More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4932 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2445  aconitate hydratase  55.23 
 
 		 645 aa  732    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.430041  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4768  aconitate hydratase  73.15 
 
 		 674 aa  957    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.682164  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4177  aconitate hydratase  70.3 
 
 		 647 aa  907    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.13774  normal  0.304204 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3640  aconitate hydratase  73.19 
 
 		 656 aa  953    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.506746  normal  0.0138117 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0524  aconitate hydratase  49.07 
 
 		 643 aa  648    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000206753  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2707  aconitate hydratase  62.46 
 
 		 660 aa  842    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3767  aconitate hydratase  48.44 
 
 		 640 aa  637    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2450  aconitate hydratase  52.91 
 
 		 644 aa  681    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4932  aconitate hydratase  100 
 
 		 652 aa  1306    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2763  aconitate hydratase  55.38 
 
 		 648 aa  732    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0908  aconitate hydratase  61.34 
 
 		 668 aa  778    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.410888  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1882  aconitate hydratase  52.61 
 
 		 641 aa  648    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.111034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1966  aconitate hydratase  54.21 
 
 		 648 aa  706    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0416  aconitate hydratase  50.39 
 
 		 639 aa  645    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0606  aconitate hydratase  50.23 
 
 		 655 aa  673    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1265  aconitate hydratase  52.56 
 
 		 644 aa  696    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5705  aconitate hydratase  63.8 
 
 		 659 aa  824    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.762683  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2106  aconitate hydratase  57.19 
 
 		 645 aa  718    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.12781  normal  0.0131142 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2774  aconitate hydratase  62.12 
 
 		 661 aa  823    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23930  aconitate hydratase  76.58 
 
 		 649 aa  1023    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.161871  normal  0.0821905 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1612  aconitate hydratase  54.11 
 
 		 646 aa  706    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2258  aconitate hydratase  54.52 
 
 		 648 aa  712    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3158  aconitate hydratase  49.53 
 
 		 642 aa  656    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107146  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05770  aconitate hydratase  67.13 
 
 		 647 aa  858    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.295611  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2176  aconitate hydratase  47.04 
 
 		 642 aa  628  1e-178  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0828952  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0423  aconitate hydratase  50.08 
 
 		 645 aa  620  1e-176  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.82263  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0585  aconitate hydratase  50.08 
 
 		 645 aa  620  1e-176  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.674704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0020  aconitate hydratase  48.76 
 
 		 644 aa  599  1e-170  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2824  aconitate hydratase  49.16 
 
 		 660 aa  596  1e-169  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1803  aconitate hydratase  47.6 
 
 		 657 aa  596  1e-169  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3383  aconitate hydratase  47.83 
 
 		 657 aa  593  1e-168  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0285  aconitate hydratase  47.31 
 
 		 646 aa  589  1e-167  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1336  aconitate hydratase  48.07 
 
 		 656 aa  581  1e-164  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0597  aconitate hydratase  49.11 
 
 		 658 aa  562  1.0000000000000001e-159  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1102  aconitate hydratase  44.12 
 
 		 642 aa  564  1.0000000000000001e-159  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2153  aconitate hydratase  43.48 
 
 		 644 aa  556  1e-157  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0098  aconitate hydratase  45.12 
 
 		 661 aa  557  1e-157  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1930  aconitate hydratase  48.03 
 
 		 642 aa  553  1e-156  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.221002  normal  0.0834672 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1406  aconitate hydratase  49.08 
 
 		 643 aa  545  1e-154  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.258962  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3193  aconitate hydratase  46.36 
 
 		 640 aa  542  1e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.249489  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3021  aconitate hydratase  46.88 
 
 		 641 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1771  aconitate hydratase  48.26 
 
 		 641 aa  531  1e-149  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1482  aconitate hydratase  33.66 
 
 		 754 aa  322  9.999999999999999e-87  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03894  aconitate hydratase, mitochondrial, putative (Eurofung)  33.47 
 
 		 796 aa  299  1e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.26439  normal  0.611037 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1408  aconitate hydratase  34.62 
 
 		 755 aa  297  3e-79  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2702  aconitate hydratase  31.23 
 
 		 751 aa  296  8e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0971  aconitate hydratase  33.73 
 
 		 760 aa  295  1e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1208  aconitate hydratase  32.69 
 
 		 756 aa  293  7e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.2348  normal  0.0471939 
 
 
-
 
NC_006686  CND02620  aconitase, putative  31.47 
 
 		 792 aa  292  1e-77  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01590  aconitate hydratase, putative  31.86 
 
 		 770 aa  288  2e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05525  Aconitase Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J267]  31.15 
 
 		 783 aa  288  2.9999999999999996e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.842678 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2025  aconitate hydratase  30.62 
 
 		 755 aa  286  8e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85181  Aconitase, mitochondrial  31.49 
 
 		 780 aa  285  2.0000000000000002e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.154992  normal  0.331758 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2223  aconitate hydratase  32 
 
 		 755 aa  285  3.0000000000000004e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90724  aconitate hydratase  30.22 
 
 		 800 aa  284  4.0000000000000003e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.319181 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01770  aconitate hydratase, putative  31.11 
 
 		 787 aa  282  1e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00912812  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0660  aconitate hydratase  31.22 
 
 		 758 aa  280  4e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2016  aconitate hydratase  30.48 
 
 		 757 aa  279  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964954 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00945  aconitate hydratase  29.93 
 
 		 755 aa  278  2e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.181334  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05300  aconitate hydratase, putative (Eurofung)  32.56 
 
 		 798 aa  276  1.0000000000000001e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.29403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1952  aconitate hydratase  29.95 
 
 		 765 aa  267  5e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1630  3-isopropylmalate dehydratase  32.3 
 
 		 418 aa  224  4.9999999999999996e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0646  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.17 
 
 		 418 aa  224  4.9999999999999996e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00455068  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1100  3-isopropylmalate dehydratase  34.29 
 
 		 418 aa  223  7e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0402  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  31.19 
 
 		 418 aa  223  9.999999999999999e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.344506 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0621  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  32.93 
 
 		 418 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0188797  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2220  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  34.22 
 
 		 415 aa  220  6e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1588  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  32.7 
 
 		 419 aa  219  1e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1466  homoaconitate hydratase family protein  30.62 
 
 		 429 aa  216  7e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0167474  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0448  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.61 
 
 		 417 aa  216  9e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1704  homoaconitate hydratase family protein  30.43 
 
 		 419 aa  213  7.999999999999999e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0425  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.93 
 
 		 431 aa  213  9e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0596  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  32.94 
 
 		 420 aa  209  9e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_390  aconitase/homoaconitase/3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  33.89 
 
 		 417 aa  209  1e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0794  hypothetical protein  28.61 
 
 		 753 aa  208  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0875  hypothetical protein  28.97 
 
 		 753 aa  209  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0825  hypothetical protein  28.61 
 
 		 761 aa  208  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.125653  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0356  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.31 
 
 		 420 aa  208  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.928431  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0390  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.31 
 
 		 419 aa  208  2e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0519  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  30.59 
 
 		 424 aa  208  3e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000192959  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2891  hypothetical protein  28.61 
 
 		 753 aa  207  3e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0493763 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2871  aconitate hydratase domain protein  28.47 
 
 		 753 aa  207  4e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0798  hypothetical protein  28.47 
 
 		 761 aa  207  5e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0978109  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0376  3-isopropylmalate dehydratase  32.07 
 
 		 416 aa  207  6e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1903  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  32.79 
 
 		 427 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473608  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2737  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.35 
 
 		 427 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000214153  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2338  homoaconitate hydratase family protein  30.95 
 
 		 418 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0624  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  32.32 
 
 		 427 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.588299  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1926  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  32.32 
 
 		 427 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.700325  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10870  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  32.07 
 
 		 420 aa  201  3e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1036  homoaconitate hydratase family protein  34.5 
 
 		 418 aa  201  3.9999999999999996e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2254  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.59 
 
 		 421 aa  201  3.9999999999999996e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1458  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.12 
 
 		 419 aa  201  3.9999999999999996e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.888399  normal  0.260054 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1504  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.35 
 
 		 427 aa  201  5e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.691126 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0476  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.57 
 
 		 431 aa  200  6e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0146744  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0747  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  31.25 
 
 		 416 aa  200  7e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1030  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  32.08 
 
 		 431 aa  200  9e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000620705 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3709  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  32.55 
 
 		 427 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129198  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2965  homoaconitase  27.94 
 
 		 655 aa  198  3e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.556593  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1268  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  31.85 
 
 		 427 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000132862  hitchhiker  0.0000000000181918 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>