More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3007 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0614  ATPase domain-containing protein  71.27 
 
 		 442 aa  647    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.617782  normal  0.375325 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  73.76 
 
 		 442 aa  661    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000150109  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0621  sensor histidine kinase  72.44 
 
 		 442 aa  653    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  73.3 
 
 		 442 aa  660    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139912  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3007  sensor histidine kinase  100 
 
 		 445 aa  903    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3693  histidine kinase  73.08 
 
 		 442 aa  658    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0615  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  71.04 
 
 		 442 aa  646    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.27687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3750  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  73.08 
 
 		 442 aa  657    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3415  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  71.04 
 
 		 442 aa  647    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.147478  normal  0.210462 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3876  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  73.08 
 
 		 442 aa  658    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.213045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3876  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  68.25 
 
 		 441 aa  627  1e-178  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000107272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0582  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  67.57 
 
 		 445 aa  621  1e-177  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.684402  normal  0.489398 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0659  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  68.93 
 
 		 441 aa  624  1e-177  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000460347  hitchhiker  0.000037431 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3512  histidine kinase  66.89 
 
 		 441 aa  623  1e-177  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00937623  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3295  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  67.73 
 
 		 444 aa  610  1e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.183643  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2544  putative two-component sensor  35.03 
 
 		 444 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0961662  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1948  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.14 
 
 		 439 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.014264 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29740  putative two-component sensor  35.38 
 
 		 445 aa  220  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3211  sensor histidine kinase  34.91 
 
 		 439 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.608335  normal  0.379725 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3380  sensor histidine kinase  35.2 
 
 		 439 aa  209  7e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.625161  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.19 
 
 		 439 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.98279  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 439 aa  206  9e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000231827 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0589  histidine kinase  34.44 
 
 		 437 aa  203  4e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 		 439 aa  203  6e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0848259  normal  0.136137 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28570  sensory histidine protein kinase  35.17 
 
 		 440 aa  202  7e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.380534  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0005  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 		 446 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000685276  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3771  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.36 
 
 		 437 aa  189  9e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.429615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 		 459 aa  178  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1914  histidine kinase  33.96 
 
 		 451 aa  177  4e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1355  Signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 		 441 aa  176  6e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003785  signal transduction histidine kinase  30.42 
 
 		 441 aa  174  3.9999999999999995e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0077957  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0937  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 		 461 aa  171  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.159129 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3188  histidine kinase  30.25 
 
 		 456 aa  171  3e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10722  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1996  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 		 437 aa  171  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.540244  normal  0.136551 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0240  ATPase domain-containing protein  31.01 
 
 		 438 aa  169  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000252659 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0123  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 		 442 aa  169  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0356  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.62 
 
 		 438 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02659  hypothetical protein  28.63 
 
 		 449 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2127  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 		 463 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0239  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.11 
 
 		 438 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000059891 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3782  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 		 438 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0244  histidine kinase  29.78 
 
 		 438 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000181402 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4481  histidine kinase  30.95 
 
 		 448 aa  161  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.410421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4113  ATPase domain-containing protein  32.11 
 
 		 448 aa  161  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal  0.819443 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3453  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 		 464 aa  161  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0631  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 		 459 aa  160  3e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0181536  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4488  sensor histidine kinase  30.6 
 
 		 438 aa  158  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0238  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.93 
 
 		 438 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3068  putative two-component sensor histidine kinase  30.92 
 
 		 458 aa  157  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.691387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1978  signal transduction protein, histidine kinase  30.69 
 
 		 444 aa  157  4e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3304  sensor histidine kinase  38.93 
 
 		 466 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.232472 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1434  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 		 465 aa  156  6e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0241  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 		 438 aa  156  7e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0238  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 		 438 aa  156  8e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.59 
 
 		 465 aa  156  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.374305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5572  putative two-component sensor histidine kinase  31.89 
 
 		 471 aa  156  9e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.118515 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5129  putative two-component sensor histidine kinase  27.7 
 
 		 448 aa  155  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 		 475 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.587392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02837  two-component system sensor protein required for AvrXa21activity H2 (raxH2)  30.95 
 
 		 456 aa  153  5.9999999999999996e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1886  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 484 aa  151  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0895  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.02 
 
 		 461 aa  151  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 		 471 aa  150  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1188  Signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 		 465 aa  149  9e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1831  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 		 458 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0398387  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4594  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 		 460 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3247  sensor histidine kinase  35.62 
 
 		 469 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000098482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0311  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 		 454 aa  148  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1409  ATPase domain-containing protein  27.11 
 
 		 471 aa  147  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.137041 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1245  sensor histidine kinase  28.54 
 
 		 462 aa  147  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000271676  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1684  histidine kinase  27.11 
 
 		 471 aa  147  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.091412  normal  0.96111 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1841  two-component system, sensor protein  32.52 
 
 		 482 aa  147  3e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.775188  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.23 
 
 		 439 aa  147  4.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4990  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 472 aa  146  6e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000206747 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1772  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 		 482 aa  145  1e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.480782  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3895  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.32 
 
 		 460 aa  144  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.378674  normal  0.194122 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3059  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 		 453 aa  144  4e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4648  sensor histidine kinase  28.97 
 
 		 454 aa  143  7e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4239  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 		 450 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2936  histidine kinase  33.94 
 
 		 517 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00120898  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0605  sensor histidine kinase  30.26 
 
 		 432 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.972928  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0604  sensor histidine kinase  30.26 
 
 		 436 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4047  sensor histidine kinase  34.64 
 
 		 317 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5100  histidine kinase  31.03 
 
 		 482 aa  141  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.368053  normal  0.11003 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3381  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 		 466 aa  140  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00620745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1131  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 		 442 aa  140  3e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1359  two component sensor kinase  32.91 
 
 		 471 aa  140  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1263  ATP-binding region, ATPase-like protein  33.57 
 
 		 474 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000081586  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4345  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27 
 
 		 454 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0442368  normal  0.692011 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0203  two component sensor kinase  30.3 
 
 		 451 aa  140  6e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.17 
 
 		 454 aa  140  6e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0526543  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 		 463 aa  140  6e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4931  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.25 
 
 		 450 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.231481 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4435  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 		 490 aa  139  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.713299 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4141  histidine kinase  27.17 
 
 		 454 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3818  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 		 454 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00854299  decreased coverage  0.0034747 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3909  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 		 454 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000571443  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3853  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 		 454 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4170  histidine kinase  34.44 
 
 		 490 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3778  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.8 
 
 		 462 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4693  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 		 452 aa  132  9e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>