More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0605 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0605  sensor histidine kinase  100 
 
 
432 aa  867    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.972928  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2673  histidine kinase  86.81 
 
 
436 aa  763    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0604  sensor histidine kinase  99.31 
 
 
436 aa  865    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0895  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  53.44 
 
 
461 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0429  sensor histidine kinase FeuQ  50.82 
 
 
473 aa  433  1e-120  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1067  histidine kinase  46.4 
 
 
467 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0918  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.38 
 
 
467 aa  398  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.123629 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1359  two component sensor kinase  48.42 
 
 
471 aa  391  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.67 
 
 
461 aa  346  5e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112663  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.86 
 
 
459 aa  290  3e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3453  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.71 
 
 
464 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1434  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.78 
 
 
465 aa  286  5e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1188  Signal transduction histidine kinase  40.93 
 
 
465 aa  281  1e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.94 
 
 
465 aa  280  4e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.374305  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1831  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.51 
 
 
458 aa  279  8e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0398387  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3068  putative two-component sensor histidine kinase  38.46 
 
 
458 aa  276  5e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.691387  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0435  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 
481 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.711544 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2127  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.58 
 
 
463 aa  272  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3177  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38 
 
 
475 aa  256  4e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0501501 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4990  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.82 
 
 
472 aa  252  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000206747 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1684  histidine kinase  40.32 
 
 
471 aa  251  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.091412  normal  0.96111 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1409  ATPase domain-containing protein  40.55 
 
 
471 aa  251  1e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.137041 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.32 
 
 
471 aa  249  6e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 
463 aa  247  3e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4435  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.05 
 
 
490 aa  243  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.713299 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4170  histidine kinase  39.2 
 
 
490 aa  232  8.000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0937  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 
461 aa  221  1.9999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.159129 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0802  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 
463 aa  221  3e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00906644 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3895  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
460 aa  217  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.378674  normal  0.194122 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2065  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.99 
 
 
467 aa  216  8e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5100  histidine kinase  34.67 
 
 
482 aa  210  5e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.368053  normal  0.11003 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5129  putative two-component sensor histidine kinase  32.64 
 
 
448 aa  209  6e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60361  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3443  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 
478 aa  207  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131083  normal  0.673106 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.82 
 
 
439 aa  206  7e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1245  sensor histidine kinase  32.91 
 
 
462 aa  195  1e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000271676  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 
446 aa  194  3e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.741916  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4047  sensor histidine kinase  38.44 
 
 
317 aa  192  7e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.8 
 
 
446 aa  189  8e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0175865 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 
445 aa  186  7e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0398387  normal  0.0265162 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3430  histidine kinase  33.41 
 
 
464 aa  186  9e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1978  signal transduction protein, histidine kinase  29.2 
 
 
444 aa  186  9e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1886  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.78 
 
 
484 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003785  signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 
441 aa  185  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0077957  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02659  hypothetical protein  29.17 
 
 
449 aa  183  5.0000000000000004e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3188  histidine kinase  30.77 
 
 
456 aa  181  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10722  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4082  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 
455 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.154716 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4931  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 
450 aa  177  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.231481 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6193  histidine kinase  33.65 
 
 
452 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3059  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
453 aa  172  7.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5572  putative two-component sensor histidine kinase  32.3 
 
 
471 aa  172  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.118515 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4113  ATPase domain-containing protein  34.05 
 
 
448 aa  170  4e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal  0.819443 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4481  histidine kinase  34.05 
 
 
448 aa  170  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.410421  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0631  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 
459 aa  169  8e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0181536  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3354  ribose 5-phosphate isomerase  28.25 
 
 
456 aa  164  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000158163  normal  0.115638 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1038  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 
474 aa  160  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.596315  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4594  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 
460 aa  158  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4325  hypothetical protein  34.94 
 
 
411 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.36321 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1841  two-component system, sensor protein  37.92 
 
 
482 aa  156  8e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.775188  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4693  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 
452 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1772  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.58 
 
 
482 aa  155  2e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.480782  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1355  Signal transduction histidine kinase  40.29 
 
 
441 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2064  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.08 
 
 
441 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0576592 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5126  two component sensor kinase  30.24 
 
 
456 aa  154  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 
475 aa  154  4e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.587392  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0167  histidine kinase  30.23 
 
 
429 aa  152  8.999999999999999e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3512  histidine kinase  30.26 
 
 
441 aa  151  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00937623  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4403  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 
454 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 
448 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3157  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 
447 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0710965 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1957  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 
443 aa  150  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0083917  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1948  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.26 
 
 
439 aa  149  9e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.014264 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02837  two-component system sensor protein required for AvrXa21activity H2 (raxH2)  34.3 
 
 
456 aa  149  9e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 
456 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3304  sensor histidine kinase  30.43 
 
 
466 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.232472 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1217  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 
448 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3512  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.25 
 
 
447 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2544  putative two-component sensor  36.06 
 
 
444 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0961662  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3909  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.52 
 
 
454 aa  147  5e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000571443  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2616  histidine kinase  29.77 
 
 
474 aa  146  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29740  putative two-component sensor  36.43 
 
 
445 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.37 
 
 
448 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2856  sensor protein PhoQ  31 
 
 
484 aa  145  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1714  sensor protein PhoQ  31 
 
 
468 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 
458 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3818  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 
454 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00854299  decreased coverage  0.0034747 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2504  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 
443 aa  145  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3247  sensor histidine kinase  33.33 
 
 
469 aa  145  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000098482  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2150  sensor protein PhoQ  31.09 
 
 
486 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0666594  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0621  sensor histidine kinase  29.89 
 
 
442 aa  144  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1607  sensor protein PhoQ  31 
 
 
484 aa  144  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1849  histidine kinase  28.38 
 
 
449 aa  143  7e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00571096  hitchhiker  0.00108599 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4111  sodium/glutamate symporter  40.93 
 
 
369 aa  142  9e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.381154  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3380  sensor histidine kinase  36.64 
 
 
439 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.625161  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3007  sensor histidine kinase  30.26 
 
 
445 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3211  sensor histidine kinase  35.88 
 
 
439 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.608335  normal  0.379725 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1938  sensor protein PhoQ  30.74 
 
 
483 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4026  ATPase domain-containing protein  34.36 
 
 
454 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4648  sensor histidine kinase  35.16 
 
 
454 aa  140  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.35 
 
 
439 aa  141  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0848259  normal  0.136137 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0614  ATPase domain-containing protein  29.05 
 
 
442 aa  140  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.617782  normal  0.375325 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>