More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0020 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1336  aconitate hydratase  51.08 
 
 
656 aa  642    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2445  aconitate hydratase  53.72 
 
 
645 aa  669    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.430041  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1771  aconitate hydratase  56.01 
 
 
641 aa  698    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1612  aconitate hydratase  54.42 
 
 
646 aa  671    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0524  aconitate hydratase  57.76 
 
 
643 aa  754    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000206753  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2153  aconitate hydratase  50.31 
 
 
644 aa  669    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2707  aconitate hydratase  50.77 
 
 
660 aa  647    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2450  aconitate hydratase  52.79 
 
 
644 aa  640    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0416  aconitate hydratase  58.54 
 
 
639 aa  771    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2763  aconitate hydratase  53.32 
 
 
648 aa  664    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1406  aconitate hydratase  57.14 
 
 
643 aa  721    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.258962  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1265  aconitate hydratase  55.59 
 
 
644 aa  705    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1882  aconitate hydratase  61.28 
 
 
641 aa  759    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.111034  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2258  aconitate hydratase  54.74 
 
 
648 aa  674    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1803  aconitate hydratase  50.77 
 
 
657 aa  652    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0606  aconitate hydratase  55.62 
 
 
655 aa  724    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1966  aconitate hydratase  54.59 
 
 
648 aa  678    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0585  aconitate hydratase  62.15 
 
 
645 aa  781    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.674704  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3193  aconitate hydratase  58.39 
 
 
640 aa  722    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.249489  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2176  aconitate hydratase  54.49 
 
 
642 aa  733    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0828952  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3767  aconitate hydratase  58.85 
 
 
640 aa  756    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3021  aconitate hydratase  57.05 
 
 
641 aa  704    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3383  aconitate hydratase  49.77 
 
 
657 aa  635    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0285  aconitate hydratase  53.98 
 
 
646 aa  669    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2106  aconitate hydratase  54.35 
 
 
645 aa  669    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.12781  normal  0.0131142 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3158  aconitate hydratase  56.5 
 
 
642 aa  754    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107146  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1930  aconitate hydratase  56.37 
 
 
642 aa  711    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.221002  normal  0.0834672 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0423  aconitate hydratase  62.15 
 
 
645 aa  781    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.82263  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0020  aconitate hydratase  100 
 
 
644 aa  1305    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1102  aconitate hydratase  48.92 
 
 
642 aa  632  1e-180  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23930  aconitate hydratase  50.08 
 
 
649 aa  622  1e-177  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.161871  normal  0.0821905 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0098  aconitate hydratase  49.24 
 
 
661 aa  620  1e-176  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0597  aconitate hydratase  49.61 
 
 
658 aa  613  9.999999999999999e-175  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4177  aconitate hydratase  50.31 
 
 
647 aa  606  9.999999999999999e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.13774  normal  0.304204 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5705  aconitate hydratase  48.62 
 
 
659 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.762683  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3640  aconitate hydratase  48.69 
 
 
656 aa  601  1e-170  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.506746  normal  0.0138117 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4932  aconitate hydratase  48.6 
 
 
652 aa  579  1e-164  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450299  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05770  aconitate hydratase  47.82 
 
 
647 aa  576  1.0000000000000001e-163  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.295611  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2824  aconitate hydratase  52.76 
 
 
660 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2774  aconitate hydratase  45.25 
 
 
661 aa  571  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0908  aconitate hydratase  47.03 
 
 
668 aa  565  1e-160  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.410888  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4768  aconitate hydratase  49.22 
 
 
674 aa  566  1e-160  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.682164  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0971  aconitate hydratase  36.2 
 
 
760 aa  370  1e-101  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1408  aconitate hydratase  36.5 
 
 
755 aa  361  2e-98  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2025  aconitate hydratase  37.43 
 
 
755 aa  357  3.9999999999999996e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01590  aconitate hydratase, putative  35.87 
 
 
770 aa  352  1e-95  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1208  aconitate hydratase  35.86 
 
 
756 aa  350  4e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.2348  normal  0.0471939 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2223  aconitate hydratase  35.26 
 
 
755 aa  350  5e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274844  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND02620  aconitase, putative  35.14 
 
 
792 aa  344  2.9999999999999997e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05300  aconitate hydratase, putative (Eurofung)  35.03 
 
 
798 aa  341  2e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.29403  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1482  aconitate hydratase  33.06 
 
 
754 aa  339  9.999999999999999e-92  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2016  aconitate hydratase  35.44 
 
 
757 aa  338  9.999999999999999e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00964954 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0660  aconitate hydratase  34.62 
 
 
758 aa  335  1e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90724  aconitate hydratase  34.15 
 
 
800 aa  328  2.0000000000000001e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.319181 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00945  aconitate hydratase  35.51 
 
 
755 aa  327  4.0000000000000003e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.181334  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1952  aconitate hydratase  34.42 
 
 
765 aa  324  3e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05525  Aconitase Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J267]  35.56 
 
 
783 aa  322  1.9999999999999998e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.842678 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03894  aconitate hydratase, mitochondrial, putative (Eurofung)  33.61 
 
 
796 aa  320  7e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.26439  normal  0.611037 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85181  Aconitase, mitochondrial  34.88 
 
 
780 aa  320  7e-86  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.154992  normal  0.331758 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2702  aconitate hydratase  33.43 
 
 
751 aa  313  3.9999999999999997e-84  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01770  aconitate hydratase, putative  32.7 
 
 
787 aa  301  3e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00912812  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0646  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40 
 
 
418 aa  283  6.000000000000001e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00455068  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0621  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.76 
 
 
418 aa  282  2e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0188797  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2220  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  36.69 
 
 
415 aa  262  1e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0448  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.19 
 
 
417 aa  261  3e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1100  3-isopropylmalate dehydratase  37.71 
 
 
418 aa  259  8e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0402  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.51 
 
 
418 aa  259  1e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.344506 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1704  homoaconitate hydratase family protein  35.34 
 
 
419 aa  258  2e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1588  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  35.89 
 
 
419 aa  258  2e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0425  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.74 
 
 
431 aa  258  3e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1693  homoaconitate hydratase family protein  38.01 
 
 
424 aa  256  6e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27842  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_390  aconitase/homoaconitase/3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  37.95 
 
 
417 aa  256  8e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1903  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.3 
 
 
427 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473608  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2254  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.44 
 
 
421 aa  255  1.0000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0476  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.67 
 
 
431 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0146744  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1466  homoaconitate hydratase family protein  33.81 
 
 
429 aa  253  7e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0167474  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0356  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.66 
 
 
420 aa  251  3e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.928431  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1610  homoaconitate hydratase family protein  37.22 
 
 
417 aa  250  4e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0596  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.58 
 
 
420 aa  249  7e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000659262  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1630  3-isopropylmalate dehydratase  36.1 
 
 
418 aa  249  9e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2737  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.6 
 
 
427 aa  248  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000214153  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1504  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.6 
 
 
427 aa  247  6e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.691126 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1191  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  35.24 
 
 
424 aa  247  6e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2017  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.26 
 
 
419 aa  245  1.9999999999999999e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3709  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.66 
 
 
427 aa  243  6e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129198  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0990  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.19 
 
 
423 aa  243  7e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2965  homoaconitase  32.45 
 
 
655 aa  242  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.556593  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0015  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.05 
 
 
418 aa  242  1e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0519  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.99 
 
 
424 aa  241  2.9999999999999997e-62  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000192959  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2142  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.34 
 
 
419 aa  241  4e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.245729  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1268  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.97 
 
 
427 aa  240  5e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000132862  hitchhiker  0.0000000000181918 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2338  homoaconitate hydratase family protein  34.52 
 
 
418 aa  239  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0289  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.98 
 
 
425 aa  238  2e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0227  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  38.15 
 
 
421 aa  239  2e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2361  homoaconitate hydratase family protein  36.75 
 
 
417 aa  238  3e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.859627 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2485  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.87 
 
 
424 aa  238  4e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.836058  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10870  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  34.52 
 
 
420 aa  237  4e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0376  3-isopropylmalate dehydratase  34.84 
 
 
416 aa  237  5.0000000000000005e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2075  3-isopropylmalate dehydratase  35.01 
 
 
416 aa  236  7e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0390  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.14 
 
 
419 aa  236  8e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>