More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3771 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3771  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 437 aa  853    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.429615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3211  sensor histidine kinase  75.29 
 
 		 439 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.608335  normal  0.379725 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1948  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  73.68 
 
 		 439 aa  598  1e-170  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.014264 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3380  sensor histidine kinase  74.37 
 
 		 439 aa  591  1e-168  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.625161  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  74.6 
 
 		 439 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0848259  normal  0.136137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  73.68 
 
 		 439 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.98279  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  73.23 
 
 		 439 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000231827 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2544  putative two-component sensor  66.51 
 
 		 444 aa  541  1e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0961662  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29740  putative two-component sensor  65.9 
 
 		 445 aa  525  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1996  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  66.59 
 
 		 437 aa  519  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.540244  normal  0.136551 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28570  sensory histidine protein kinase  61.78 
 
 		 440 aa  474  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.380534  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1355  Signal transduction histidine kinase  44.16 
 
 		 441 aa  323  4e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0589  histidine kinase  40.84 
 
 		 437 aa  246  8e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3512  histidine kinase  36.63 
 
 		 441 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00937623  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0659  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 		 441 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000460347  hitchhiker  0.000037431 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3876  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 		 441 aa  237  4e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000107272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3295  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 		 444 aa  231  1e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.183643  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0621  sensor histidine kinase  35.68 
 
 		 442 aa  228  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3007  sensor histidine kinase  35.36 
 
 		 445 aa  228  2e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0582  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 		 445 aa  225  1e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.684402  normal  0.489398 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0615  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 442 aa  224  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.27687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3415  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 442 aa  224  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.147478  normal  0.210462 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0614  ATPase domain-containing protein  34.74 
 
 		 442 aa  224  3e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.617782  normal  0.375325 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3693  histidine kinase  34.84 
 
 		 442 aa  223  7e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 		 442 aa  222  9e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000150109  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 		 442 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139912  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3876  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 442 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.213045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3750  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 442 aa  219  6e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1245  sensor histidine kinase  36.5 
 
 		 462 aa  209  5e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000271676  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0311  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.34 
 
 		 454 aa  210  5e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0005  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 		 446 aa  207  3e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000685276  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02659  hypothetical protein  35.54 
 
 		 449 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003785  signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 		 441 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0077957  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.43 
 
 		 459 aa  196  8.000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1914  histidine kinase  42.47 
 
 		 451 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5572  putative two-component sensor histidine kinase  35.29 
 
 		 471 aa  190  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.118515 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5129  putative two-component sensor histidine kinase  35 
 
 		 448 aa  190  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60361  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4488  sensor histidine kinase  32.96 
 
 		 438 aa  188  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0356  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 438 aa  187  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3068  putative two-component sensor histidine kinase  32.17 
 
 		 458 aa  186  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.691387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2127  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.96 
 
 		 463 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3782  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 		 438 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3453  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 		 464 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1978  signal transduction protein, histidine kinase  32 
 
 		 444 aa  184  4.0000000000000006e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1434  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 		 465 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0240  ATPase domain-containing protein  33.33 
 
 		 438 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000252659 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0244  histidine kinase  32.65 
 
 		 438 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000181402 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1831  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 		 458 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0398387  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0238  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 438 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0239  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 		 438 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000059891 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4693  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 		 452 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1188  Signal transduction histidine kinase  32.93 
 
 		 465 aa  177  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4113  ATPase domain-containing protein  34.67 
 
 		 448 aa  178  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal  0.819443 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4481  histidine kinase  34.67 
 
 		 448 aa  178  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.410421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0238  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 438 aa  177  4e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1886  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 484 aa  176  8e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 465 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.374305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0937  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 		 461 aa  175  9.999999999999999e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.159129 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 		 471 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0241  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 438 aa  173  5e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3188  histidine kinase  33.25 
 
 		 456 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10722  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0631  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 459 aa  172  7.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0181536  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1684  histidine kinase  30.87 
 
 		 471 aa  172  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.091412  normal  0.96111 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1409  ATPase domain-containing protein  30.87 
 
 		 471 aa  171  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.137041 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5100  histidine kinase  35.15 
 
 		 482 aa  169  7e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.368053  normal  0.11003 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3304  sensor histidine kinase  39.25 
 
 		 466 aa  169  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.232472 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 458 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4931  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 		 450 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.231481 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4594  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 		 460 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6193  histidine kinase  33.12 
 
 		 452 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4239  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.59 
 
 		 450 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4403  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 454 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1659  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 459 aa  165  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.819337 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3059  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.49 
 
 		 453 aa  164  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2841  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.43 
 
 		 445 aa  163  6e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3430  histidine kinase  32.67 
 
 		 464 aa  162  8.000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4990  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 472 aa  162  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000206747 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3818  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 		 454 aa  162  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00854299  decreased coverage  0.0034747 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4325  hypothetical protein  33.94 
 
 		 411 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.36321 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3157  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 447 aa  161  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0710965 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1131  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 		 442 aa  160  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3512  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 		 447 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3909  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.35 
 
 		 454 aa  160  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000571443  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3895  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.81 
 
 		 460 aa  160  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.378674  normal  0.194122 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 463 aa  160  5e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4082  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.08 
 
 		 455 aa  160  5e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.154716 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4026  ATPase domain-containing protein  37.6 
 
 		 454 aa  159  6e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0123  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 		 442 aa  159  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 		 439 aa  158  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0203  two component sensor kinase  31.39 
 
 		 451 aa  158  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2064  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 		 441 aa  156  6e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0576592 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3853  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.08 
 
 		 454 aa  156  8e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4047  sensor histidine kinase  38.76 
 
 		 317 aa  156  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4648  sensor histidine kinase  36.96 
 
 		 454 aa  155  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2616  histidine kinase  30.97 
 
 		 474 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1038  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.84 
 
 		 474 aa  155  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.596315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1714  sensor protein PhoQ  34.73 
 
 		 468 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2856  sensor protein PhoQ  34.73 
 
 		 484 aa  155  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1607  sensor protein PhoQ  34.73 
 
 		 484 aa  155  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1067  histidine kinase  36.39 
 
 		 467 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>