More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3766 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 439 aa  849    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 459 aa  245  9.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0937  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.64 
 
 		 461 aa  244  3e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.159129 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5129  putative two-component sensor histidine kinase  36.97 
 
 		 448 aa  228  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3895  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.47 
 
 		 460 aa  226  8e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.378674  normal  0.194122 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3068  putative two-component sensor histidine kinase  36.9 
 
 		 458 aa  225  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.691387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2127  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.23 
 
 		 463 aa  219  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0604  sensor histidine kinase  34.69 
 
 		 436 aa  216  7e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3453  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.73 
 
 		 464 aa  216  8e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1831  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.47 
 
 		 458 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0398387  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_004310  BR0605  sensor histidine kinase  34.18 
 
 		 432 aa  214  2.9999999999999995e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.972928  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 		 463 aa  213  4.9999999999999996e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1188  Signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 465 aa  213  7e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0631  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.21 
 
 		 459 aa  212  7.999999999999999e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0181536  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02659  hypothetical protein  32.8 
 
 		 449 aa  211  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2673  histidine kinase  33.18 
 
 		 436 aa  211  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003785  signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 		 441 aa  211  3e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0077957  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1434  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.17 
 
 		 465 aa  210  4e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.41 
 
 		 445 aa  209  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0398387  normal  0.0265162 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0435  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 		 481 aa  209  1e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.711544 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 		 465 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.374305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3188  histidine kinase  38.8 
 
 		 456 aa  206  5e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10722  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1245  sensor histidine kinase  35.83 
 
 		 462 aa  206  1e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000271676  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1978  signal transduction protein, histidine kinase  29.72 
 
 		 444 aa  199  9e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0895  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 		 461 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0802  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.95 
 
 		 463 aa  197  5.000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00906644 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4435  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.7 
 
 		 490 aa  196  6e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.713299 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3059  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 		 453 aa  194  3e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4170  histidine kinase  38.7 
 
 		 490 aa  193  6e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.08 
 
 		 446 aa  193  6e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.741916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.08 
 
 		 446 aa  193  6e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0175865 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2616  histidine kinase  33.84 
 
 		 474 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4693  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.72 
 
 		 452 aa  190  4e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.73 
 
 		 471 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4990  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.6 
 
 		 472 aa  188  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000206747 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3177  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 		 475 aa  188  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0501501 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1684  histidine kinase  34.51 
 
 		 471 aa  187  4e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.091412  normal  0.96111 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1409  ATPase domain-containing protein  34.51 
 
 		 471 aa  186  6e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.137041 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3430  histidine kinase  37.42 
 
 		 464 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5572  putative two-component sensor histidine kinase  36.82 
 
 		 471 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.118515 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 456 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5100  histidine kinase  37.34 
 
 		 482 aa  182  7e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.368053  normal  0.11003 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 		 458 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2065  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 		 467 aa  182  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 		 475 aa  181  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.587392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4403  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.53 
 
 		 454 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3443  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 		 478 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131083  normal  0.673106 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5126  two component sensor kinase  32.11 
 
 		 456 aa  179  9e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4931  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.53 
 
 		 450 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.231481 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3778  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 		 462 aa  177  3e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0429  sensor histidine kinase FeuQ  30.09 
 
 		 473 aa  177  3e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1886  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.42 
 
 		 484 aa  176  6e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4113  ATPase domain-containing protein  35.8 
 
 		 448 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal  0.819443 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4082  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 		 455 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.154716 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4481  histidine kinase  35.56 
 
 		 448 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.410421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1359  two component sensor kinase  31.26 
 
 		 471 aa  172  9e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0582  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 		 445 aa  171  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.684402  normal  0.489398 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3157  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.04 
 
 		 447 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0710965 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0918  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 		 467 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.123629 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1067  histidine kinase  32.47 
 
 		 467 aa  171  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4047  sensor histidine kinase  42.04 
 
 		 317 aa  170  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0203  two component sensor kinase  33.26 
 
 		 451 aa  170  5e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3512  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.05 
 
 		 447 aa  169  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0621  sensor histidine kinase  29.03 
 
 		 442 aa  166  5e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6193  histidine kinase  35.92 
 
 		 452 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3304  sensor histidine kinase  33.03 
 
 		 466 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.232472 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2544  putative two-component sensor  34 
 
 		 444 aa  164  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0961662  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1948  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.45 
 
 		 439 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.014264 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0615  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.47 
 
 		 442 aa  164  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.27687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3415  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.47 
 
 		 442 aa  164  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.147478  normal  0.210462 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0614  ATPase domain-containing protein  29.72 
 
 		 442 aa  164  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.617782  normal  0.375325 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4594  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 		 460 aa  162  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.28 
 
 		 442 aa  161  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000150109  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3512  histidine kinase  28.38 
 
 		 441 aa  160  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00937623  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29 
 
 		 442 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139912  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3876  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.25 
 
 		 441 aa  160  4e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000107272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3693  histidine kinase  29 
 
 		 442 aa  160  4e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29740  putative two-component sensor  33.09 
 
 		 445 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4804  histidine kinase  31.81 
 
 		 446 aa  160  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.631947  normal  0.828013 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.45 
 
 		 439 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000231827 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1841  two-component system, sensor protein  30.73 
 
 		 482 aa  158  1e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.775188  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1038  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 		 474 aa  159  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.596315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02837  two-component system sensor protein required for AvrXa21activity H2 (raxH2)  30.79 
 
 		 456 aa  158  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3876  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 		 442 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.213045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1772  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 		 482 aa  158  2e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.480782  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0659  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 441 aa  157  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000460347  hitchhiker  0.000037431 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3750  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.54 
 
 		 442 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1355  Signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 		 441 aa  156  7e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 		 461 aa  156  8e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3007  sensor histidine kinase  29.2 
 
 		 445 aa  155  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.49 
 
 		 439 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.98279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1131  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 		 442 aa  150  4e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1659  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 		 459 aa  150  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.819337 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.73 
 
 		 439 aa  150  6e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0848259  normal  0.136137 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28570  sensory histidine protein kinase  35.01 
 
 		 440 aa  146  6e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.380534  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4345  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.58 
 
 		 454 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0442368  normal  0.692011 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4325  hypothetical protein  34.92 
 
 		 411 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.36321 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1883  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.33 
 
 		 447 aa  144  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0300234 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1957  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 		 443 aa  144  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0083917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1263  ATP-binding region, ATPase-like protein  28.51 
 
 		 474 aa  144  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000081586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>