More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1772 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1772  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
482 aa  976    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.480782  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02837  two-component system sensor protein required for AvrXa21activity H2 (raxH2)  75.43 
 
 
456 aa  694    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1841  two-component system, sensor protein  98.76 
 
 
482 aa  964    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.775188  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  72.67 
 
 
475 aa  665    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.587392  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1263  ATP-binding region, ATPase-like protein  32.45 
 
 
474 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000081586  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1131  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.24 
 
 
442 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1957  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 
443 aa  228  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0083917  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2936  histidine kinase  36.52 
 
 
517 aa  228  3e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00120898  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3304  sensor histidine kinase  35.9 
 
 
466 aa  227  4e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.232472 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0281  sensor histidine kinase  29.16 
 
 
475 aa  221  3e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.012454  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0167  histidine kinase  38.48 
 
 
429 aa  221  3e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3247  sensor histidine kinase  32 
 
 
469 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000098482  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4345  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.24 
 
 
454 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0442368  normal  0.692011 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3354  ribose 5-phosphate isomerase  31.28 
 
 
456 aa  213  7e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000158163  normal  0.115638 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2504  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 
443 aa  213  7.999999999999999e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4648  sensor histidine kinase  30.62 
 
 
454 aa  210  4e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 
454 aa  210  4e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0526543  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2696  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 
484 aa  208  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000110077  normal  0.128468 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4141  histidine kinase  30.8 
 
 
454 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4026  ATPase domain-containing protein  30.62 
 
 
454 aa  204  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1389  sensor protein PhoQ  30.43 
 
 
470 aa  203  4e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.812387  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3853  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 
454 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0243  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 
440 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.37468  normal  0.182435 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2841  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.01 
 
 
445 aa  201  3e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3818  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 
454 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00854299  decreased coverage  0.0034747 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3909  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.19 
 
 
454 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000571443  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 
459 aa  195  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02298  sensor histidine kinase  30 
 
 
443 aa  194  3e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3684  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 
455 aa  192  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.714122  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3381  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 
466 aa  189  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00620745  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2975  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 
460 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.241819 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3708  sensor histidine kinase  33.48 
 
 
448 aa  183  7e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.642299  hitchhiker  0.00152873 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1978  signal transduction protein, histidine kinase  29.36 
 
 
444 aa  182  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0895  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 
461 aa  182  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.16 
 
 
471 aa  181  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4990  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.94 
 
 
472 aa  180  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000206747 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1684  histidine kinase  30.19 
 
 
471 aa  180  4e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.091412  normal  0.96111 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003785  signal transduction histidine kinase  28.42 
 
 
441 aa  180  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0077957  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1409  ATPase domain-containing protein  30.19 
 
 
471 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.137041 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1680  sensor protein PhoQ  32.22 
 
 
448 aa  179  7e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0621  sensor histidine kinase  37.23 
 
 
442 aa  178  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 
448 aa  176  9e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3068  putative two-component sensor histidine kinase  28.74 
 
 
458 aa  176  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.691387  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1217  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 
448 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02659  hypothetical protein  27.55 
 
 
449 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3750  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.01 
 
 
442 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2349  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 
449 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000892956  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3876  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.65 
 
 
442 aa  173  5e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.213045  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.65 
 
 
442 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139912  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3693  histidine kinase  36.65 
 
 
442 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4239  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 
450 aa  171  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0614  ATPase domain-containing protein  35.94 
 
 
442 aa  170  5e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.617782  normal  0.375325 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1849  histidine kinase  34.74 
 
 
449 aa  169  7e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00571096  hitchhiker  0.00108599 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3415  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 
442 aa  169  7e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.147478  normal  0.210462 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 
448 aa  169  8e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.69 
 
 
442 aa  169  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000150109  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0615  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 
442 aa  169  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.27687  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1938  sensor protein PhoQ  36.36 
 
 
483 aa  169  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2067  sensor protein PhoQ  36.36 
 
 
483 aa  167  4e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.194184  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0582  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 
445 aa  167  4e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.684402  normal  0.489398 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2495  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.42 
 
 
449 aa  167  5e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.796582  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2615  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.42 
 
 
449 aa  167  5e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0121943 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1945  sensor protein PhoQ  35.06 
 
 
449 aa  166  8e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2502  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.42 
 
 
449 aa  166  8e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1434  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.66 
 
 
465 aa  166  8e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2805  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.39 
 
 
449 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00328953  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1607  sensor protein PhoQ  35.77 
 
 
484 aa  165  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2487  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 
450 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1714  sensor protein PhoQ  35.77 
 
 
468 aa  164  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2856  sensor protein PhoQ  35.77 
 
 
484 aa  164  3e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1831  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.25 
 
 
458 aa  163  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0398387  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 
456 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2012  sensor protein PhoQ  35.64 
 
 
485 aa  162  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0783662 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1590  sensor protein PhoQ  36.27 
 
 
486 aa  162  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000452252 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1723  ATPase domain-containing protein  34.74 
 
 
449 aa  162  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.124766 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1249  sensor protein PhoQ  36.27 
 
 
486 aa  161  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5126  two component sensor kinase  28.29 
 
 
456 aa  162  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1245  sensor histidine kinase  33.89 
 
 
462 aa  162  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000271676  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2474  sensor protein PhoQ  36.27 
 
 
486 aa  161  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.701623  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1199  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 
448 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01127  sensory histidine kinase in two-compoent regulatory system with PhoP  35.93 
 
 
486 aa  160  5e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01135  hypothetical protein  35.93 
 
 
486 aa  160  5e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2150  sensor protein PhoQ  34.55 
 
 
486 aa  160  5e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0666594  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1654  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.42 
 
 
449 aa  160  5e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0689547  hitchhiker  0.00033988 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2518  histidine kinase  35.93 
 
 
486 aa  160  6e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.208145  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1307  sensor protein PhoQ  35.93 
 
 
486 aa  160  6e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1541  sensor protein PhoQ  34.42 
 
 
450 aa  160  6e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1745  histidine kinase  32.46 
 
 
450 aa  160  6e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000105534  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1292  sensor protein PhoQ  35.93 
 
 
486 aa  160  6e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1865  sensor protein PhoQ  35.64 
 
 
484 aa  160  6e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3453  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 
464 aa  160  7e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4435  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 
490 aa  159  8e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.713299 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2256  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.73 
 
 
449 aa  159  9e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3876  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 
441 aa  159  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000107272  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1579  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 
449 aa  159  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.15351 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4170  histidine kinase  30.43 
 
 
490 aa  158  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1996  sensor protein PhoQ  35.59 
 
 
486 aa  158  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.687103 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1188  Signal transduction histidine kinase  28.36 
 
 
465 aa  157  4e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5129  putative two-component sensor histidine kinase  28.85 
 
 
448 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60361  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1642  sensor protein PhoQ  34.68 
 
 
487 aa  157  5.0000000000000005e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>