More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3211 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3380  sensor histidine kinase  96.36 
 
 
439 aa  793    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.625161  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3211  sensor histidine kinase  100 
 
 
439 aa  871    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.608335  normal  0.379725 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1948  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  72.15 
 
 
439 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.014264 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3771  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  75.29 
 
 
437 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.429615  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  72.15 
 
 
439 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.98279  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  71.92 
 
 
439 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000231827 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  71.69 
 
 
439 aa  559  1e-158  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0848259  normal  0.136137 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2544  putative two-component sensor  63.99 
 
 
444 aa  504  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0961662  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1996  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  64.07 
 
 
437 aa  495  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.540244  normal  0.136551 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29740  putative two-component sensor  64.14 
 
 
445 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28570  sensory histidine protein kinase  61.1 
 
 
440 aa  466  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.380534  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1355  Signal transduction histidine kinase  43.22 
 
 
441 aa  319  7e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3512  histidine kinase  34.66 
 
 
441 aa  238  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00937623  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 
442 aa  231  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000150109  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3693  histidine kinase  35.03 
 
 
442 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.03 
 
 
442 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139912  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0589  histidine kinase  39.6 
 
 
437 aa  230  4e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0614  ATPase domain-containing protein  35.07 
 
 
442 aa  229  6e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.617782  normal  0.375325 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3876  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 
442 aa  229  7e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.213045  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0615  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.31 
 
 
442 aa  228  1e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.27687  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3415  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.07 
 
 
442 aa  228  1e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.147478  normal  0.210462 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3750  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.18 
 
 
442 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0659  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 
441 aa  228  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000460347  hitchhiker  0.000037431 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0621  sensor histidine kinase  34.69 
 
 
442 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3007  sensor histidine kinase  35.04 
 
 
445 aa  226  8e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3876  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 
441 aa  225  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000107272  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0582  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.14 
 
 
445 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.684402  normal  0.489398 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3295  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 
444 aa  209  6e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.183643  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0005  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.93 
 
 
446 aa  196  5.000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000685276  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1245  sensor histidine kinase  35.08 
 
 
462 aa  189  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000271676  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0311  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.55 
 
 
454 aa  186  8e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003785  signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 
441 aa  186  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0077957  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5572  putative two-component sensor histidine kinase  34.98 
 
 
471 aa  182  7e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.118515 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5129  putative two-component sensor histidine kinase  34.77 
 
 
448 aa  182  8.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60361  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0356  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 
438 aa  182  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02659  hypothetical protein  31.11 
 
 
449 aa  181  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4488  sensor histidine kinase  31.6 
 
 
438 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1978  signal transduction protein, histidine kinase  31.51 
 
 
444 aa  181  2.9999999999999997e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0240  ATPase domain-containing protein  33.11 
 
 
438 aa  180  4e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000252659 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0244  histidine kinase  32.27 
 
 
438 aa  179  8e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000181402 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4113  ATPase domain-containing protein  36.39 
 
 
448 aa  179  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal  0.819443 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3453  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 
464 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1886  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.89 
 
 
484 aa  177  4e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4693  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.41 
 
 
452 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2127  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 
463 aa  176  8e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0238  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.89 
 
 
438 aa  176  9e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1831  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.07 
 
 
458 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0398387  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3068  putative two-component sensor histidine kinase  31.85 
 
 
458 aa  176  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.691387  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3782  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
438 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4481  histidine kinase  35.6 
 
 
448 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.410421  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1434  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 
465 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0238  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 
438 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 
459 aa  174  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1914  histidine kinase  41.09 
 
 
451 aa  173  5e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 
465 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.374305  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0937  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 
461 aa  172  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.159129 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0241  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 
438 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5100  histidine kinase  35.01 
 
 
482 aa  170  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.368053  normal  0.11003 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0239  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 
438 aa  170  5e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000059891 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4047  sensor histidine kinase  40.66 
 
 
317 aa  169  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1188  Signal transduction histidine kinase  32.9 
 
 
465 aa  168  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0167  histidine kinase  38.87 
 
 
429 aa  168  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3430  histidine kinase  33.68 
 
 
464 aa  167  4e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4082  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 
455 aa  166  8e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.154716 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3304  sensor histidine kinase  38.4 
 
 
466 aa  164  3e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.232472 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4931  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 
450 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.231481 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4594  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
460 aa  162  9e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 
458 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3188  histidine kinase  31.32 
 
 
456 aa  161  3e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10722  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 
471 aa  160  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 
456 aa  160  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1684  histidine kinase  29.87 
 
 
471 aa  159  9e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.091412  normal  0.96111 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1409  ATPase domain-containing protein  29.87 
 
 
471 aa  159  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.137041 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2841  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.98 
 
 
445 aa  159  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4403  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 
454 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0631  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 
459 aa  157  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0181536  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6193  histidine kinase  32.8 
 
 
452 aa  157  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2616  histidine kinase  31.73 
 
 
474 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3909  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.19 
 
 
454 aa  156  8e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000571443  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3512  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 
447 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.76 
 
 
463 aa  154  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4648  sensor histidine kinase  29.94 
 
 
454 aa  154  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3443  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 
478 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131083  normal  0.673106 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3059  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 
453 aa  155  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3381  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 
466 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00620745  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3157  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 
447 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0710965 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3818  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 
454 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00854299  decreased coverage  0.0034747 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1714  sensor protein PhoQ  35.11 
 
 
468 aa  153  5.9999999999999996e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3895  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 
460 aa  152  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.378674  normal  0.194122 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0203  two component sensor kinase  30.79 
 
 
451 aa  152  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2856  sensor protein PhoQ  34.73 
 
 
484 aa  151  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0605  sensor histidine kinase  35.88 
 
 
432 aa  151  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.972928  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1841  two-component system, sensor protein  35.87 
 
 
482 aa  151  2e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.775188  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0123  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.84 
 
 
442 aa  152  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0604  sensor histidine kinase  35.88 
 
 
436 aa  150  3e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4239  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 
450 aa  150  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4026  ATPase domain-containing protein  35.27 
 
 
454 aa  150  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02837  two-component system sensor protein required for AvrXa21activity H2 (raxH2)  30.39 
 
 
456 aa  150  4e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1772  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 
482 aa  150  5e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.480782  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 
454 aa  150  5e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0526543  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>