More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02837 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1772  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  75.22 
 
 
482 aa  682    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.480782  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1841  two-component system, sensor protein  75.43 
 
 
482 aa  683    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.775188  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02837  two-component system sensor protein required for AvrXa21activity H2 (raxH2)  100 
 
 
456 aa  920    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  77.07 
 
 
475 aa  687    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.587392  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1263  ATP-binding region, ATPase-like protein  32.7 
 
 
474 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000081586  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0167  histidine kinase  38.36 
 
 
429 aa  239  6.999999999999999e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1957  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.12 
 
 
443 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0083917  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1131  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 
442 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3304  sensor histidine kinase  34.54 
 
 
466 aa  226  8e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.232472 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3684  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 
455 aa  223  4e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.714122  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2504  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
443 aa  223  4e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0281  sensor histidine kinase  28.69 
 
 
475 aa  223  4.9999999999999996e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.012454  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0243  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 
440 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.37468  normal  0.182435 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4345  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.32 
 
 
454 aa  223  6e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0442368  normal  0.692011 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2936  histidine kinase  35.15 
 
 
517 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00120898  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 
454 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0526543  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3247  sensor histidine kinase  31.03 
 
 
469 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000098482  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4141  histidine kinase  31.89 
 
 
454 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4648  sensor histidine kinase  32.97 
 
 
454 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2696  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 
484 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000110077  normal  0.128468 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3818  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.41 
 
 
454 aa  211  2e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00854299  decreased coverage  0.0034747 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3909  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.41 
 
 
454 aa  211  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000571443  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3354  ribose 5-phosphate isomerase  30.04 
 
 
456 aa  208  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000158163  normal  0.115638 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1389  sensor protein PhoQ  30.39 
 
 
470 aa  204  3e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.812387  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3853  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 
454 aa  203  6e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 
471 aa  202  8e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4026  ATPase domain-containing protein  31.44 
 
 
454 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3381  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 
466 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00620745  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1684  histidine kinase  32.2 
 
 
471 aa  200  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.091412  normal  0.96111 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1409  ATPase domain-containing protein  32.2 
 
 
471 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.137041 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1978  signal transduction protein, histidine kinase  29.68 
 
 
444 aa  193  6e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4990  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 
472 aa  192  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000206747 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2975  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 
460 aa  192  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.241819 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 
459 aa  191  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2841  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 
445 aa  191  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3708  sensor histidine kinase  33.48 
 
 
448 aa  190  5e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.642299  hitchhiker  0.00152873 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02298  sensor histidine kinase  30.04 
 
 
443 aa  189  5.999999999999999e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4239  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.59 
 
 
450 aa  188  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1680  sensor protein PhoQ  32.97 
 
 
448 aa  182  7e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3068  putative two-component sensor histidine kinase  27.94 
 
 
458 aa  182  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.691387  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1434  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 
465 aa  181  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 
448 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 
448 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1217  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 
448 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2349  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 
449 aa  178  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000892956  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4435  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 
490 aa  177  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.713299 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4170  histidine kinase  31.59 
 
 
490 aa  176  7e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003785  signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 
441 aa  176  8e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0077957  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02659  hypothetical protein  28.82 
 
 
449 aa  175  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1945  sensor protein PhoQ  34.52 
 
 
449 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1199  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 
448 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3453  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.85 
 
 
464 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1188  Signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 
465 aa  171  3e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1849  histidine kinase  33.65 
 
 
449 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00571096  hitchhiker  0.00108599 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2487  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 
450 aa  169  8e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1723  ATPase domain-containing protein  33.87 
 
 
449 aa  169  8e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.124766 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1831  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.16 
 
 
458 aa  169  9e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0398387  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2495  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 
449 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.796582  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2615  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 
449 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0121943 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 
463 aa  168  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1245  sensor histidine kinase  27.5 
 
 
462 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000271676  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2127  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 
463 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1654  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 
449 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0689547  hitchhiker  0.00033988 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49170  two-component sensor PhoQ  35.04 
 
 
448 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000325542 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0895  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 
461 aa  167  4e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1579  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 
449 aa  167  4e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.15351 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1607  sensor protein PhoQ  37.41 
 
 
484 aa  167  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2502  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 
449 aa  167  5e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 
442 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000150109  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1714  sensor protein PhoQ  37.41 
 
 
468 aa  166  8e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2856  sensor protein PhoQ  37.41 
 
 
484 aa  166  9e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3876  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.28 
 
 
442 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.213045  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5129  putative two-component sensor histidine kinase  30.2 
 
 
448 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60361  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0615  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 
442 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.27687  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3415  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 
442 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.147478  normal  0.210462 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0614  ATPase domain-containing protein  33.96 
 
 
442 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.617782  normal  0.375325 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0621  sensor histidine kinase  33.65 
 
 
442 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2805  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 
449 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00328953  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.51 
 
 
465 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.374305  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0631  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
459 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0181536  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2256  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 
449 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1642  sensor protein PhoQ  35.89 
 
 
487 aa  164  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3693  histidine kinase  34.28 
 
 
442 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1541  sensor protein PhoQ  33.97 
 
 
450 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.28 
 
 
442 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139912  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3750  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 
442 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1938  sensor protein PhoQ  35.29 
 
 
483 aa  163  6e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1790  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.42 
 
 
451 aa  162  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1067  histidine kinase  29.85 
 
 
467 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4199  two-component sensor PhoQ  34.38 
 
 
448 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.528574  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0918  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.42 
 
 
467 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.123629 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0582  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 
445 aa  161  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.684402  normal  0.489398 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1590  sensor protein PhoQ  36.11 
 
 
486 aa  161  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000452252 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1249  sensor protein PhoQ  36.11 
 
 
486 aa  160  4e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2067  sensor protein PhoQ  36.16 
 
 
483 aa  160  4e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.194184  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1745  histidine kinase  33.77 
 
 
450 aa  160  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000105534  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2474  sensor protein PhoQ  36.11 
 
 
486 aa  160  4e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.701623  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2012  sensor protein PhoQ  36.3 
 
 
485 aa  160  5e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0783662 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2150  sensor protein PhoQ  35.07 
 
 
486 aa  159  7e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0666594  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1996  sensor protein PhoQ  35.76 
 
 
486 aa  159  7e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.687103 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>