More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0123 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_0123  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 442 aa  890    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0659  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 		 441 aa  171  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000460347  hitchhiker  0.000037431 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2544  putative two-component sensor  30.2 
 
 		 444 aa  170  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0961662  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3007  sensor histidine kinase  32.63 
 
 		 445 aa  169  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3693  histidine kinase  34.32 
 
 		 442 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 		 442 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139912  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29740  putative two-component sensor  33.33 
 
 		 445 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3876  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 		 442 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.213045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 		 442 aa  167  4e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000150109  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3750  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 		 442 aa  167  5e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0614  ATPase domain-containing protein  34.65 
 
 		 442 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.617782  normal  0.375325 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3876  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 441 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000107272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0589  histidine kinase  33.6 
 
 		 437 aa  164  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3512  histidine kinase  28.91 
 
 		 441 aa  164  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00937623  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0615  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 		 442 aa  164  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.27687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3415  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 		 442 aa  164  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.147478  normal  0.210462 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1355  Signal transduction histidine kinase  30.07 
 
 		 441 aa  162  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1948  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 439 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.014264 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0621  sensor histidine kinase  34.6 
 
 		 442 aa  161  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003785  signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 		 441 aa  160  6e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0077957  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3295  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 444 aa  159  7e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.183643  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0582  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 		 445 aa  159  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.684402  normal  0.489398 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1996  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 		 437 aa  157  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.540244  normal  0.136551 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0005  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.66 
 
 		 446 aa  157  4e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000685276  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28570  sensory histidine protein kinase  29.85 
 
 		 440 aa  155  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.380534  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0240  ATPase domain-containing protein  30.07 
 
 		 438 aa  152  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000252659 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1978  signal transduction protein, histidine kinase  29.64 
 
 		 444 aa  152  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.26 
 
 		 456 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 		 439 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0848259  normal  0.136137 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02659  hypothetical protein  29.9 
 
 		 449 aa  150  6e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 		 439 aa  149  9e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000231827 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1245  sensor histidine kinase  30.26 
 
 		 462 aa  149  9e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000271676  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 		 439 aa  149  9e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.98279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4481  histidine kinase  32.8 
 
 		 448 aa  147  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.410421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1309  sensor protein PhoQ  33.23 
 
 		 487 aa  146  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.591966 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1954  sensor protein PhoQ  33.23 
 
 		 487 aa  146  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.443264  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1331  sensor protein PhoQ  33.23 
 
 		 487 aa  146  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0246748  normal  0.298422 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1347  sensor protein PhoQ  33.23 
 
 		 487 aa  146  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2136  sensor protein PhoQ  33.23 
 
 		 487 aa  146  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.062219 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4113  ATPase domain-containing protein  32.17 
 
 		 448 aa  145  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal  0.819443 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3211  sensor histidine kinase  27.84 
 
 		 439 aa  144  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.608335  normal  0.379725 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0167  histidine kinase  36.02 
 
 		 429 aa  143  5e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2474  sensor protein PhoQ  30.63 
 
 		 486 aa  143  5e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.701623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1249  sensor protein PhoQ  30.63 
 
 		 486 aa  143  5e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1642  sensor protein PhoQ  31.17 
 
 		 487 aa  143  6e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1957  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 443 aa  143  7e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0083917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1590  sensor protein PhoQ  30.63 
 
 		 486 aa  143  7e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000452252 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01127  sensory histidine kinase in two-compoent regulatory system with PhoP  30.31 
 
 		 486 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2518  histidine kinase  30.31 
 
 		 486 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.208145  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1307  sensor protein PhoQ  30.31 
 
 		 486 aa  142  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3380  sensor histidine kinase  27.84 
 
 		 439 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.625161  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01135  hypothetical protein  30.31 
 
 		 486 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1996  sensor protein PhoQ  30.31 
 
 		 486 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.687103 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1292  sensor protein PhoQ  30.31 
 
 		 486 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3782  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 		 438 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4648  sensor histidine kinase  31.64 
 
 		 454 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3354  ribose 5-phosphate isomerase  28.9 
 
 		 456 aa  141  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000158163  normal  0.115638 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3247  sensor histidine kinase  29.68 
 
 		 469 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000098482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4594  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 		 460 aa  141  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 		 459 aa  140  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3818  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 		 454 aa  140  6e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00854299  decreased coverage  0.0034747 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0356  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 		 438 aa  140  6e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1714  sensor protein PhoQ  32.44 
 
 		 468 aa  140  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3909  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 		 454 aa  139  7e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000571443  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.49 
 
 		 454 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0526543  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4239  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 		 450 aa  138  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4345  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 		 454 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0442368  normal  0.692011 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2856  sensor protein PhoQ  32.06 
 
 		 484 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1131  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.53 
 
 		 442 aa  137  4e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1359  two component sensor kinase  32.6 
 
 		 471 aa  137  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1607  sensor protein PhoQ  32.06 
 
 		 484 aa  136  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4026  ATPase domain-containing protein  31.58 
 
 		 454 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3853  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 		 454 aa  136  8e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0604  sensor histidine kinase  31.51 
 
 		 436 aa  136  9e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2616  histidine kinase  29.67 
 
 		 474 aa  136  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0605  sensor histidine kinase  31.51 
 
 		 432 aa  135  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.972928  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0895  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.83 
 
 		 461 aa  135  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0239  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 438 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000059891 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0281  sensor histidine kinase  27.7 
 
 		 475 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.012454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4141  histidine kinase  30.6 
 
 		 454 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0238  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.73 
 
 		 438 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3381  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 		 466 aa  134  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00620745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 		 439 aa  133  5e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3684  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 		 455 aa  133  6e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.714122  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2936  histidine kinase  29.69 
 
 		 517 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00120898  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0244  histidine kinase  28.95 
 
 		 438 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000181402 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1886  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.71 
 
 		 484 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 		 475 aa  132  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.587392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2064  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 		 441 aa  131  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0576592 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02837  two-component system sensor protein required for AvrXa21activity H2 (raxH2)  30.64 
 
 		 456 aa  130  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3895  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 		 460 aa  130  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.378674  normal  0.194122 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2696  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 		 484 aa  130  6e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000110077  normal  0.128468 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2673  histidine kinase  29.9 
 
 		 436 aa  130  6e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0238  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.67 
 
 		 438 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3771  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 		 437 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.429615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2487  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 		 450 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2150  sensor protein PhoQ  29.48 
 
 		 486 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0666594  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 		 463 aa  128  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5100  histidine kinase  30.57 
 
 		 482 aa  128  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.368053  normal  0.11003 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0937  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 		 461 aa  128  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.159129 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>