More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3895 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3895  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 460 aa  920    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.378674  normal  0.194122 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.53 
 
 		 459 aa  360  2e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0937  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.73 
 
 		 461 aa  331  2e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.159129 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0435  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 		 481 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.711544 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3453  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.35 
 
 		 464 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1831  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.13 
 
 		 458 aa  286  5e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0398387  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2127  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.35 
 
 		 463 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3068  putative two-component sensor histidine kinase  39.07 
 
 		 458 aa  277  3e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.691387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1434  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.7 
 
 		 465 aa  276  7e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.35 
 
 		 463 aa  273  6e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.66 
 
 		 465 aa  272  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.374305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1188  Signal transduction histidine kinase  41.16 
 
 		 465 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4990  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.39 
 
 		 472 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000206747 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3177  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.32 
 
 		 475 aa  267  2.9999999999999995e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0501501 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1684  histidine kinase  39.52 
 
 		 471 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.091412  normal  0.96111 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1409  ATPase domain-containing protein  39.52 
 
 		 471 aa  266  7e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.137041 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.31 
 
 		 471 aa  264  3e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003785  signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 		 441 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0077957  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0895  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 		 461 aa  254  3e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3430  histidine kinase  40.04 
 
 		 464 aa  248  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5100  histidine kinase  40.76 
 
 		 482 aa  246  8e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.368053  normal  0.11003 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02659  hypothetical protein  33.04 
 
 		 449 aa  246  8e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4082  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.78 
 
 		 455 aa  238  1e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.154716 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4435  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.14 
 
 		 490 aa  238  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.713299 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2673  histidine kinase  36.55 
 
 		 436 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4170  histidine kinase  39.68 
 
 		 490 aa  234  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0604  sensor histidine kinase  35.2 
 
 		 436 aa  233  5e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1245  sensor histidine kinase  35.64 
 
 		 462 aa  232  1e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000271676  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0605  sensor histidine kinase  35.29 
 
 		 432 aa  231  2e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.972928  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1067  histidine kinase  34.48 
 
 		 467 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0918  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 467 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.123629 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1359  two component sensor kinase  34.55 
 
 		 471 aa  228  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0802  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 		 463 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00906644 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5129  putative two-component sensor histidine kinase  35.59 
 
 		 448 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1978  signal transduction protein, histidine kinase  30.41 
 
 		 444 aa  218  1e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.21 
 
 		 439 aa  216  9e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 		 461 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3443  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.99 
 
 		 478 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131083  normal  0.673106 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3188  histidine kinase  38.44 
 
 		 456 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10722  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 		 446 aa  213  5.999999999999999e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.741916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 		 446 aa  213  5.999999999999999e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0175865 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0429  sensor histidine kinase FeuQ  31.1 
 
 		 473 aa  211  3e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0631  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 		 459 aa  206  5e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0181536  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3059  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.88 
 
 		 453 aa  206  7e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2064  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.74 
 
 		 441 aa  205  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0576592 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1886  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 		 484 aa  204  3e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2065  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 		 467 aa  202  7e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.34 
 
 		 445 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0398387  normal  0.0265162 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4047  sensor histidine kinase  41.83 
 
 		 317 aa  199  6e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1038  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 		 474 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.596315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1948  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 		 439 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.014264 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6193  histidine kinase  34.77 
 
 		 452 aa  183  7e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4113  ATPase domain-containing protein  36.29 
 
 		 448 aa  181  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal  0.819443 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29740  putative two-component sensor  33.51 
 
 		 445 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5572  putative two-component sensor histidine kinase  34.8 
 
 		 471 aa  179  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.118515 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4481  histidine kinase  35.53 
 
 		 448 aa  177  4e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.410421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2544  putative two-component sensor  33.08 
 
 		 444 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0961662  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4325  hypothetical protein  34.08 
 
 		 411 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.36321 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0167  histidine kinase  39.45 
 
 		 429 aa  171  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3876  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 		 442 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.213045  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2616  histidine kinase  30.89 
 
 		 474 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3750  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 		 442 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.24 
 
 		 456 aa  170  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 458 aa  170  6e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 		 442 aa  169  7e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139912  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4403  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 		 454 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3693  histidine kinase  31.13 
 
 		 442 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.2 
 
 		 439 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0848259  normal  0.136137 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0582  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.14 
 
 		 445 aa  167  4e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.684402  normal  0.489398 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4931  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 450 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.231481 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2504  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 		 443 aa  166  5.9999999999999996e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1996  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 		 437 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.540244  normal  0.136551 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4693  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 		 452 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28570  sensory histidine protein kinase  31.94 
 
 		 440 aa  165  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.380534  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3354  ribose 5-phosphate isomerase  28.76 
 
 		 456 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000158163  normal  0.115638 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3778  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.48 
 
 		 462 aa  164  4.0000000000000004e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.72 
 
 		 442 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000150109  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1607  sensor protein PhoQ  35.74 
 
 		 484 aa  162  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3512  histidine kinase  30.87 
 
 		 441 aa  162  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00937623  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4111  sodium/glutamate symporter  38.17 
 
 		 369 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.381154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1714  sensor protein PhoQ  35.74 
 
 		 468 aa  161  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02298  sensor histidine kinase  31.46 
 
 		 443 aa  161  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.2 
 
 		 439 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.98279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2856  sensor protein PhoQ  35.74 
 
 		 484 aa  161  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1355  Signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 		 441 aa  161  3e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3415  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 		 442 aa  160  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.147478  normal  0.210462 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2502  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 		 449 aa  161  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0615  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 		 442 aa  160  4e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.27687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0614  ATPase domain-containing protein  30.34 
 
 		 442 aa  160  4e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.617782  normal  0.375325 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.2 
 
 		 439 aa  160  6e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000231827 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5126  two component sensor kinase  29.76 
 
 		 456 aa  159  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2349  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 		 449 aa  159  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000892956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2012  sensor protein PhoQ  36.23 
 
 		 485 aa  159  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0783662 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 		 475 aa  159  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.587392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 		 448 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2495  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 		 449 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.796582  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1849  histidine kinase  33.98 
 
 		 449 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00571096  hitchhiker  0.00108599 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2615  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 		 449 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0121943 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0621  sensor histidine kinase  30.34 
 
 		 442 aa  157  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4594  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 		 460 aa  157  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>