More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2544 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2544  putative two-component sensor  100 
 
 		 444 aa  870    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0961662  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29740  putative two-component sensor  93.67 
 
 		 445 aa  784    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1996  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  68.51 
 
 		 437 aa  527  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.540244  normal  0.136551 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1948  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  66.67 
 
 		 439 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.014264 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  65.98 
 
 		 439 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000231827 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  66.44 
 
 		 439 aa  501  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0848259  normal  0.136137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  66.21 
 
 		 439 aa  502  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.98279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3771  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  66.51 
 
 		 437 aa  500  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.429615  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3380  sensor histidine kinase  63.22 
 
 		 439 aa  488  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.625161  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3211  sensor histidine kinase  63.99 
 
 		 439 aa  489  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.608335  normal  0.379725 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28570  sensory histidine protein kinase  63.7 
 
 		 440 aa  486  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.380534  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1355  Signal transduction histidine kinase  47.72 
 
 		 441 aa  366  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0621  sensor histidine kinase  35.55 
 
 		 442 aa  241  2e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3512  histidine kinase  35.81 
 
 		 441 aa  241  2e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00937623  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.49 
 
 		 442 aa  239  9e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000150109  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3415  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.49 
 
 		 442 aa  238  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.147478  normal  0.210462 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0582  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 		 445 aa  239  1e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.684402  normal  0.489398 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0615  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.49 
 
 		 442 aa  238  2e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.27687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3693  histidine kinase  35.49 
 
 		 442 aa  237  4e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.49 
 
 		 442 aa  237  4e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139912  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0614  ATPase domain-containing protein  35.49 
 
 		 442 aa  236  8e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.617782  normal  0.375325 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3876  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 		 442 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.213045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3750  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 		 442 aa  233  5e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3295  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 444 aa  227  3e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.183643  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3007  sensor histidine kinase  35.03 
 
 		 445 aa  225  1e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3876  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 441 aa  223  7e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000107272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0659  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 		 441 aa  219  7e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000460347  hitchhiker  0.000037431 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0589  histidine kinase  37.47 
 
 		 437 aa  213  7e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0311  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.86 
 
 		 454 aa  206  9e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003785  signal transduction histidine kinase  35.01 
 
 		 441 aa  203  6e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0077957  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 		 459 aa  202  8e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0240  ATPase domain-containing protein  35.71 
 
 		 438 aa  202  8e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000252659 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1978  signal transduction protein, histidine kinase  31.26 
 
 		 444 aa  198  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0005  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.05 
 
 		 446 aa  196  9e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000685276  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4113  ATPase domain-containing protein  36.75 
 
 		 448 aa  194  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal  0.819443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3782  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 		 438 aa  194  3e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1245  sensor histidine kinase  35.31 
 
 		 462 aa  192  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000271676  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0631  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.99 
 
 		 459 aa  192  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0181536  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02659  hypothetical protein  34.38 
 
 		 449 aa  192  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0356  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 		 438 aa  191  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4481  histidine kinase  36.04 
 
 		 448 aa  189  7e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.410421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3068  putative two-component sensor histidine kinase  34 
 
 		 458 aa  189  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.691387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0239  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 		 438 aa  187  3e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000059891 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5129  putative two-component sensor histidine kinase  34.3 
 
 		 448 aa  187  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1434  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 		 465 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5572  putative two-component sensor histidine kinase  34.95 
 
 		 471 aa  184  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.118515 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2127  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 		 463 aa  182  7e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1188  Signal transduction histidine kinase  33.25 
 
 		 465 aa  182  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0244  histidine kinase  33.85 
 
 		 438 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000181402 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0238  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 		 438 aa  180  4e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1914  histidine kinase  41.07 
 
 		 451 aa  179  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4594  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.73 
 
 		 460 aa  179  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0937  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.19 
 
 		 461 aa  178  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.159129 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4488  sensor histidine kinase  32.67 
 
 		 438 aa  177  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0123  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.04 
 
 		 442 aa  176  8e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1831  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.84 
 
 		 458 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0398387  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3895  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 		 460 aa  175  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.378674  normal  0.194122 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1886  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.37 
 
 		 484 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0238  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 		 438 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5100  histidine kinase  35.05 
 
 		 482 aa  174  3.9999999999999995e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.368053  normal  0.11003 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3453  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 		 464 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0802  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 463 aa  171  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00906644 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4239  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 450 aa  170  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.46 
 
 		 465 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.374305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0241  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 		 438 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4931  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 		 450 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.231481 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3059  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 		 453 aa  166  8e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6193  histidine kinase  33.97 
 
 		 452 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 		 471 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1684  histidine kinase  31.45 
 
 		 471 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.091412  normal  0.96111 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1409  ATPase domain-containing protein  31.45 
 
 		 471 aa  163  6e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.137041 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0203  two component sensor kinase  32.68 
 
 		 451 aa  162  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3188  histidine kinase  32.6 
 
 		 456 aa  162  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10722  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4990  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 		 472 aa  161  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000206747 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3304  sensor histidine kinase  38.93 
 
 		 466 aa  162  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.232472 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 		 439 aa  160  4e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4693  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 		 452 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.71 
 
 		 463 aa  159  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2616  histidine kinase  31.13 
 
 		 474 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3247  sensor histidine kinase  29.09 
 
 		 469 aa  157  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000098482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3778  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.1 
 
 		 462 aa  157  4e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1131  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.06 
 
 		 442 aa  156  8e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2696  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.64 
 
 		 484 aa  155  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000110077  normal  0.128468 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3430  histidine kinase  32.35 
 
 		 464 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0167  histidine kinase  39.33 
 
 		 429 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0895  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31 
 
 		 461 aa  153  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2150  sensor protein PhoQ  34.88 
 
 		 486 aa  152  8.999999999999999e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0666594  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0281  sensor histidine kinase  33.45 
 
 		 475 aa  152  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.012454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3354  ribose 5-phosphate isomerase  27.49 
 
 		 456 aa  152  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000158163  normal  0.115638 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1263  ATP-binding region, ATPase-like protein  34.78 
 
 		 474 aa  152  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000081586  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02837  two-component system sensor protein required for AvrXa21activity H2 (raxH2)  35.12 
 
 		 456 aa  151  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1607  sensor protein PhoQ  34.73 
 
 		 484 aa  152  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2841  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.68 
 
 		 445 aa  151  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0918  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 		 467 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.123629 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3708  sensor histidine kinase  38.58 
 
 		 448 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.642299  hitchhiker  0.00152873 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1841  two-component system, sensor protein  32.42 
 
 		 482 aa  151  3e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.775188  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3157  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 		 447 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0710965 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2856  sensor protein PhoQ  34.08 
 
 		 484 aa  150  5e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.01 
 
 		 448 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1714  sensor protein PhoQ  33.95 
 
 		 468 aa  150  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>