More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_29740 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2544  putative two-component sensor  93.67 
 
 
444 aa  798    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0961662  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29740  putative two-component sensor  100 
 
 
445 aa  877    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1948  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  66.44 
 
 
439 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.014264 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1996  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  66.82 
 
 
437 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.540244  normal  0.136551 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  64.98 
 
 
439 aa  495  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000231827 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3380  sensor histidine kinase  63.59 
 
 
439 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.625161  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3771  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  65.9 
 
 
437 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.429615  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  65.21 
 
 
439 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.98279  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  65.67 
 
 
439 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0848259  normal  0.136137 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3211  sensor histidine kinase  64.14 
 
 
439 aa  491  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.608335  normal  0.379725 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28570  sensory histidine protein kinase  63.24 
 
 
440 aa  486  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.380534  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1355  Signal transduction histidine kinase  46.38 
 
 
441 aa  365  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0621  sensor histidine kinase  36.08 
 
 
442 aa  248  1e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3512  histidine kinase  36.1 
 
 
441 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00937623  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 
442 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000150109  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.08 
 
 
442 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139912  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3415  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 
442 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.147478  normal  0.210462 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3693  histidine kinase  36.08 
 
 
442 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0615  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 
442 aa  244  3e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.27687  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0614  ATPase domain-containing protein  35.41 
 
 
442 aa  243  6e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.617782  normal  0.375325 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3876  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 
442 aa  243  7e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.213045  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3750  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 
442 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0582  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 
445 aa  240  4e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.684402  normal  0.489398 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3007  sensor histidine kinase  34.89 
 
 
445 aa  230  4e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3876  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 
441 aa  225  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000107272  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3295  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 
444 aa  225  1e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.183643  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0659  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.41 
 
 
441 aa  223  8e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000460347  hitchhiker  0.000037431 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003785  signal transduction histidine kinase  35.01 
 
 
441 aa  211  3e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0077957  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0589  histidine kinase  37.91 
 
 
437 aa  209  8e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0005  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 
446 aa  207  3e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000685276  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0311  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.9 
 
 
454 aa  205  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.99 
 
 
459 aa  202  9e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02659  hypothetical protein  32.45 
 
 
449 aa  201  3e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1245  sensor histidine kinase  35.96 
 
 
462 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000271676  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1978  signal transduction protein, histidine kinase  31.5 
 
 
444 aa  196  6e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0240  ATPase domain-containing protein  34.52 
 
 
438 aa  195  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000252659 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3068  putative two-component sensor histidine kinase  34.08 
 
 
458 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.691387  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4113  ATPase domain-containing protein  36.39 
 
 
448 aa  192  7e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal  0.819443 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1434  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 
465 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5129  putative two-component sensor histidine kinase  35.25 
 
 
448 aa  190  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60361  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5572  putative two-component sensor histidine kinase  35.95 
 
 
471 aa  189  8e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.118515 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4481  histidine kinase  35.66 
 
 
448 aa  187  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.410421  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0631  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 
459 aa  186  6e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0181536  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3782  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 
438 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2127  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.59 
 
 
463 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0356  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 
438 aa  184  3e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1188  Signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 
465 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1831  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.41 
 
 
458 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0398387  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3895  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 
460 aa  178  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.378674  normal  0.194122 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0802  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 
463 aa  177  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00906644 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31 
 
 
471 aa  177  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3453  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
464 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0239  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 
438 aa  177  3e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000059891 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0937  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 
461 aa  177  3e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.159129 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4594  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 
460 aa  177  4e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1886  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 
484 aa  177  4e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0123  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 
442 aa  177  5e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0244  histidine kinase  32.37 
 
 
438 aa  177  5e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000181402 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1914  histidine kinase  41.33 
 
 
451 aa  176  6e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 
465 aa  176  7e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.374305  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0238  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 
438 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1684  histidine kinase  31.74 
 
 
471 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.091412  normal  0.96111 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1409  ATPase domain-containing protein  31.74 
 
 
471 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.137041 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4488  sensor histidine kinase  31.25 
 
 
438 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4931  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 
450 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.231481 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5100  histidine kinase  34.3 
 
 
482 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.368053  normal  0.11003 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0238  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 
438 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 
463 aa  166  5.9999999999999996e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4239  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 
450 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4990  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 
472 aa  166  8e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000206747 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3188  histidine kinase  32.36 
 
 
456 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10722  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4693  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 
452 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2616  histidine kinase  31.92 
 
 
474 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3247  sensor histidine kinase  30 
 
 
469 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000098482  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0241  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 
438 aa  163  6e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1607  sensor protein PhoQ  35.34 
 
 
484 aa  162  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3304  sensor histidine kinase  38.31 
 
 
466 aa  161  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.232472 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6193  histidine kinase  33.05 
 
 
452 aa  161  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 
439 aa  160  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2856  sensor protein PhoQ  34.69 
 
 
484 aa  160  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1714  sensor protein PhoQ  34.69 
 
 
468 aa  160  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3778  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 
462 aa  160  5e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3059  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 
453 aa  159  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1131  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.99 
 
 
442 aa  157  4e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0167  histidine kinase  38.49 
 
 
429 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0203  two component sensor kinase  31.04 
 
 
451 aa  156  6e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2841  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 
445 aa  156  7e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0281  sensor histidine kinase  33.44 
 
 
475 aa  156  9e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.012454  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3177  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 
475 aa  156  9e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0501501 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0435  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
481 aa  155  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.711544 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1263  ATP-binding region, ATPase-like protein  36 
 
 
474 aa  154  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000081586  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2150  sensor protein PhoQ  34.59 
 
 
486 aa  155  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0666594  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3708  sensor histidine kinase  38.17 
 
 
448 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.642299  hitchhiker  0.00152873 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 
448 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3430  histidine kinase  31.77 
 
 
464 aa  154  4e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3818  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 
454 aa  154  4e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00854299  decreased coverage  0.0034747 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1217  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 
448 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4435  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 
490 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.713299 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2696  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.64 
 
 
484 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000110077  normal  0.128468 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1680  sensor protein PhoQ  37.79 
 
 
448 aa  153  7e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>