More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0597 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_0423  aconitate hydratase  50.23 
 
 
645 aa  646    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.82263  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1265  aconitate hydratase  49.38 
 
 
644 aa  636    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1803  aconitate hydratase  83.31 
 
 
657 aa  1129    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2176  aconitate hydratase  51.16 
 
 
642 aa  694    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0828952  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0524  aconitate hydratase  52.63 
 
 
643 aa  707    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000206753  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3383  aconitate hydratase  86.17 
 
 
657 aa  1161    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0020  aconitate hydratase  49.61 
 
 
644 aa  639    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1406  aconitate hydratase  51.16 
 
 
643 aa  649    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.258962  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1882  aconitate hydratase  53.32 
 
 
641 aa  667    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.111034  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3767  aconitate hydratase  51.62 
 
 
640 aa  685    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0597  aconitate hydratase  100 
 
 
658 aa  1339    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0285  aconitate hydratase  52.38 
 
 
646 aa  666    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2106  aconitate hydratase  49.54 
 
 
645 aa  639    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.12781  normal  0.0131142 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0416  aconitate hydratase  52.57 
 
 
639 aa  685    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0098  aconitate hydratase  81.6 
 
 
661 aa  1108    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0585  aconitate hydratase  50.23 
 
 
645 aa  646    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.674704  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1336  aconitate hydratase  83.74 
 
 
656 aa  1123    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1930  aconitate hydratase  51.08 
 
 
642 aa  647    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.221002  normal  0.0834672 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0606  aconitate hydratase  51 
 
 
655 aa  666    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3158  aconitate hydratase  51.46 
 
 
642 aa  706    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107146  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1612  aconitate hydratase  50 
 
 
646 aa  633  1e-180  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2153  aconitate hydratase  48.37 
 
 
644 aa  634  1e-180  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2445  aconitate hydratase  49 
 
 
645 aa  630  1e-179  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.430041  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2450  aconitate hydratase  49.92 
 
 
644 aa  630  1e-179  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2763  aconitate hydratase  48.77 
 
 
648 aa  625  1e-178  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3021  aconitate hydratase  50.54 
 
 
641 aa  627  1e-178  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2258  aconitate hydratase  48.38 
 
 
648 aa  627  1e-178  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1966  aconitate hydratase  48.22 
 
 
648 aa  624  1e-177  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1771  aconitate hydratase  50.69 
 
 
641 aa  621  1e-176  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1102  aconitate hydratase  48.69 
 
 
642 aa  619  1e-176  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3193  aconitate hydratase  49.08 
 
 
640 aa  610  1e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.249489  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3640  aconitate hydratase  48.78 
 
 
656 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.506746  normal  0.0138117 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2707  aconitate hydratase  49.14 
 
 
660 aa  594  1e-168  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23930  aconitate hydratase  49.83 
 
 
649 aa  593  1e-168  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.161871  normal  0.0821905 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4177  aconitate hydratase  48.87 
 
 
647 aa  582  1e-164  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.13774  normal  0.304204 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0908  aconitate hydratase  47.45 
 
 
668 aa  575  1.0000000000000001e-163  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.410888  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4768  aconitate hydratase  46.94 
 
 
674 aa  577  1.0000000000000001e-163  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.682164  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2774  aconitate hydratase  45.88 
 
 
661 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4932  aconitate hydratase  48.95 
 
 
652 aa  567  1e-160  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450299  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05770  aconitate hydratase  47.16 
 
 
647 aa  566  1e-160  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.295611  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5705  aconitate hydratase  47.29 
 
 
659 aa  567  1e-160  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.762683  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2824  aconitate hydratase  46 
 
 
660 aa  550  1e-155  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1482  aconitate hydratase  36.39 
 
 
754 aa  343  5e-93  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1208  aconitate hydratase  37.17 
 
 
756 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.2348  normal  0.0471939 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1408  aconitate hydratase  34.73 
 
 
755 aa  327  4.0000000000000003e-88  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2025  aconitate hydratase  35.57 
 
 
755 aa  322  9.999999999999999e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2223  aconitate hydratase  35.41 
 
 
755 aa  321  3e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274844  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND02620  aconitase, putative  34.83 
 
 
792 aa  313  4.999999999999999e-84  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2016  aconitate hydratase  34.42 
 
 
757 aa  311  2.9999999999999997e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00964954 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03894  aconitate hydratase, mitochondrial, putative (Eurofung)  34.29 
 
 
796 aa  310  4e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.26439  normal  0.611037 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01770  aconitate hydratase, putative  34.18 
 
 
787 aa  306  6e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00912812  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2702  aconitate hydratase  34.18 
 
 
751 aa  306  6e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0660  aconitate hydratase  34.47 
 
 
758 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1952  aconitate hydratase  34.02 
 
 
765 aa  305  2.0000000000000002e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0971  aconitate hydratase  33.38 
 
 
760 aa  303  6.000000000000001e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05300  aconitate hydratase, putative (Eurofung)  32.07 
 
 
798 aa  302  2e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.29403  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90724  aconitate hydratase  31.56 
 
 
800 aa  301  3e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.319181 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85181  Aconitase, mitochondrial  33.28 
 
 
780 aa  300  4e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.154992  normal  0.331758 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01590  aconitate hydratase, putative  33.38 
 
 
770 aa  298  3e-79  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00945  aconitate hydratase  32.79 
 
 
755 aa  290  8e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.181334  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05525  Aconitase Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J267]  32.63 
 
 
783 aa  283  5.000000000000001e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.842678 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1466  homoaconitate hydratase family protein  35.73 
 
 
429 aa  272  2e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0167474  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0646  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.6 
 
 
418 aa  268  2e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00455068  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1100  3-isopropylmalate dehydratase  36.54 
 
 
418 aa  267  4e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0621  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.36 
 
 
418 aa  266  8.999999999999999e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0188797  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1704  homoaconitate hydratase family protein  34.94 
 
 
419 aa  264  3e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0448  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.08 
 
 
417 aa  261  2e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0425  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.56 
 
 
431 aa  258  2e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0356  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.14 
 
 
420 aa  257  4e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.928431  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_390  aconitase/homoaconitase/3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  36.36 
 
 
417 aa  256  7e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2254  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.9 
 
 
421 aa  255  2.0000000000000002e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3219  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.48 
 
 
418 aa  254  3e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1191  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  36.28 
 
 
424 aa  254  3e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0519  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.38 
 
 
424 aa  254  4.0000000000000004e-66  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000192959  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0596  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.99 
 
 
420 aa  253  8.000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000659262  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2075  3-isopropylmalate dehydratase  35.32 
 
 
416 aa  253  9.000000000000001e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1630  3-isopropylmalate dehydratase  35.65 
 
 
418 aa  253  1e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0129  homoaconitate hydratase family protein  35.8 
 
 
418 aa  251  4e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.525388  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0402  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.29 
 
 
418 aa  250  5e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.344506 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1588  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  36.45 
 
 
419 aa  249  1e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1458  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.34 
 
 
419 aa  246  9e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.888399  normal  0.260054 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0390  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.58 
 
 
419 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2220  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  34.53 
 
 
415 aa  244  3e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21050  hypothetical protein  30.28 
 
 
781 aa  243  7.999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10870  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  36.73 
 
 
420 aa  242  1e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1742  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.53 
 
 
420 aa  243  1e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.482523  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1102  3-isopropylmalate dehydratase  36.1 
 
 
437 aa  240  6.999999999999999e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1792  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37 
 
 
418 aa  240  6.999999999999999e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.602442 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2142  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.2 
 
 
419 aa  238  3e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.245729  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0015  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.14 
 
 
418 aa  237  5.0000000000000005e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0747  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.11 
 
 
416 aa  236  7e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2485  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.07 
 
 
424 aa  236  8e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.836058  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2101  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.71 
 
 
429 aa  236  8e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0493977  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0828  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.87 
 
 
416 aa  236  9e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3356  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  37.29 
 
 
421 aa  236  1.0000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1610  homoaconitate hydratase family protein  34.76 
 
 
417 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0383  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38 
 
 
417 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2211  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.15 
 
 
419 aa  235  2.0000000000000002e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00871543  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2338  homoaconitate hydratase family protein  33.41 
 
 
418 aa  234  3e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2965  homoaconitase  29.71 
 
 
655 aa  234  3e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.556593  normal  0.646893 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>