More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1886 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1886  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 484 aa  944    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4931  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  62.58 
 
 		 450 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.231481 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4693  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  64.49 
 
 		 452 aa  498  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5572  putative two-component sensor histidine kinase  59.28 
 
 		 471 aa  485  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.118515 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4403  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  65.09 
 
 		 454 aa  485  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  62.72 
 
 		 458 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6193  histidine kinase  47.54 
 
 		 452 aa  332  8e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4481  histidine kinase  39.19 
 
 		 448 aa  249  8e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.410421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4113  ATPase domain-containing protein  38.96 
 
 		 448 aa  248  2e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal  0.819443 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3512  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.33 
 
 		 447 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3157  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 447 aa  240  5e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0710965 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4594  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.63 
 
 		 460 aa  237  4e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1659  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.95 
 
 		 459 aa  235  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.819337 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1883  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.44 
 
 		 447 aa  226  6e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0300234 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0802  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 		 463 aa  221  3e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00906644 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5129  putative two-component sensor histidine kinase  35.96 
 
 		 448 aa  216  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5100  histidine kinase  38.06 
 
 		 482 aa  211  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.368053  normal  0.11003 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1978  signal transduction protein, histidine kinase  31.45 
 
 		 444 aa  209  6e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02659  hypothetical protein  30.89 
 
 		 449 aa  209  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 		 459 aa  207  4e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1245  sensor histidine kinase  31.87 
 
 		 462 aa  204  3e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000271676  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3453  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 		 464 aa  203  5e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0937  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 		 461 aa  202  9e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.159129 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003785  signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 		 441 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0077957  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3068  putative two-component sensor histidine kinase  31.76 
 
 		 458 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.691387  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1067  histidine kinase  34.38 
 
 		 467 aa  201  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0918  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 467 aa  200  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.123629 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1831  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 		 458 aa  200  6e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0398387  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 		 465 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.374305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0895  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.57 
 
 		 461 aa  196  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2127  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 		 463 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3895  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.12 
 
 		 460 aa  194  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.378674  normal  0.194122 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1359  two component sensor kinase  32.03 
 
 		 471 aa  194  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3430  histidine kinase  37.2 
 
 		 464 aa  192  8e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0631  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 		 459 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0181536  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3177  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 475 aa  190  4e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0501501 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2673  histidine kinase  31.38 
 
 		 436 aa  190  5e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0604  sensor histidine kinase  31.6 
 
 		 436 aa  187  4e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0435  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 		 481 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.711544 
 
 
-
 
NC_004310  BR0605  sensor histidine kinase  32.78 
 
 		 432 aa  185  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.972928  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1188  Signal transduction histidine kinase  33.41 
 
 		 465 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0429  sensor histidine kinase FeuQ  30.86 
 
 		 473 aa  184  3e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3059  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 453 aa  183  5.0000000000000004e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0203  two component sensor kinase  33.41 
 
 		 451 aa  183  7e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1434  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 		 465 aa  182  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4804  histidine kinase  35.32 
 
 		 446 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.631947  normal  0.828013 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2065  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 		 467 aa  177  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3443  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 478 aa  177  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131083  normal  0.673106 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 		 446 aa  176  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0175865 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4082  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 		 455 aa  176  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.154716 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 		 446 aa  175  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.741916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 		 463 aa  174  5e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1409  ATPase domain-containing protein  31.8 
 
 		 471 aa  173  6.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.137041 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1684  histidine kinase  31.8 
 
 		 471 aa  172  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.091412  normal  0.96111 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 471 aa  171  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2544  putative two-component sensor  33.26 
 
 		 444 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0961662  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0582  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.62 
 
 		 445 aa  167  4e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.684402  normal  0.489398 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3354  ribose 5-phosphate isomerase  27.81 
 
 		 456 aa  166  5.9999999999999996e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000158163  normal  0.115638 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29740  putative two-component sensor  31.85 
 
 		 445 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4990  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 		 472 aa  166  9e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000206747 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5126  two component sensor kinase  32.9 
 
 		 456 aa  165  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1948  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.74 
 
 		 439 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.014264 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3512  histidine kinase  31.84 
 
 		 441 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00937623  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1038  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 		 474 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.596315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4325  hypothetical protein  36.45 
 
 		 411 aa  162  9e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.36321 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3211  sensor histidine kinase  30.18 
 
 		 439 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.608335  normal  0.379725 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3295  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 		 444 aa  162  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.183643  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 		 445 aa  160  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0398387  normal  0.0265162 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0659  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 		 441 aa  159  9e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000460347  hitchhiker  0.000037431 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 		 439 aa  159  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.44 
 
 		 461 aa  158  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112663  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3380  sensor histidine kinase  29.5 
 
 		 439 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.625161  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2616  histidine kinase  31.45 
 
 		 474 aa  156  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 		 439 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000231827 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3876  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 		 441 aa  155  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000107272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3188  histidine kinase  34.91 
 
 		 456 aa  155  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10722  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.32 
 
 		 456 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 		 439 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0848259  normal  0.136137 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4047  sensor histidine kinase  39.49 
 
 		 317 aa  155  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1355  Signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 441 aa  155  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.26 
 
 		 439 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.98279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3007  sensor histidine kinase  31.58 
 
 		 445 aa  151  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 		 442 aa  150  4e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000150109  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3876  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 		 442 aa  150  5e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.213045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0614  ATPase domain-containing protein  27.74 
 
 		 442 aa  149  8e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.617782  normal  0.375325 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 		 442 aa  149  9e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139912  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1996  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 		 437 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.540244  normal  0.136551 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0615  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.74 
 
 		 442 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.27687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3415  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.74 
 
 		 442 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.147478  normal  0.210462 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3693  histidine kinase  31.22 
 
 		 442 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0589  histidine kinase  32.79 
 
 		 437 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3750  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 		 442 aa  148  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4435  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 		 490 aa  147  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.713299 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0621  sensor histidine kinase  30.77 
 
 		 442 aa  147  6e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2841  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.6 
 
 		 445 aa  146  6e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3771  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 		 437 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.429615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4170  histidine kinase  34.65 
 
 		 490 aa  145  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3247  sensor histidine kinase  26.96 
 
 		 469 aa  145  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000098482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02837  two-component system sensor protein required for AvrXa21activity H2 (raxH2)  30.44 
 
 		 456 aa  144  4e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3778  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.45 
 
 		 462 aa  143  6e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>