More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4310 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_4310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
445 aa  863    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0398387  normal  0.0265162 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.18 
 
 
459 aa  272  1e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3068  putative two-component sensor histidine kinase  40.13 
 
 
458 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.691387  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1831  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.88 
 
 
458 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0398387  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1434  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.65 
 
 
465 aa  265  2e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0895  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.81 
 
 
461 aa  252  8.000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3453  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 
464 aa  252  9.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.13 
 
 
465 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.374305  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2127  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 
463 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0435  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.82 
 
 
481 aa  242  1e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.711544 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1684  histidine kinase  38.96 
 
 
471 aa  242  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.091412  normal  0.96111 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1188  Signal transduction histidine kinase  40.48 
 
 
465 aa  241  2e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1409  ATPase domain-containing protein  38.96 
 
 
471 aa  241  2e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.137041 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.53 
 
 
471 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4990  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 
472 aa  233  7.000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000206747 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3188  histidine kinase  40.13 
 
 
456 aa  230  5e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10722  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.09 
 
 
463 aa  227  3e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1038  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.36 
 
 
474 aa  225  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.596315  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3177  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.16 
 
 
475 aa  222  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0501501 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02659  hypothetical protein  32.43 
 
 
449 aa  222  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003785  signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 
441 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0077957  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0937  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 
461 aa  216  5.9999999999999996e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.159129 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1067  histidine kinase  33.77 
 
 
467 aa  216  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3430  histidine kinase  36.54 
 
 
464 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4435  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.35 
 
 
490 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.713299 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0918  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 
467 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.123629 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5129  putative two-component sensor histidine kinase  34.16 
 
 
448 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60361  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0429  sensor histidine kinase FeuQ  32.03 
 
 
473 aa  211  3e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.83 
 
 
439 aa  210  5e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3059  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 
453 aa  209  7e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3895  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.34 
 
 
460 aa  207  4e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.378674  normal  0.194122 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.55 
 
 
446 aa  205  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.741916  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.55 
 
 
446 aa  204  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0175865 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4082  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 
455 aa  205  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.154716 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2673  histidine kinase  33.79 
 
 
436 aa  203  5e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0604  sensor histidine kinase  33.11 
 
 
436 aa  202  7e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4170  histidine kinase  38.19 
 
 
490 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0605  sensor histidine kinase  34.05 
 
 
432 aa  201  3e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.972928  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0802  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.57 
 
 
463 aa  201  3e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00906644 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5100  histidine kinase  35.88 
 
 
482 aa  199  7e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.368053  normal  0.11003 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0631  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
459 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0181536  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1359  two component sensor kinase  31.45 
 
 
471 aa  196  6e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5572  putative two-component sensor histidine kinase  36.73 
 
 
471 aa  196  7e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.118515 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6193  histidine kinase  39.3 
 
 
452 aa  195  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
461 aa  195  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112663  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1245  sensor histidine kinase  32.14 
 
 
462 aa  194  3e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000271676  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4325  hypothetical protein  39.44 
 
 
411 aa  192  8e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.36321 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2064  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.85 
 
 
441 aa  192  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0576592 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1886  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 
484 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1978  signal transduction protein, histidine kinase  28.23 
 
 
444 aa  183  5.0000000000000004e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4931  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 
450 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.231481 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4403  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.47 
 
 
454 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4113  ATPase domain-containing protein  36.4 
 
 
448 aa  182  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal  0.819443 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3443  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.41 
 
 
478 aa  182  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131083  normal  0.673106 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4693  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 
452 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4047  sensor histidine kinase  39.37 
 
 
317 aa  177  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2065  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 
467 aa  176  9e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4481  histidine kinase  35.31 
 
 
448 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.410421  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 
458 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4594  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 
460 aa  168  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 
456 aa  169  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5126  two component sensor kinase  31.32 
 
 
456 aa  164  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4111  sodium/glutamate symporter  41.34 
 
 
369 aa  160  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.381154  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0582  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.6 
 
 
445 aa  157  4e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.684402  normal  0.489398 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2616  histidine kinase  32.67 
 
 
474 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.6 
 
 
442 aa  153  5e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000150109  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4804  histidine kinase  31.65 
 
 
446 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.631947  normal  0.828013 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3876  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.15 
 
 
442 aa  150  5e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.213045  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02837  two-component system sensor protein required for AvrXa21activity H2 (raxH2)  30.33 
 
 
456 aa  150  6e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3693  histidine kinase  28.7 
 
 
442 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 
442 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139912  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3750  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.93 
 
 
442 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29740  putative two-component sensor  33.25 
 
 
445 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0203  two component sensor kinase  29.82 
 
 
451 aa  147  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2936  histidine kinase  33.78 
 
 
517 aa  144  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00120898  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1841  two-component system, sensor protein  30.09 
 
 
482 aa  145  2e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.775188  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1948  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 
439 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.014264 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2544  putative two-component sensor  31.29 
 
 
444 aa  144  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0961662  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1772  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 
482 aa  143  7e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.480782  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.82 
 
 
475 aa  143  8e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.587392  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1131  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.76 
 
 
442 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3211  sensor histidine kinase  30.73 
 
 
439 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.608335  normal  0.379725 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0659  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28 
 
 
441 aa  140  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000460347  hitchhiker  0.000037431 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1957  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 
443 aa  140  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0083917  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1659  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 
459 aa  141  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.819337 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0615  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 
442 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.27687  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3415  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 
442 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.147478  normal  0.210462 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3778  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 
462 aa  140  7e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1607  sensor protein PhoQ  31.68 
 
 
484 aa  139  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2856  sensor protein PhoQ  32.06 
 
 
484 aa  139  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1263  ATP-binding region, ATPase-like protein  29.24 
 
 
474 aa  139  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000081586  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0621  sensor histidine kinase  27.25 
 
 
442 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3247  sensor histidine kinase  30.49 
 
 
469 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000098482  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1714  sensor protein PhoQ  31.68 
 
 
468 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3304  sensor histidine kinase  31.48 
 
 
466 aa  137  5e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.232472 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3876  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.08 
 
 
441 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000107272  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1865  sensor protein PhoQ  30.68 
 
 
484 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0281  sensor histidine kinase  32.57 
 
 
475 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.012454  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28570  sensory histidine protein kinase  38.26 
 
 
440 aa  135  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.380534  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2012  sensor protein PhoQ  30.94 
 
 
485 aa  135  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0783662 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>