More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1359 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1359  two component sensor kinase  100 
 
 		 471 aa  939    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1067  histidine kinase  66.03 
 
 		 467 aa  629  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0918  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  66.03 
 
 		 467 aa  626  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.123629 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  64.72 
 
 		 461 aa  570  1e-161  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0895  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  48.92 
 
 		 461 aa  412  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0604  sensor histidine kinase  48.33 
 
 		 436 aa  395  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0605  sensor histidine kinase  48.42 
 
 		 432 aa  391  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.972928  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2673  histidine kinase  47.76 
 
 		 436 aa  386  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0429  sensor histidine kinase FeuQ  43.51 
 
 		 473 aa  370  1e-101  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.48 
 
 		 459 aa  303  6.000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1434  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.35 
 
 		 465 aa  287  2.9999999999999996e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3453  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.78 
 
 		 464 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1188  Signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 		 465 aa  280  4e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2127  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.19 
 
 		 463 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1831  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.15 
 
 		 458 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0398387  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3068  putative two-component sensor histidine kinase  37.63 
 
 		 458 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.691387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3177  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.57 
 
 		 475 aa  274  3e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0501501 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.35 
 
 		 465 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.374305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1409  ATPase domain-containing protein  39.58 
 
 		 471 aa  260  3e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.137041 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1684  histidine kinase  39.58 
 
 		 471 aa  261  3e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.091412  normal  0.96111 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4990  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.77 
 
 		 472 aa  259  6e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000206747 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.16 
 
 		 471 aa  258  1e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0435  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 		 481 aa  253  6e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.711544 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4435  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.36 
 
 		 490 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.713299 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.26 
 
 		 463 aa  239  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0802  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 		 463 aa  239  1e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00906644 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4170  histidine kinase  38.94 
 
 		 490 aa  238  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3443  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.62 
 
 		 478 aa  218  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131083  normal  0.673106 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3895  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 		 460 aa  211  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.378674  normal  0.194122 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2065  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 		 467 aa  209  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5129  putative two-component sensor histidine kinase  33.19 
 
 		 448 aa  206  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0937  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.89 
 
 		 461 aa  206  1e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.159129 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1886  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 		 484 aa  194  4e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02659  hypothetical protein  29.47 
 
 		 449 aa  191  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4047  sensor histidine kinase  39.53 
 
 		 317 aa  187  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 		 445 aa  187  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0398387  normal  0.0265162 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5100  histidine kinase  31.51 
 
 		 482 aa  183  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.368053  normal  0.11003 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4082  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.25 
 
 		 455 aa  182  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.154716 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1245  sensor histidine kinase  30.95 
 
 		 462 aa  181  2.9999999999999997e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000271676  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3430  histidine kinase  31.6 
 
 		 464 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.96 
 
 		 446 aa  180  4e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0175865 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 		 446 aa  179  7e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.741916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003785  signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 		 441 aa  178  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0077957  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1978  signal transduction protein, histidine kinase  27.09 
 
 		 444 aa  177  4e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5572  putative two-component sensor histidine kinase  31.58 
 
 		 471 aa  177  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.118515 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0631  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 		 459 aa  172  9e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0181536  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6193  histidine kinase  32.7 
 
 		 452 aa  170  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3188  histidine kinase  31.59 
 
 		 456 aa  170  4e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10722  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4403  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 		 454 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4693  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 		 452 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3059  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 		 453 aa  163  5.0000000000000005e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1038  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 		 474 aa  160  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.596315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0167  histidine kinase  31.55 
 
 		 429 aa  159  8e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 		 439 aa  159  8e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4931  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 		 450 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.231481 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 		 458 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2064  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.22 
 
 		 441 aa  154  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0576592 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 		 475 aa  150  4e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.587392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02837  two-component system sensor protein required for AvrXa21activity H2 (raxH2)  31 
 
 		 456 aa  150  4e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5126  two component sensor kinase  27.97 
 
 		 456 aa  148  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4239  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 		 450 aa  147  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3304  sensor histidine kinase  28.04 
 
 		 466 aa  145  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.232472 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0281  sensor histidine kinase  25.98 
 
 		 475 aa  144  4e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.012454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2696  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 		 484 aa  143  5e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000110077  normal  0.128468 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3512  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.41 
 
 		 447 aa  143  8e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3157  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 447 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0710965 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2975  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.17 
 
 		 460 aa  141  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.241819 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4481  histidine kinase  31.44 
 
 		 448 aa  141  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.410421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1841  two-component system, sensor protein  30.02 
 
 		 482 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.775188  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4325  hypothetical protein  32 
 
 		 411 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.36321 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3007  sensor histidine kinase  32.91 
 
 		 445 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.91 
 
 		 456 aa  140  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3708  sensor histidine kinase  28.21 
 
 		 448 aa  140  7e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.642299  hitchhiker  0.00152873 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1772  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.02 
 
 		 482 aa  140  7e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.480782  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4113  ATPase domain-containing protein  31.77 
 
 		 448 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal  0.819443 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2616  histidine kinase  28.13 
 
 		 474 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1948  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.46 
 
 		 439 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.014264 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0123  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 		 442 aa  137  6.0000000000000005e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1199  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 		 448 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3684  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 		 455 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.714122  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.83 
 
 		 448 aa  136  9e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3354  ribose 5-phosphate isomerase  24.95 
 
 		 456 aa  136  9e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000158163  normal  0.115638 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3778  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 		 462 aa  136  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2544  putative two-component sensor  28.39 
 
 		 444 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0961662  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1217  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.83 
 
 		 448 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1355  Signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 		 441 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3247  sensor histidine kinase  28.36 
 
 		 469 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000098482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2936  histidine kinase  29.97 
 
 		 517 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00120898  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1680  sensor protein PhoQ  27.56 
 
 		 448 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0005  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 446 aa  133  6e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000685276  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29740  putative two-component sensor  28.51 
 
 		 445 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3853  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 454 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2504  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 		 443 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 		 448 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4111  sodium/glutamate symporter  37.27 
 
 		 369 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.381154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1957  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 		 443 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0083917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0659  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 		 441 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000460347  hitchhiker  0.000037431 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4804  histidine kinase  29.22 
 
 		 446 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.631947  normal  0.828013 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4345  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.25 
 
 		 454 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0442368  normal  0.692011 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1131  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.29 
 
 		 442 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>