More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1404 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 471 aa  934    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1409  ATPase domain-containing protein  97.45 
 
 		 471 aa  892    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.137041 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4990  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  83.33 
 
 		 472 aa  759    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000206747 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4170  histidine kinase  76.3 
 
 		 490 aa  637    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1684  histidine kinase  97.66 
 
 		 471 aa  893    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.091412  normal  0.96111 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4435  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  76.38 
 
 		 490 aa  628  1e-179  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.713299 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.95 
 
 		 463 aa  451  1e-125  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3068  putative two-component sensor histidine kinase  51.31 
 
 		 458 aa  440  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.691387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0435  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.75 
 
 		 481 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.711544 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1831  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  49.78 
 
 		 458 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0398387  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1434  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  49.56 
 
 		 465 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1188  Signal transduction histidine kinase  49.56 
 
 		 465 aa  414  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3453  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  49.89 
 
 		 464 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2127  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.91 
 
 		 463 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  49.11 
 
 		 465 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.374305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3177  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.12 
 
 		 475 aa  375  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0501501 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.34 
 
 		 459 aa  352  1e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0895  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.31 
 
 		 461 aa  284  3.0000000000000004e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0918  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.48 
 
 		 467 aa  277  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.123629 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1067  histidine kinase  38.27 
 
 		 467 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1359  two component sensor kinase  39.16 
 
 		 471 aa  271  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0604  sensor histidine kinase  40.27 
 
 		 436 aa  264  2e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0605  sensor histidine kinase  40.32 
 
 		 432 aa  261  1e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.972928  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3895  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.52 
 
 		 460 aa  262  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.378674  normal  0.194122 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0429  sensor histidine kinase FeuQ  35.24 
 
 		 473 aa  256  7e-67  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2673  histidine kinase  39.37 
 
 		 436 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0937  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.26 
 
 		 461 aa  253  5.000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.159129 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.19 
 
 		 461 aa  244  3e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02659  hypothetical protein  33.84 
 
 		 449 aa  242  1e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003785  signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 441 aa  241  2.9999999999999997e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0077957  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0631  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.72 
 
 		 459 aa  233  6e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0181536  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2616  histidine kinase  35.1 
 
 		 474 aa  232  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.99 
 
 		 456 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5129  putative two-component sensor histidine kinase  35.23 
 
 		 448 aa  225  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 		 445 aa  224  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0398387  normal  0.0265162 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0802  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 		 463 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00906644 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5126  two component sensor kinase  35.5 
 
 		 456 aa  219  6e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3430  histidine kinase  38.72 
 
 		 464 aa  217  4e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5100  histidine kinase  35.52 
 
 		 482 aa  215  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.368053  normal  0.11003 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4082  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.38 
 
 		 455 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.154716 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3059  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 453 aa  213  7e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1245  sensor histidine kinase  32.01 
 
 		 462 aa  212  1e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000271676  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02837  two-component system sensor protein required for AvrXa21activity H2 (raxH2)  32.62 
 
 		 456 aa  210  5e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.69 
 
 		 446 aa  209  6e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.741916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.69 
 
 		 446 aa  209  7e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0175865 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3443  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.7 
 
 		 478 aa  207  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131083  normal  0.673106 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2065  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 		 467 aa  207  5e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1038  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 		 474 aa  202  7e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.596315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1978  signal transduction protein, histidine kinase  32.16 
 
 		 444 aa  200  5e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4047  sensor histidine kinase  42.21 
 
 		 317 aa  195  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 		 475 aa  193  5e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.587392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3188  histidine kinase  35.7 
 
 		 456 aa  192  9e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10722  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2064  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.59 
 
 		 441 aa  192  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0576592 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.44 
 
 		 439 aa  192  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5572  putative two-component sensor histidine kinase  32.75 
 
 		 471 aa  190  5.999999999999999e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.118515 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1841  two-component system, sensor protein  29.65 
 
 		 482 aa  186  6e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.775188  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4325  hypothetical protein  36.73 
 
 		 411 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.36321 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1772  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.45 
 
 		 482 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.480782  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4113  ATPase domain-containing protein  36.69 
 
 		 448 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal  0.819443 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4481  histidine kinase  37.11 
 
 		 448 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.410421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0203  two component sensor kinase  32.39 
 
 		 451 aa  181  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1886  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 484 aa  179  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1948  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.62 
 
 		 439 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.014264 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29740  putative two-component sensor  31.11 
 
 		 445 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 439 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0848259  normal  0.136137 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2544  putative two-component sensor  30.7 
 
 		 444 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0961662  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6193  histidine kinase  33.41 
 
 		 452 aa  172  9e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0167  histidine kinase  38.93 
 
 		 429 aa  170  6e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3354  ribose 5-phosphate isomerase  28.09 
 
 		 456 aa  168  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000158163  normal  0.115638 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4594  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 		 460 aa  167  4e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4931  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 450 aa  166  8e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.231481 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02298  sensor histidine kinase  34.77 
 
 		 443 aa  166  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1714  sensor protein PhoQ  32.45 
 
 		 468 aa  165  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3778  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 		 462 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.49 
 
 		 439 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.98279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2856  sensor protein PhoQ  32.45 
 
 		 484 aa  164  3e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3304  sensor histidine kinase  36.23 
 
 		 466 aa  164  3e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.232472 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4111  sodium/glutamate symporter  38.51 
 
 		 369 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.381154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1607  sensor protein PhoQ  32.08 
 
 		 484 aa  164  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1131  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 442 aa  162  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3771  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 		 437 aa  160  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.429615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3684  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 455 aa  161  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.714122  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28570  sensory histidine protein kinase  36.94 
 
 		 440 aa  160  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.380534  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.11 
 
 		 439 aa  160  5e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000231827 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2975  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.8 
 
 		 460 aa  158  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.241819 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4403  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 		 454 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2696  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 		 484 aa  155  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000110077  normal  0.128468 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3876  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.15 
 
 		 441 aa  156  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000107272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3007  sensor histidine kinase  28.63 
 
 		 445 aa  155  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1996  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 		 437 aa  156  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.540244  normal  0.136551 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0582  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.12 
 
 		 445 aa  155  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.684402  normal  0.489398 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1355  Signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 		 441 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1957  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.12 
 
 		 443 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0083917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4239  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.75 
 
 		 450 aa  154  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2150  sensor protein PhoQ  32.2 
 
 		 486 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0666594  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3380  sensor histidine kinase  35.34 
 
 		 439 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.625161  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3211  sensor histidine kinase  30.43 
 
 		 439 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.608335  normal  0.379725 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 		 458 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 		 448 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 		 448 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>