More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4047 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4047  sensor histidine kinase  100 
 
 		 317 aa  617  1e-176  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5129  putative two-component sensor histidine kinase  56.09 
 
 		 448 aa  321  9.999999999999999e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.44 
 
 		 459 aa  274  2.0000000000000002e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1434  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.93 
 
 		 465 aa  242  5e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1831  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.96 
 
 		 458 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0398387  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3068  putative two-component sensor histidine kinase  41.12 
 
 		 458 aa  232  8.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.691387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2127  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 463 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.75 
 
 		 465 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.374305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3453  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.77 
 
 		 464 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1188  Signal transduction histidine kinase  42.99 
 
 		 465 aa  225  6e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3177  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.26 
 
 		 475 aa  219  7e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0501501 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0937  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  47.31 
 
 		 461 aa  215  8e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.159129 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4990  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.76 
 
 		 472 aa  211  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000206747 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0435  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.24 
 
 		 481 aa  209  5e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.711544 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003785  signal transduction histidine kinase  34.82 
 
 		 441 aa  204  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0077957  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2065  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.64 
 
 		 467 aa  204  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3895  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.83 
 
 		 460 aa  204  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.378674  normal  0.194122 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2673  histidine kinase  38.1 
 
 		 436 aa  201  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0605  sensor histidine kinase  38.44 
 
 		 432 aa  199  3e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.972928  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0604  sensor histidine kinase  38.44 
 
 		 436 aa  199  5e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02659  hypothetical protein  34.19 
 
 		 449 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1245  sensor histidine kinase  35.74 
 
 		 462 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000271676  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1684  histidine kinase  42.76 
 
 		 471 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.091412  normal  0.96111 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1409  ATPase domain-containing protein  42.76 
 
 		 471 aa  197  3e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.137041 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.21 
 
 		 471 aa  197  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0918  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.68 
 
 		 467 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.123629 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4435  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.75 
 
 		 490 aa  194  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.713299 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1359  two component sensor kinase  39.53 
 
 		 471 aa  193  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0802  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.26 
 
 		 463 aa  192  5e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00906644 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1067  histidine kinase  40.34 
 
 		 467 aa  192  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5100  histidine kinase  42.32 
 
 		 482 aa  189  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.368053  normal  0.11003 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4170  histidine kinase  41.25 
 
 		 490 aa  188  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 		 463 aa  187  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3430  histidine kinase  43.38 
 
 		 464 aa  183  3e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2064  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.1 
 
 		 441 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0576592 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0895  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.31 
 
 		 461 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4082  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.53 
 
 		 455 aa  179  4e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.154716 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3188  histidine kinase  42.9 
 
 		 456 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10722  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2841  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 		 445 aa  178  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3443  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.11 
 
 		 478 aa  176  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131083  normal  0.673106 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0429  sensor histidine kinase FeuQ  34.12 
 
 		 473 aa  175  9e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4481  histidine kinase  41.83 
 
 		 448 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.410421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1978  signal transduction protein, histidine kinase  30.57 
 
 		 444 aa  174  1.9999999999999998e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4113  ATPase domain-containing protein  41.5 
 
 		 448 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal  0.819443 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.04 
 
 		 439 aa  173  3.9999999999999995e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4931  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.96 
 
 		 450 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.231481 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.37 
 
 		 445 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0398387  normal  0.0265162 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4403  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.68 
 
 		 454 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.29 
 
 		 458 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4594  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.96 
 
 		 460 aa  169  6e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3304  sensor histidine kinase  36.72 
 
 		 466 aa  169  8e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.232472 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.48 
 
 		 461 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3211  sensor histidine kinase  39.14 
 
 		 439 aa  166  5e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.608335  normal  0.379725 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3778  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.91 
 
 		 462 aa  165  6.9999999999999995e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1886  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.81 
 
 		 484 aa  165  9e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6193  histidine kinase  41.92 
 
 		 452 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3380  sensor histidine kinase  38.36 
 
 		 439 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.625161  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3059  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.88 
 
 		 453 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1038  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.41 
 
 		 474 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.596315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.57 
 
 		 446 aa  161  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0175865 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.57 
 
 		 446 aa  161  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.741916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0631  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.43 
 
 		 459 aa  159  4e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0181536  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1948  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.26 
 
 		 439 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.014264 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4693  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.88 
 
 		 452 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.59 
 
 		 439 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0848259  normal  0.136137 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2696  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 		 484 aa  156  4e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000110077  normal  0.128468 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3295  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 		 444 aa  156  4e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.183643  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2544  putative two-component sensor  39.54 
 
 		 444 aa  155  8e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0961662  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0614  ATPase domain-containing protein  35.91 
 
 		 442 aa  155  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.617782  normal  0.375325 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29740  putative two-component sensor  38.55 
 
 		 445 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.59 
 
 		 439 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.98279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 		 442 aa  154  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000150109  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28570  sensory histidine protein kinase  36.93 
 
 		 440 aa  153  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.380534  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2936  histidine kinase  34.2 
 
 		 517 aa  152  8e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00120898  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.26 
 
 		 439 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000231827 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3007  sensor histidine kinase  34.64 
 
 		 445 aa  151  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3693  histidine kinase  35.22 
 
 		 442 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 		 442 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139912  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0621  sensor histidine kinase  36 
 
 		 442 aa  150  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5572  putative two-component sensor histidine kinase  40.94 
 
 		 471 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.118515 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0615  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 		 442 aa  150  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.27687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3415  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 		 442 aa  151  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.147478  normal  0.210462 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02298  sensor histidine kinase  31.68 
 
 		 443 aa  150  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0659  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 		 441 aa  150  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000460347  hitchhiker  0.000037431 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3876  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 		 442 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.213045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3750  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 		 442 aa  149  4e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3876  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 		 441 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000107272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0582  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 		 445 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.684402  normal  0.489398 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2616  histidine kinase  35.74 
 
 		 474 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1131  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 		 442 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3247  sensor histidine kinase  31.6 
 
 		 469 aa  147  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000098482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0167  histidine kinase  37.21 
 
 		 429 aa  146  5e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 		 454 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0526543  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3853  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 		 454 aa  145  9e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4345  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 		 454 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0442368  normal  0.692011 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1263  ATP-binding region, ATPase-like protein  31.29 
 
 		 474 aa  144  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000081586  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1841  two-component system, sensor protein  32.29 
 
 		 482 aa  144  2e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.775188  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1957  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.52 
 
 		 443 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0083917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4325  hypothetical protein  40.61 
 
 		 411 aa  142  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.36321 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1772  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 482 aa  142  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.480782  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>