More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2106 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1265  aconitate hydratase  69.16 
 
 		 644 aa  938    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0585  aconitate hydratase  55.9 
 
 		 645 aa  688    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.674704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05770  aconitate hydratase  54.8 
 
 		 647 aa  684    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.295611  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2445  aconitate hydratase  69.83 
 
 		 645 aa  936    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.430041  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0423  aconitate hydratase  55.9 
 
 		 645 aa  688    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.82263  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3767  aconitate hydratase  53.35 
 
 		 640 aa  697    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2707  aconitate hydratase  55.5 
 
 		 660 aa  725    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2450  aconitate hydratase  69.05 
 
 		 644 aa  931    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3640  aconitate hydratase  55.3 
 
 		 656 aa  719    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.506746  normal  0.0138117 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0416  aconitate hydratase  55.02 
 
 		 639 aa  688    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2763  aconitate hydratase  70.03 
 
 		 648 aa  941    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23930  aconitate hydratase  54.39 
 
 		 649 aa  714    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.161871  normal  0.0821905 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1882  aconitate hydratase  55.54 
 
 		 641 aa  677    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.111034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2774  aconitate hydratase  55.15 
 
 		 661 aa  716    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1612  aconitate hydratase  68.48 
 
 		 646 aa  909    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1966  aconitate hydratase  67.39 
 
 		 648 aa  892    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0606  aconitate hydratase  54.82 
 
 		 655 aa  712    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2824  aconitate hydratase  53.64 
 
 		 660 aa  651    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2258  aconitate hydratase  66.93 
 
 		 648 aa  887    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0285  aconitate hydratase  51.63 
 
 		 646 aa  646    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2106  aconitate hydratase  100 
 
 		 645 aa  1314    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.12781  normal  0.0131142 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4932  aconitate hydratase  57.19 
 
 		 652 aa  701    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450299  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0524  aconitate hydratase  54.13 
 
 		 643 aa  699    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000206753  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2176  aconitate hydratase  50.55 
 
 		 642 aa  669    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0828952  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0908  aconitate hydratase  56.92 
 
 		 668 aa  736    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.410888  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0020  aconitate hydratase  54.35 
 
 		 644 aa  669    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5705  aconitate hydratase  56.39 
 
 		 659 aa  726    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.762683  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4177  aconitate hydratase  56.71 
 
 		 647 aa  730    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.13774  normal  0.304204 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4768  aconitate hydratase  54.29 
 
 		 674 aa  704    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.682164  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3158  aconitate hydratase  53.89 
 
 		 642 aa  709    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107146  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3383  aconitate hydratase  50.31 
 
 		 657 aa  634  1e-180  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1336  aconitate hydratase  50.23 
 
 		 656 aa  632  1e-180  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1930  aconitate hydratase  51.94 
 
 		 642 aa  634  1e-180  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.221002  normal  0.0834672 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3193  aconitate hydratase  51.71 
 
 		 640 aa  619  1e-176  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.249489  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1406  aconitate hydratase  50.92 
 
 		 643 aa  619  1e-176  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.258962  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0597  aconitate hydratase  49.54 
 
 		 658 aa  617  1e-175  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1803  aconitate hydratase  49.69 
 
 		 657 aa  617  1e-175  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2153  aconitate hydratase  47.74 
 
 		 644 aa  616  1e-175  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3021  aconitate hydratase  51.01 
 
 		 641 aa  608  1e-173  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1102  aconitate hydratase  47.67 
 
 		 642 aa  611  1e-173  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0098  aconitate hydratase  48.7 
 
 		 661 aa  601  1e-170  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1771  aconitate hydratase  50.39 
 
 		 641 aa  600  1e-170  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03894  aconitate hydratase, mitochondrial, putative (Eurofung)  33.79 
 
 		 796 aa  325  1e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.26439  normal  0.611037 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1208  aconitate hydratase  33.61 
 
 		 756 aa  323  6e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.2348  normal  0.0471939 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1408  aconitate hydratase  35.18 
 
 		 755 aa  322  9.999999999999999e-87  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1482  aconitate hydratase  32.65 
 
 		 754 aa  322  1.9999999999999998e-86  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0971  aconitate hydratase  33.65 
 
 		 760 aa  317  6e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90724  aconitate hydratase  32.44 
 
 		 800 aa  313  7.999999999999999e-84  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.319181 
 
 
-
 
NC_006686  CND02620  aconitase, putative  33.24 
 
 		 792 aa  311  2e-83  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2025  aconitate hydratase  33.58 
 
 		 755 aa  305  2.0000000000000002e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00945  aconitate hydratase  31.46 
 
 		 755 aa  299  1e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.181334  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01590  aconitate hydratase, putative  31.77 
 
 		 770 aa  297  4e-79  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05300  aconitate hydratase, putative (Eurofung)  32.16 
 
 		 798 aa  296  7e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.29403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85181  Aconitase, mitochondrial  34.12 
 
 		 780 aa  296  7e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.154992  normal  0.331758 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2223  aconitate hydratase  32.33 
 
 		 755 aa  295  2e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0660  aconitate hydratase  31.97 
 
 		 758 aa  295  2e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2702  aconitate hydratase  32.46 
 
 		 751 aa  289  1e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2016  aconitate hydratase  31.78 
 
 		 757 aa  287  4e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964954 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01770  aconitate hydratase, putative  31.73 
 
 		 787 aa  286  5.999999999999999e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00912812  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05525  Aconitase Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J267]  32.62 
 
 		 783 aa  285  1.0000000000000001e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.842678 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1952  aconitate hydratase  30.38 
 
 		 765 aa  279  1e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0646  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.69 
 
 		 418 aa  257  4e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00455068  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0621  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.69 
 
 		 418 aa  256  7e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0188797  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2965  homoaconitase  31.17 
 
 		 655 aa  247  4.9999999999999997e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.556593  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0402  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.09 
 
 		 418 aa  243  7.999999999999999e-63  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.344506 
 
 
-
 
NC_002936  DET0448  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.17 
 
 		 417 aa  237  6e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0425  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.41 
 
 		 431 aa  236  7e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1704  homoaconitate hydratase family protein  33.73 
 
 		 419 aa  235  2.0000000000000002e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_390  aconitase/homoaconitase/3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  35.17 
 
 		 417 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88705  homoaconitase  30.43 
 
 		 677 aa  230  6e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.933626  normal  0.508507 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1100  3-isopropylmalate dehydratase  34.29 
 
 		 418 aa  229  1e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1630  3-isopropylmalate dehydratase  33.17 
 
 		 418 aa  228  2e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2338  homoaconitate hydratase family protein  33.17 
 
 		 418 aa  225  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1466  homoaconitate hydratase family protein  31.1 
 
 		 429 aa  223  7e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0167474  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0015  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.6 
 
 		 418 aa  221  3e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2220  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  34.29 
 
 		 415 aa  219  8.999999999999998e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0747  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.33 
 
 		 416 aa  219  1e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1588  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  32.54 
 
 		 419 aa  217  5.9999999999999996e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0828  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.09 
 
 		 416 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1693  homoaconitate hydratase family protein  33.57 
 
 		 424 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27842  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0596  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.81 
 
 		 420 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21050  hypothetical protein  28.55 
 
 		 781 aa  214  3.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1102  3-isopropylmalate dehydratase  33.25 
 
 		 437 aa  214  3.9999999999999995e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_732  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  33.09 
 
 		 417 aa  214  4.9999999999999996e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.999081  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1191  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  32.46 
 
 		 424 aa  213  1e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2017  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  31.99 
 
 		 419 aa  212  2e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2254  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.89 
 
 		 421 aa  212  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10870  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  32.7 
 
 		 420 aa  211  4e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0105  aconitate hydratase  25.92 
 
 		 861 aa  211  5e-53  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.227514  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0519  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  31.53 
 
 		 424 aa  210  6e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000192959  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1030  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.1 
 
 		 431 aa  210  8e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000620705 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0129  homoaconitate hydratase family protein  33.25 
 
 		 418 aa  209  1e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.525388  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2871  aconitate hydratase domain protein  26.23 
 
 		 753 aa  208  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2075  3-isopropylmalate dehydratase  31.19 
 
 		 416 aa  208  2e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1036  homoaconitate hydratase family protein  35.31 
 
 		 418 aa  208  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2101  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.65 
 
 		 429 aa  209  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0493977  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0289  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  32.63 
 
 		 425 aa  208  3e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0126  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.25 
 
 		 419 aa  207  3e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0442  3-isopropylmalate dehydratase  38.65 
 
 		 423 aa  208  3e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0357426 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2142  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.97 
 
 		 419 aa  207  4e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.245729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>