More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4170 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_1409  ATPase domain-containing protein  76.3 
 
 
471 aa  678    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.137041 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  76.3 
 
 
471 aa  676    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4170  histidine kinase  100 
 
 
490 aa  960    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4435  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  93.47 
 
 
490 aa  800    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.713299 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1684  histidine kinase  76.09 
 
 
471 aa  677    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.091412  normal  0.96111 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4990  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  78.34 
 
 
472 aa  697    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000206747 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.17 
 
 
463 aa  456  1e-127  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0435  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.73 
 
 
481 aa  433  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.711544 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3068  putative two-component sensor histidine kinase  50.77 
 
 
458 aa  434  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.691387  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2127  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.87 
 
 
463 aa  425  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1831  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  49.67 
 
 
458 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0398387  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3453  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  51.32 
 
 
464 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1434  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  49.03 
 
 
465 aa  418  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1188  Signal transduction histidine kinase  50.11 
 
 
465 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  49.56 
 
 
465 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.374305  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3177  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.67 
 
 
475 aa  361  1e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0501501 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.72 
 
 
459 aa  330  4e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1067  histidine kinase  40.09 
 
 
467 aa  279  9e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0918  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.13 
 
 
467 aa  277  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.123629 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0895  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.33 
 
 
461 aa  269  1e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1359  two component sensor kinase  38.94 
 
 
471 aa  266  5.999999999999999e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0429  sensor histidine kinase FeuQ  36.18 
 
 
473 aa  256  5e-67  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3895  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.04 
 
 
460 aa  251  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.378674  normal  0.194122 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0604  sensor histidine kinase  38.58 
 
 
436 aa  251  2e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0605  sensor histidine kinase  39.02 
 
 
432 aa  249  8e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.972928  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0937  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.3 
 
 
461 aa  244  1.9999999999999999e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.159129 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2673  histidine kinase  36.47 
 
 
436 aa  242  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 
461 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112663  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2616  histidine kinase  36.58 
 
 
474 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1245  sensor histidine kinase  32.98 
 
 
462 aa  228  2e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000271676  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0631  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.19 
 
 
459 aa  227  5.0000000000000005e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0181536  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003785  signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 
441 aa  222  9e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0077957  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 
456 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02659  hypothetical protein  33.26 
 
 
449 aa  222  1.9999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
446 aa  218  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0175865 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
446 aa  218  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.741916  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3430  histidine kinase  40 
 
 
464 aa  216  7e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4082  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.39 
 
 
455 aa  216  9e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.154716 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 
445 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0398387  normal  0.0265162 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3059  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.38 
 
 
453 aa  215  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0802  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.23 
 
 
463 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00906644 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5129  putative two-component sensor histidine kinase  34.8 
 
 
448 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60361  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5126  two component sensor kinase  33.99 
 
 
456 aa  207  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2065  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.79 
 
 
467 aa  203  5e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5100  histidine kinase  37.35 
 
 
482 aa  203  6e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.368053  normal  0.11003 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3443  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 
478 aa  200  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131083  normal  0.673106 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02837  two-component system sensor protein required for AvrXa21activity H2 (raxH2)  31.69 
 
 
456 aa  198  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1978  signal transduction protein, histidine kinase  32.08 
 
 
444 aa  196  5.000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.22 
 
 
439 aa  196  5.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3188  histidine kinase  35.97 
 
 
456 aa  196  6e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10722  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4047  sensor histidine kinase  41.25 
 
 
317 aa  196  8.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2064  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.38 
 
 
441 aa  193  5e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0576592 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1038  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 
474 aa  189  9e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.596315  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5572  putative two-component sensor histidine kinase  32.82 
 
 
471 aa  186  7e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.118515 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 
475 aa  184  4.0000000000000006e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.587392  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1772  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 
482 aa  179  1e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.480782  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1841  two-component system, sensor protein  29.86 
 
 
482 aa  179  1e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.775188  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1886  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 
484 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6193  histidine kinase  33.77 
 
 
452 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3778  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 
462 aa  173  5.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0203  two component sensor kinase  31.35 
 
 
451 aa  172  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4113  ATPase domain-containing protein  33.76 
 
 
448 aa  169  9e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal  0.819443 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4481  histidine kinase  34.02 
 
 
448 aa  169  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.410421  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4931  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 
450 aa  167  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.231481 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2696  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 
484 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000110077  normal  0.128468 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0167  histidine kinase  38.55 
 
 
429 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1131  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
442 aa  162  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4325  hypothetical protein  36.76 
 
 
411 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.36321 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4345  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.79 
 
 
454 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0442368  normal  0.692011 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3304  sensor histidine kinase  32.55 
 
 
466 aa  159  8e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.232472 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0281  sensor histidine kinase  27.52 
 
 
475 aa  159  9e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.012454  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4141  histidine kinase  28.01 
 
 
454 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4403  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 
454 aa  158  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4594  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.99 
 
 
460 aa  157  4e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3354  ribose 5-phosphate isomerase  26.02 
 
 
456 aa  157  5.0000000000000005e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000158163  normal  0.115638 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 
454 aa  156  9e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0526543  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29740  putative two-component sensor  36 
 
 
445 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2544  putative two-component sensor  36.73 
 
 
444 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0961662  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1948  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 
439 aa  154  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.014264 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 
458 aa  154  5e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02298  sensor histidine kinase  33.8 
 
 
443 aa  152  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4693  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 
452 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3684  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.12 
 
 
455 aa  151  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.714122  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1263  ATP-binding region, ATPase-like protein  29.52 
 
 
474 aa  150  4e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000081586  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3247  sensor histidine kinase  31.88 
 
 
469 aa  150  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000098482  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28570  sensory histidine protein kinase  36.43 
 
 
440 aa  149  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.380534  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4111  sodium/glutamate symporter  39.63 
 
 
369 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.381154  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1355  Signal transduction histidine kinase  34.46 
 
 
441 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3853  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.16 
 
 
454 aa  147  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1714  sensor protein PhoQ  30.19 
 
 
468 aa  147  6e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3818  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 
454 aa  146  6e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00854299  decreased coverage  0.0034747 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2856  sensor protein PhoQ  30.19 
 
 
484 aa  146  8.000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3909  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 
454 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000571443  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3007  sensor histidine kinase  29 
 
 
445 aa  145  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1607  sensor protein PhoQ  29.81 
 
 
484 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 
439 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0848259  normal  0.136137 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1957  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.09 
 
 
443 aa  143  8e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0083917  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3157  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.03 
 
 
447 aa  142  9e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0710965 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4648  sensor histidine kinase  28.45 
 
 
454 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3380  sensor histidine kinase  27.87 
 
 
439 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.625161  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>