More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3348 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1948  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  95.44 
 
 		 439 aa  770    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.014264 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  98.86 
 
 		 439 aa  845    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000231827 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  93.39 
 
 		 439 aa  733    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0848259  normal  0.136137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 439 aa  853    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.98279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3211  sensor histidine kinase  72.15 
 
 		 439 aa  580  1e-164  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.608335  normal  0.379725 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3380  sensor histidine kinase  71.23 
 
 		 439 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.625161  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3771  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  73.68 
 
 		 437 aa  565  1e-160  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.429615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2544  putative two-component sensor  66.21 
 
 		 444 aa  535  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0961662  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1996  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  65.68 
 
 		 437 aa  521  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.540244  normal  0.136551 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29740  putative two-component sensor  65.21 
 
 		 445 aa  514  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28570  sensory histidine protein kinase  61.1 
 
 		 440 aa  472  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.380534  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1355  Signal transduction histidine kinase  44.75 
 
 		 441 aa  315  9.999999999999999e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0589  histidine kinase  40.59 
 
 		 437 aa  240  4e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3693  histidine kinase  35.43 
 
 		 442 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 442 aa  239  9e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000150109  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 		 442 aa  239  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139912  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0659  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 		 441 aa  237  4e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000460347  hitchhiker  0.000037431 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3512  histidine kinase  34.73 
 
 		 441 aa  236  7e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00937623  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3876  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 442 aa  236  7e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.213045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3750  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 		 442 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0621  sensor histidine kinase  34.75 
 
 		 442 aa  234  3e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3007  sensor histidine kinase  36.47 
 
 		 445 aa  231  2e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0582  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.9 
 
 		 445 aa  230  3e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.684402  normal  0.489398 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0615  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 		 442 aa  229  6e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.27687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3415  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 		 442 aa  229  6e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.147478  normal  0.210462 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0614  ATPase domain-containing protein  34.23 
 
 		 442 aa  229  7e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.617782  normal  0.375325 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3876  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 		 441 aa  225  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000107272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3295  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 		 444 aa  219  1e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.183643  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3068  putative two-component sensor histidine kinase  33.76 
 
 		 458 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.691387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0005  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.4 
 
 		 446 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000685276  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1245  sensor histidine kinase  33.25 
 
 		 462 aa  197  3e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000271676  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0356  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 438 aa  195  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0311  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 		 454 aa  193  4e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0244  histidine kinase  34.01 
 
 		 438 aa  193  5e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000181402 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003785  signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 		 441 aa  193  5e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0077957  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1978  signal transduction protein, histidine kinase  31.47 
 
 		 444 aa  192  7e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1188  Signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 		 465 aa  192  8e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 		 459 aa  192  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5572  putative two-component sensor histidine kinase  35.76 
 
 		 471 aa  189  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.118515 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3453  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 		 464 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02659  hypothetical protein  32.1 
 
 		 449 aa  187  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1434  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 		 465 aa  187  4e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1831  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.69 
 
 		 458 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0398387  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5129  putative two-component sensor histidine kinase  34.4 
 
 		 448 aa  186  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 		 465 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.374305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0238  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 		 438 aa  184  3e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0631  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 		 459 aa  184  3e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0181536  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0240  ATPase domain-containing protein  33.18 
 
 		 438 aa  181  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000252659 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2127  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 463 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1914  histidine kinase  41.81 
 
 		 451 aa  177  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3782  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 		 438 aa  178  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4488  sensor histidine kinase  32.28 
 
 		 438 aa  177  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0238  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 438 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1886  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 		 484 aa  177  3e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0241  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.96 
 
 		 438 aa  176  6e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4693  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 		 452 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3304  sensor histidine kinase  32.67 
 
 		 466 aa  171  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.232472 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4931  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.94 
 
 		 450 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.231481 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0937  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 461 aa  171  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.159129 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0239  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 		 438 aa  171  3e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000059891 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3909  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.17 
 
 		 454 aa  171  3e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000571443  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4113  ATPase domain-containing protein  34.21 
 
 		 448 aa  170  4e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal  0.819443 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3818  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.79 
 
 		 454 aa  170  4e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00854299  decreased coverage  0.0034747 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3895  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 		 460 aa  169  9e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.378674  normal  0.194122 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3059  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.14 
 
 		 453 aa  168  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4026  ATPase domain-containing protein  38.17 
 
 		 454 aa  168  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2616  histidine kinase  32.89 
 
 		 474 aa  167  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3188  histidine kinase  33.07 
 
 		 456 aa  167  5e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10722  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6193  histidine kinase  33.85 
 
 		 452 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1684  histidine kinase  30.65 
 
 		 471 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.091412  normal  0.96111 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3853  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.37 
 
 		 454 aa  166  8e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0123  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 		 442 aa  166  9e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 		 471 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1409  ATPase domain-containing protein  30.65 
 
 		 471 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.137041 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 		 454 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0526543  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4481  histidine kinase  33.68 
 
 		 448 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.410421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1714  sensor protein PhoQ  36.64 
 
 		 468 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2856  sensor protein PhoQ  36.64 
 
 		 484 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1607  sensor protein PhoQ  36.64 
 
 		 484 aa  165  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4345  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.09 
 
 		 454 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0442368  normal  0.692011 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5100  histidine kinase  36.82 
 
 		 482 aa  164  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.368053  normal  0.11003 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4648  sensor histidine kinase  36.46 
 
 		 454 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 		 463 aa  163  6e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2841  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 		 445 aa  163  6e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0895  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 		 461 aa  163  6e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4141  histidine kinase  37.09 
 
 		 454 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4239  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 		 450 aa  162  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 439 aa  161  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 458 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 		 456 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3381  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 		 466 aa  160  6e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00620745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1131  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 		 442 aa  159  7e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0167  histidine kinase  38.87 
 
 		 429 aa  159  9e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0281  sensor histidine kinase  30.56 
 
 		 475 aa  157  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.012454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5126  two component sensor kinase  31.13 
 
 		 456 aa  157  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3430  histidine kinase  32.73 
 
 		 464 aa  156  6e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02837  two-component system sensor protein required for AvrXa21activity H2 (raxH2)  36.04 
 
 		 456 aa  156  6e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4990  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.59 
 
 		 472 aa  155  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000206747 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 475 aa  155  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.587392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2673  histidine kinase  33.42 
 
 		 436 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>