More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNM01770 on replicon NC_006682
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001302  ANIA_03894  aconitate hydratase, mitochondrial, putative (Eurofung)  60.98 
 
 
796 aa  935    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.26439  normal  0.611037 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05300  aconitate hydratase, putative (Eurofung)  50.59 
 
 
798 aa  723    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.29403  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05525  Aconitase Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J267]  54.44 
 
 
783 aa  811    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.842678 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85181  Aconitase, mitochondrial  56.63 
 
 
780 aa  819    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.154992  normal  0.331758 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1408  aconitate hydratase  51.69 
 
 
755 aa  736    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1208  aconitate hydratase  51.97 
 
 
756 aa  746    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.2348  normal  0.0471939 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01770  aconitate hydratase, putative  100 
 
 
787 aa  1620    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00912812  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02620  aconitase, putative  57.05 
 
 
792 aa  861    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01590  aconitate hydratase, putative  53.42 
 
 
770 aa  781    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90724  aconitate hydratase  61.85 
 
 
800 aa  991    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.319181 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00945  aconitate hydratase  52.22 
 
 
755 aa  760    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.181334  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0660  aconitate hydratase  52.62 
 
 
758 aa  741    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2016  aconitate hydratase  53.77 
 
 
757 aa  780    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00964954 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2025  aconitate hydratase  53.6 
 
 
755 aa  774    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1952  aconitate hydratase  52.08 
 
 
765 aa  755    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2223  aconitate hydratase  52.62 
 
 
755 aa  756    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274844  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1482  aconitate hydratase  51.39 
 
 
754 aa  754    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2702  aconitate hydratase  51.51 
 
 
751 aa  743    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0971  aconitate hydratase  51.3 
 
 
760 aa  746    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0585  aconitate hydratase  36.25 
 
 
645 aa  365  2e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.674704  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0423  aconitate hydratase  36.25 
 
 
645 aa  365  2e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.82263  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0606  aconitate hydratase  34.65 
 
 
655 aa  356  7.999999999999999e-97  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1406  aconitate hydratase  35.53 
 
 
643 aa  351  3e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.258962  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3158  aconitate hydratase  33.42 
 
 
642 aa  343  1e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107146  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1102  aconitate hydratase  34.69 
 
 
642 aa  341  2.9999999999999998e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0416  aconitate hydratase  33.06 
 
 
639 aa  340  4e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1882  aconitate hydratase  35.26 
 
 
641 aa  338  2.9999999999999997e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.111034  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1930  aconitate hydratase  33.42 
 
 
642 aa  336  1e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.221002  normal  0.0834672 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0285  aconitate hydratase  35.06 
 
 
646 aa  334  4e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3767  aconitate hydratase  33.92 
 
 
640 aa  334  5e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1612  aconitate hydratase  33.61 
 
 
646 aa  321  3e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0524  aconitate hydratase  35.15 
 
 
643 aa  321  3.9999999999999996e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000206753  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0098  aconitate hydratase  34.65 
 
 
661 aa  320  5e-86  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2258  aconitate hydratase  32.52 
 
 
648 aa  319  1e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2176  aconitate hydratase  31.82 
 
 
642 aa  318  3e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0828952  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2153  aconitate hydratase  33.56 
 
 
644 aa  317  4e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3193  aconitate hydratase  32.1 
 
 
640 aa  314  3.9999999999999997e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.249489  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1771  aconitate hydratase  32.57 
 
 
641 aa  314  3.9999999999999997e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1336  aconitate hydratase  32.97 
 
 
656 aa  313  1e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3383  aconitate hydratase  32.84 
 
 
657 aa  312  1e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1966  aconitate hydratase  32.74 
 
 
648 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1265  aconitate hydratase  32.74 
 
 
644 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2445  aconitate hydratase  33.01 
 
 
645 aa  310  8e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.430041  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2763  aconitate hydratase  31.83 
 
 
648 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3021  aconitate hydratase  32.37 
 
 
641 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0020  aconitate hydratase  32.74 
 
 
644 aa  303  6.000000000000001e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1803  aconitate hydratase  32.35 
 
 
657 aa  303  8.000000000000001e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0597  aconitate hydratase  34.18 
 
 
658 aa  303  9e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2707  aconitate hydratase  33 
 
 
660 aa  299  1e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2774  aconitate hydratase  31.55 
 
 
661 aa  293  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2106  aconitate hydratase  31.87 
 
 
645 aa  290  8e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.12781  normal  0.0131142 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5705  aconitate hydratase  31.33 
 
 
659 aa  288  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.762683  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2450  aconitate hydratase  31.86 
 
 
644 aa  287  5.999999999999999e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0908  aconitate hydratase  32.43 
 
 
668 aa  283  7.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.410888  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23930  aconitate hydratase  31.12 
 
 
649 aa  280  5e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.161871  normal  0.0821905 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4177  aconitate hydratase  31.72 
 
 
647 aa  275  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.13774  normal  0.304204 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4932  aconitate hydratase  30.56 
 
 
652 aa  268  2.9999999999999995e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450299  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3640  aconitate hydratase  30.01 
 
 
656 aa  263  8.999999999999999e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.506746  normal  0.0138117 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05770  aconitate hydratase  30.18 
 
 
647 aa  261  3e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.295611  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4768  aconitate hydratase  29.86 
 
 
674 aa  256  9e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.682164  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1467  aconitate hydratase  29.43 
 
 
840 aa  254  5.000000000000001e-66  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2824  aconitate hydratase  36.57 
 
 
660 aa  236  2.0000000000000002e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2068  aconitate hydratase 1  28.27 
 
 
855 aa  228  5.0000000000000005e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.461258  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0626  aconitate hydratase  28.06 
 
 
895 aa  216  9e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4240  aconitate hydratase 1  28.52 
 
 
884 aa  213  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07642  aconitate hydratase, hypothetical (Eurofung)  49.53 
 
 
326 aa  211  3e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.409922  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2861  aconitase  27.29 
 
 
891 aa  210  7e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.509308  normal  0.643421 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0804  aconitate hydratase  28.9 
 
 
873 aa  210  8e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0204  aconitate hydratase  27.98 
 
 
906 aa  210  8e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0875867 
 
 
-
 
NC_002978  WD0105  aconitate hydratase  28.59 
 
 
861 aa  209  1e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.227514  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0323  aconitate hydratase  27.36 
 
 
905 aa  209  2e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0291  aconitate hydratase  27.36 
 
 
905 aa  209  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0448672 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0382  aconitate hydratase  26.87 
 
 
905 aa  206  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0620  aconitate hydratase  29.26 
 
 
874 aa  205  3e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.343199  normal  0.507089 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0408  aconitate hydratase  27.64 
 
 
905 aa  205  3e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0106  aconitase  27.1 
 
 
922 aa  205  3e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0199  aconitate hydratase  27.12 
 
 
905 aa  204  4e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00485304  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0954  aconitate hydratase  28.78 
 
 
868 aa  204  5e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1867  aconitate hydratase  27.44 
 
 
868 aa  203  9.999999999999999e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0648101 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1112  aconitate hydratase  27.84 
 
 
885 aa  202  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.58218 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0828  aconitate hydratase  27.46 
 
 
883 aa  200  7e-50  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00982227  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1859  aconitate hydratase  27.76 
 
 
870 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4187  aconitate hydratase  28.71 
 
 
897 aa  199  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3509  aconitate hydratase  26.66 
 
 
910 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0016824 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0614  aconitate hydratase  28.24 
 
 
878 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.219296  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2333  aconitate hydratase 1  29.78 
 
 
887 aa  198  3e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1583  aconitate hydratase  28.14 
 
 
873 aa  198  3e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2264  aconitate hydratase  27.94 
 
 
907 aa  198  4.0000000000000005e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0464  aconitate hydratase  26.73 
 
 
894 aa  198  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.197482 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2603  aconitate hydratase  28.4 
 
 
872 aa  197  4.0000000000000005e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120412  hitchhiker  0.000028644 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1246  aconitate hydratase  28.67 
 
 
887 aa  197  5.000000000000001e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1181  aconitate hydratase  26.76 
 
 
909 aa  197  7e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.750963 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2007  aconitate hydratase  27.22 
 
 
899 aa  197  7e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08420  aconitase  27.45 
 
 
884 aa  197  8.000000000000001e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0660302  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02395  aconitate hydratase  27.31 
 
 
869 aa  196  9e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0881  aconitate hydratase  26.87 
 
 
918 aa  196  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100321 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2113  aconitate hydratase  28.03 
 
 
868 aa  196  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2497  aconitate hydratase  28.07 
 
 
869 aa  195  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00662485 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0224  aconitate hydratase  26.4 
 
 
908 aa  195  2e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1920  aconitate hydratase  26.2 
 
 
890 aa  195  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00387998  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>