More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2229 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 463 aa  924    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0435  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  66.96 
 
 		 481 aa  588  1e-167  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.711544 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2127  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.2 
 
 		 463 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3068  putative two-component sensor histidine kinase  52.08 
 
 		 458 aa  444  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.691387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4990  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.49 
 
 		 472 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000206747 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1409  ATPase domain-containing protein  52.74 
 
 		 471 aa  436  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.137041 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3453  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  50.98 
 
 		 464 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  50.86 
 
 		 465 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.374305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1684  histidine kinase  52.74 
 
 		 471 aa  437  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.091412  normal  0.96111 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.95 
 
 		 471 aa  436  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1831  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  50.11 
 
 		 458 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0398387  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1434  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  50.66 
 
 		 465 aa  432  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4435  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.27 
 
 		 490 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.713299 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1188  Signal transduction histidine kinase  50.22 
 
 		 465 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4170  histidine kinase  54.17 
 
 		 490 aa  411  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3177  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.61 
 
 		 475 aa  374  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0501501 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.89 
 
 		 459 aa  333  3e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0895  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 		 461 aa  272  8.000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0937  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.36 
 
 		 461 aa  256  7e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.159129 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3895  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.35 
 
 		 460 aa  253  4.0000000000000004e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.378674  normal  0.194122 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0604  sensor histidine kinase  36.43 
 
 		 436 aa  250  5e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0918  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.11 
 
 		 467 aa  248  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.123629 
 
 
-
 
NC_004310  BR0605  sensor histidine kinase  36.55 
 
 		 432 aa  247  4e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.972928  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1067  histidine kinase  35.9 
 
 		 467 aa  246  6e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2673  histidine kinase  34.84 
 
 		 436 aa  246  9e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0429  sensor histidine kinase FeuQ  33.62 
 
 		 473 aa  239  9e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1359  two component sensor kinase  35.26 
 
 		 471 aa  239  1e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 461 aa  237  4e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3059  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.21 
 
 		 453 aa  228  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0631  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.36 
 
 		 459 aa  226  6e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0181536  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 		 456 aa  226  8e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0802  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.38 
 
 		 463 aa  224  3e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00906644 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5100  histidine kinase  39.9 
 
 		 482 aa  223  4.9999999999999996e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.368053  normal  0.11003 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5129  putative two-component sensor histidine kinase  33.77 
 
 		 448 aa  222  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3430  histidine kinase  41.25 
 
 		 464 aa  219  7e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2616  histidine kinase  34.75 
 
 		 474 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4082  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.52 
 
 		 455 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.154716 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.57 
 
 		 446 aa  212  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0175865 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.92 
 
 		 446 aa  212  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.741916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.58 
 
 		 445 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0398387  normal  0.0265162 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02659  hypothetical protein  32.9 
 
 		 449 aa  211  3e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003785  signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 		 441 aa  210  5e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0077957  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5126  two component sensor kinase  32.98 
 
 		 456 aa  209  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3188  histidine kinase  38.01 
 
 		 456 aa  207  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10722  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3443  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.12 
 
 		 478 aa  204  4e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131083  normal  0.673106 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1245  sensor histidine kinase  35.1 
 
 		 462 aa  201  3e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000271676  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.98 
 
 		 439 aa  199  6e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2065  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 		 467 aa  196  8.000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6193  histidine kinase  35.96 
 
 		 452 aa  188  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1038  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 		 474 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.596315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5572  putative two-component sensor histidine kinase  33.19 
 
 		 471 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.118515 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4113  ATPase domain-containing protein  34.35 
 
 		 448 aa  183  7e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal  0.819443 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4481  histidine kinase  33.84 
 
 		 448 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.410421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1978  signal transduction protein, histidine kinase  31.23 
 
 		 444 aa  180  4.999999999999999e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1886  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 		 484 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2064  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.6 
 
 		 441 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0576592 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4047  sensor histidine kinase  38.36 
 
 		 317 aa  173  6.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0167  histidine kinase  38.15 
 
 		 429 aa  170  6e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3354  ribose 5-phosphate isomerase  28.81 
 
 		 456 aa  168  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000158163  normal  0.115638 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02837  two-component system sensor protein required for AvrXa21activity H2 (raxH2)  30.09 
 
 		 456 aa  168  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4931  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 		 450 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.231481 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0203  two component sensor kinase  33.01 
 
 		 451 aa  160  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4325  hypothetical protein  34.38 
 
 		 411 aa  159  8e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.36321 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 475 aa  157  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.587392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3304  sensor histidine kinase  30.18 
 
 		 466 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.232472 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1948  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.33 
 
 		 439 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.014264 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4594  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 460 aa  155  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2544  putative two-component sensor  28.82 
 
 		 444 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0961662  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1355  Signal transduction histidine kinase  37.41 
 
 		 441 aa  155  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29740  putative two-component sensor  31.11 
 
 		 445 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3684  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.12 
 
 		 455 aa  153  7e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.714122  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1131  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 		 442 aa  150  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.7 
 
 		 439 aa  150  6e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0848259  normal  0.136137 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3512  histidine kinase  30.53 
 
 		 441 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00937623  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4111  sodium/glutamate symporter  37.59 
 
 		 369 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.381154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4345  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.65 
 
 		 454 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0442368  normal  0.692011 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2502  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 449 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3778  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 		 462 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1541  sensor protein PhoQ  33.71 
 
 		 450 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1957  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.08 
 
 		 443 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0083917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 		 458 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4693  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.01 
 
 		 452 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1841  two-component system, sensor protein  28.38 
 
 		 482 aa  147  4.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.775188  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1723  ATPase domain-containing protein  31.44 
 
 		 449 aa  147  5e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.124766 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3853  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 454 aa  146  6e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3247  sensor histidine kinase  33.82 
 
 		 469 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000098482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3708  sensor histidine kinase  33.46 
 
 		 448 aa  146  9e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.642299  hitchhiker  0.00152873 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3211  sensor histidine kinase  35.96 
 
 		 439 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.608335  normal  0.379725 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 		 439 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000231827 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4403  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.75 
 
 		 454 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2936  histidine kinase  32.41 
 
 		 517 aa  145  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00120898  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1654  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 449 aa  145  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0689547  hitchhiker  0.00033988 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28570  sensory histidine protein kinase  35.27 
 
 		 440 aa  145  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.380534  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1945  sensor protein PhoQ  32.08 
 
 		 449 aa  144  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1680  sensor protein PhoQ  34.08 
 
 		 448 aa  144  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2349  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.68 
 
 		 449 aa  144  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000892956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2495  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 449 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.796582  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 		 454 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0526543  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1579  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.32 
 
 		 449 aa  144  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.15351 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2615  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 449 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0121943 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>