More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4403 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4693  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  83.63 
 
 		 452 aa  692    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4403  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 454 aa  871    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  82.16 
 
 		 458 aa  644    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4931  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  72.26 
 
 		 450 aa  568  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.231481 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1886  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  65.17 
 
 		 484 aa  543  1e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5572  putative two-component sensor histidine kinase  58.59 
 
 		 471 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.118515 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6193  histidine kinase  47.99 
 
 		 452 aa  335  1e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4481  histidine kinase  41.65 
 
 		 448 aa  256  8e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.410421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4113  ATPase domain-containing protein  41.43 
 
 		 448 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal  0.819443 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1659  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.04 
 
 		 459 aa  249  6e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.819337 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4594  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.87 
 
 		 460 aa  249  7e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.85 
 
 		 459 aa  235  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3512  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.41 
 
 		 447 aa  229  9e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3157  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.19 
 
 		 447 aa  228  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0710965 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5129  putative two-component sensor histidine kinase  37.58 
 
 		 448 aa  226  6e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1883  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.89 
 
 		 447 aa  224  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0300234 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1978  signal transduction protein, histidine kinase  32.49 
 
 		 444 aa  223  4.9999999999999996e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5100  histidine kinase  39.78 
 
 		 482 aa  223  4.9999999999999996e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.368053  normal  0.11003 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0802  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 		 463 aa  218  1e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00906644 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3430  histidine kinase  40 
 
 		 464 aa  217  4e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1831  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 		 458 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0398387  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0937  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 		 461 aa  210  4e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.159129 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1245  sensor histidine kinase  32.3 
 
 		 462 aa  210  5e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000271676  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3068  putative two-component sensor histidine kinase  33.99 
 
 		 458 aa  208  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.691387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3453  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 464 aa  206  8e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4082  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.57 
 
 		 455 aa  205  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.154716 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2127  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 		 463 aa  204  4e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003785  signal transduction histidine kinase  30.22 
 
 		 441 aa  202  8e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0077957  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02659  hypothetical protein  28.51 
 
 		 449 aa  202  9e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1359  two component sensor kinase  32.13 
 
 		 471 aa  198  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3443  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 		 478 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131083  normal  0.673106 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1434  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 		 465 aa  196  6e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1067  histidine kinase  33.19 
 
 		 467 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0895  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 		 461 aa  196  8.000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 		 465 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.374305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3059  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 		 453 aa  194  4e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0918  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.96 
 
 		 467 aa  193  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.123629 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0631  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.5 
 
 		 459 aa  192  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0181536  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1188  Signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 		 465 aa  188  1e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2065  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 		 467 aa  188  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3895  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 		 460 aa  187  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.378674  normal  0.194122 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4047  sensor histidine kinase  42.59 
 
 		 317 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0435  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 		 481 aa  184  3e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.711544 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.7 
 
 		 445 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0398387  normal  0.0265162 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.24 
 
 		 439 aa  182  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4804  histidine kinase  35.66 
 
 		 446 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.631947  normal  0.828013 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3177  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 		 475 aa  181  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0501501 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0203  two component sensor kinase  33.41 
 
 		 451 aa  181  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1038  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.14 
 
 		 474 aa  180  4e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.596315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4325  hypothetical protein  37.94 
 
 		 411 aa  176  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.36321 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 		 446 aa  176  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.741916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3188  histidine kinase  36.83 
 
 		 456 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10722  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 		 446 aa  175  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0175865 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2673  histidine kinase  33.09 
 
 		 436 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0604  sensor histidine kinase  32.18 
 
 		 436 aa  174  3.9999999999999995e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0605  sensor histidine kinase  33.17 
 
 		 432 aa  171  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.972928  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4990  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 		 472 aa  172  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000206747 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3211  sensor histidine kinase  32.57 
 
 		 439 aa  171  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.608335  normal  0.379725 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1684  histidine kinase  32.97 
 
 		 471 aa  168  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.091412  normal  0.96111 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1409  ATPase domain-containing protein  32.97 
 
 		 471 aa  168  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.137041 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1948  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 		 439 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.014264 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.81 
 
 		 461 aa  168  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2616  histidine kinase  32.52 
 
 		 474 aa  167  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 		 471 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 		 463 aa  166  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3380  sensor histidine kinase  31.28 
 
 		 439 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.625161  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3304  sensor histidine kinase  31.61 
 
 		 466 aa  163  7e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.232472 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 439 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0848259  normal  0.136137 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0429  sensor histidine kinase FeuQ  29.66 
 
 		 473 aa  161  2e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.99 
 
 		 456 aa  161  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4345  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 		 454 aa  159  9e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0442368  normal  0.692011 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5126  two component sensor kinase  32.17 
 
 		 456 aa  158  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.41 
 
 		 439 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.98279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28570  sensory histidine protein kinase  33.33 
 
 		 440 aa  157  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.380534  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2544  putative two-component sensor  33.85 
 
 		 444 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0961662  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29740  putative two-component sensor  33.97 
 
 		 445 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 439 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000231827 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3512  histidine kinase  29.61 
 
 		 441 aa  157  4e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00937623  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3876  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.28 
 
 		 441 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000107272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3295  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.26 
 
 		 444 aa  156  8e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.183643  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2064  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 		 441 aa  156  9e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0576592 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3771  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 437 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.429615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1996  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 		 437 aa  155  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.540244  normal  0.136551 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0582  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.04 
 
 		 445 aa  155  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.684402  normal  0.489398 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 		 454 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0526543  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4141  histidine kinase  29.87 
 
 		 454 aa  152  8e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2841  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.11 
 
 		 445 aa  152  8e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1841  two-component system, sensor protein  29.46 
 
 		 482 aa  152  1e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.775188  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3876  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 		 442 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.213045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4435  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 		 490 aa  151  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.713299 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 		 448 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1355  Signal transduction histidine kinase  33.41 
 
 		 441 aa  150  4e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0615  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 		 442 aa  150  4e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.27687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3415  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 		 442 aa  150  4e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.147478  normal  0.210462 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3750  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.47 
 
 		 442 aa  150  5e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 		 442 aa  150  5e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139912  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02837  two-component system sensor protein required for AvrXa21activity H2 (raxH2)  28.79 
 
 		 456 aa  150  5e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3693  histidine kinase  28.93 
 
 		 442 aa  150  6e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 		 448 aa  150  6e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0614  ATPase domain-containing protein  28.21 
 
 		 442 aa  150  6e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.617782  normal  0.375325 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>