More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3059 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3059  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
453 aa  882    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0631  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  59.28 
 
 
459 aa  457  1e-127  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0181536  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.05 
 
 
459 aa  279  6e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3068  putative two-component sensor histidine kinase  36.91 
 
 
458 aa  266  5e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.691387  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1434  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.6 
 
 
465 aa  262  8.999999999999999e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1831  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.74 
 
 
458 aa  255  9e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0398387  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 
463 aa  251  2e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.16 
 
 
465 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.374305  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3453  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.12 
 
 
464 aa  251  3e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0435  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 
481 aa  249  6e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.711544 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003785  signal transduction histidine kinase  34.77 
 
 
441 aa  249  9e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0077957  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2127  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 
463 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1245  sensor histidine kinase  36.78 
 
 
462 aa  242  1e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000271676  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02659  hypothetical protein  34.1 
 
 
449 aa  239  5.999999999999999e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1188  Signal transduction histidine kinase  37.38 
 
 
465 aa  239  8e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3177  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.42 
 
 
475 aa  235  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0501501 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4990  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.39 
 
 
472 aa  228  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000206747 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1978  signal transduction protein, histidine kinase  31.75 
 
 
444 aa  228  2e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 
471 aa  225  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1409  ATPase domain-containing protein  36.42 
 
 
471 aa  224  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.137041 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1684  histidine kinase  36.42 
 
 
471 aa  224  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.091412  normal  0.96111 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 
446 aa  223  6e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.741916  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 
446 aa  223  7e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0175865 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3188  histidine kinase  37.84 
 
 
456 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10722  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3895  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 
460 aa  218  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.378674  normal  0.194122 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4435  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.04 
 
 
490 aa  217  4e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.713299 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3443  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.39 
 
 
478 aa  216  7e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131083  normal  0.673106 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 
445 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0398387  normal  0.0265162 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1886  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 
484 aa  211  3e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5100  histidine kinase  37.47 
 
 
482 aa  211  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.368053  normal  0.11003 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2065  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.88 
 
 
467 aa  210  4e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0802  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 
463 aa  210  5e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00906644 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4170  histidine kinase  38.58 
 
 
490 aa  207  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0895  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
461 aa  203  5e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5129  putative two-component sensor histidine kinase  33.7 
 
 
448 aa  202  7e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60361  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4693  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 
452 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0937  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 
461 aa  201  1.9999999999999998e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.159129 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4113  ATPase domain-containing protein  39.11 
 
 
448 aa  200  5e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal  0.819443 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.64 
 
 
458 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 
439 aa  196  8.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4481  histidine kinase  38.32 
 
 
448 aa  196  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.410421  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4403  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 
454 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6193  histidine kinase  36.42 
 
 
452 aa  194  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4594  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.08 
 
 
460 aa  189  7e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5572  putative two-component sensor histidine kinase  33.69 
 
 
471 aa  189  9e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.118515 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4931  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 
450 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.231481 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5126  two component sensor kinase  32.16 
 
 
456 aa  186  5e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0605  sensor histidine kinase  32.56 
 
 
432 aa  185  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.972928  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0604  sensor histidine kinase  32.72 
 
 
436 aa  186  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1359  two component sensor kinase  32.56 
 
 
471 aa  185  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3430  histidine kinase  35.76 
 
 
464 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1067  histidine kinase  32.17 
 
 
467 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0429  sensor histidine kinase FeuQ  32.18 
 
 
473 aa  183  6e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0918  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.81 
 
 
467 aa  183  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.123629 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2673  histidine kinase  31.07 
 
 
436 aa  182  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4325  hypothetical protein  37.5 
 
 
411 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.36321 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1996  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.87 
 
 
437 aa  181  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.540244  normal  0.136551 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28570  sensory histidine protein kinase  35.75 
 
 
440 aa  181  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.380534  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02837  two-component system sensor protein required for AvrXa21activity H2 (raxH2)  31.44 
 
 
456 aa  179  5.999999999999999e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2544  putative two-component sensor  34.92 
 
 
444 aa  176  8e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0961662  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0203  two component sensor kinase  30.43 
 
 
451 aa  176  9e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1948  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.14 
 
 
439 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.014264 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4082  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 
455 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.154716 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.04 
 
 
456 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2616  histidine kinase  29.65 
 
 
474 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4047  sensor histidine kinase  40.88 
 
 
317 aa  172  9e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 
461 aa  170  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112663  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 
475 aa  170  6e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.587392  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 
439 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0848259  normal  0.136137 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 
439 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000231827 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0582  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 
445 aa  168  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.684402  normal  0.489398 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2064  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 
441 aa  167  4e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0576592 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3354  ribose 5-phosphate isomerase  28.73 
 
 
456 aa  166  6.9999999999999995e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000158163  normal  0.115638 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.42 
 
 
439 aa  166  9e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.98279  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1038  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 
474 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.596315  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29740  putative two-component sensor  33.1 
 
 
445 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4345  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.31 
 
 
454 aa  162  9e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0442368  normal  0.692011 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3007  sensor histidine kinase  32.23 
 
 
445 aa  160  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2504  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 
443 aa  160  3e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1841  two-component system, sensor protein  30.13 
 
 
482 aa  159  7e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.775188  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3304  sensor histidine kinase  32.1 
 
 
466 aa  159  9e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.232472 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1772  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 
482 aa  157  3e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.480782  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0621  sensor histidine kinase  29.91 
 
 
442 aa  157  4e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3876  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 
442 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.213045  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3211  sensor histidine kinase  31.58 
 
 
439 aa  156  7e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.608335  normal  0.379725 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3778  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.95 
 
 
462 aa  156  7e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3693  histidine kinase  29.93 
 
 
442 aa  156  8e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2936  histidine kinase  34.56 
 
 
517 aa  156  9e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00120898  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 
442 aa  155  9e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000150109  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0614  ATPase domain-containing protein  30 
 
 
442 aa  155  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.617782  normal  0.375325 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4239  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 
450 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.93 
 
 
442 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139912  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3750  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 
442 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0615  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.78 
 
 
442 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.27687  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3415  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.78 
 
 
442 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.147478  normal  0.210462 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3157  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 
447 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0710965 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.22 
 
 
448 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3295  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 
444 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.183643  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1883  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 
447 aa  154  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0300234 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0281  sensor histidine kinase  27.78 
 
 
475 aa  152  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.012454  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>