4026  ATPase domain-containing protein  28.39 
 
 		 454 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3211  sensor histidine kinase  28.69 
 
 		 439 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.608335  normal  0.379725 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>