More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1612 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2774  aconitate hydratase  54.7 
 
 		 661 aa  692    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3193  aconitate hydratase  53.63 
 
 		 640 aa  640    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.249489  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2445  aconitate hydratase  75.58 
 
 		 645 aa  1026    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.430041  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0524  aconitate hydratase  55.97 
 
 		 643 aa  709    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000206753  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0423  aconitate hydratase  57.76 
 
 		 645 aa  708    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.82263  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4932  aconitate hydratase  54.11 
 
 		 652 aa  685    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0908  aconitate hydratase  55.45 
 
 		 668 aa  712    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.410888  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2258  aconitate hydratase  73.87 
 
 		 648 aa  996    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0416  aconitate hydratase  57.85 
 
 		 639 aa  713    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1803  aconitate hydratase  50.62 
 
 		 657 aa  635    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2707  aconitate hydratase  56.48 
 
 		 660 aa  733    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05770  aconitate hydratase  55.23 
 
 		 647 aa  672    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.295611  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1966  aconitate hydratase  73.87 
 
 		 648 aa  996    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2450  aconitate hydratase  68.74 
 
 		 644 aa  920    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2763  aconitate hydratase  74.38 
 
 		 648 aa  1008    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1406  aconitate hydratase  53.64 
 
 		 643 aa  667    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.258962  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1336  aconitate hydratase  51.16 
 
 		 656 aa  635    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3383  aconitate hydratase  51.08 
 
 		 657 aa  639    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4768  aconitate hydratase  52.02 
 
 		 674 aa  670    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.682164  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1882  aconitate hydratase  56.45 
 
 		 641 aa  681    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.111034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2176  aconitate hydratase  53.03 
 
 		 642 aa  679    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0828952  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4177  aconitate hydratase  56.23 
 
 		 647 aa  710    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.13774  normal  0.304204 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0020  aconitate hydratase  54.42 
 
 		 644 aa  671    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3640  aconitate hydratase  52.92 
 
 		 656 aa  683    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.506746  normal  0.0138117 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0606  aconitate hydratase  56.46 
 
 		 655 aa  713    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3158  aconitate hydratase  54.04 
 
 		 642 aa  694    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107146  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2824  aconitate hydratase  52.64 
 
 		 660 aa  642    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1265  aconitate hydratase  77.55 
 
 		 644 aa  1054    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3767  aconitate hydratase  54.98 
 
 		 640 aa  707    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1612  aconitate hydratase  100 
 
 		 646 aa  1315    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0585  aconitate hydratase  57.76 
 
 		 645 aa  708    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.674704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0285  aconitate hydratase  53.58 
 
 		 646 aa  667    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2106  aconitate hydratase  68.48 
 
 		 645 aa  909    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.12781  normal  0.0131142 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5705  aconitate hydratase  56.57 
 
 		 659 aa  711    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.762683  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23930  aconitate hydratase  52.64 
 
 		 649 aa  704    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.161871  normal  0.0821905 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1930  aconitate hydratase  54.4 
 
 		 642 aa  669    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.221002  normal  0.0834672 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3021  aconitate hydratase  52.71 
 
 		 641 aa  632  1e-180  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2153  aconitate hydratase  50.78 
 
 		 644 aa  627  1e-178  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1771  aconitate hydratase  51.24 
 
 		 641 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0597  aconitate hydratase  50 
 
 		 658 aa  607  9.999999999999999e-173  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1102  aconitate hydratase  49.07 
 
 		 642 aa  603  1.0000000000000001e-171  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0098  aconitate hydratase  48.86 
 
 		 661 aa  596  1e-169  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1482  aconitate hydratase  34.44 
 
 		 754 aa  340  5.9999999999999996e-92  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1408  aconitate hydratase  33.98 
 
 		 755 aa  339  9.999999999999999e-92  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0971  aconitate hydratase  35.16 
 
 		 760 aa  332  2e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2025  aconitate hydratase  34.21 
 
 		 755 aa  330  5.0000000000000004e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2223  aconitate hydratase  34.39 
 
 		 755 aa  327  4.0000000000000003e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1208  aconitate hydratase  34.06 
 
 		 756 aa  325  2e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.2348  normal  0.0471939 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01590  aconitate hydratase, putative  31.89 
 
 		 770 aa  322  9.999999999999999e-87  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03894  aconitate hydratase, mitochondrial, putative (Eurofung)  33.83 
 
 		 796 aa  321  3e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.26439  normal  0.611037 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0660  aconitate hydratase  33.43 
 
 		 758 aa  318  2e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00945  aconitate hydratase  34.72 
 
 		 755 aa  318  3e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.181334  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01770  aconitate hydratase, putative  33.61 
 
 		 787 aa  318  3e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00912812  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02620  aconitase, putative  33.43 
 
 		 792 aa  315  1.9999999999999998e-84  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05300  aconitate hydratase, putative (Eurofung)  34.06 
 
 		 798 aa  310  4e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.29403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90724  aconitate hydratase  31.94 
 
 		 800 aa  310  5e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.319181 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2702  aconitate hydratase  32.34 
 
 		 751 aa  307  4.0000000000000004e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2016  aconitate hydratase  33.52 
 
 		 757 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964954 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05525  Aconitase Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J267]  33.84 
 
 		 783 aa  304  4.0000000000000003e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.842678 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85181  Aconitase, mitochondrial  33.69 
 
 		 780 aa  304  4.0000000000000003e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.154992  normal  0.331758 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1952  aconitate hydratase  31.23 
 
 		 765 aa  300  4e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0402  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.05 
 
 		 418 aa  246  8e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.344506 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0646  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.73 
 
 		 418 aa  237  6e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00455068  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0621  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.73 
 
 		 418 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0188797  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2965  homoaconitase  29.62 
 
 		 655 aa  229  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.556593  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_002936  DET0448  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.69 
 
 		 417 aa  226  1e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1100  3-isopropylmalate dehydratase  33.97 
 
 		 418 aa  225  2e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0425  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.69 
 
 		 431 aa  224  4.9999999999999996e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2220  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  35.42 
 
 		 415 aa  224  4.9999999999999996e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1588  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  33.09 
 
 		 419 aa  223  9.999999999999999e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_390  aconitase/homoaconitase/3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  34.45 
 
 		 417 aa  222  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1630  3-isopropylmalate dehydratase  33.01 
 
 		 418 aa  220  5e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1704  homoaconitate hydratase family protein  33.17 
 
 		 419 aa  216  8e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1742  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.46 
 
 		 420 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.482523  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1792  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.41 
 
 		 418 aa  211  3e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.602442 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1036  homoaconitate hydratase family protein  33.81 
 
 		 418 aa  211  3e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0390  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.65 
 
 		 419 aa  211  4e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1466  homoaconitate hydratase family protein  30.31 
 
 		 429 aa  211  5e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0167474  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1458  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.52 
 
 		 419 aa  210  6e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.888399  normal  0.260054 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0596  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.41 
 
 		 420 aa  210  6e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0356  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.13 
 
 		 420 aa  209  1e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.928431  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0506  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  32.71 
 
 		 420 aa  207  6e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1610  homoaconitate hydratase family protein  33.25 
 
 		 417 aa  206  8e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0626  aconitate hydratase  28.77 
 
 		 895 aa  206  9e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1467  aconitate hydratase  29.67 
 
 		 840 aa  206  1e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2338  homoaconitate hydratase family protein  32.78 
 
 		 418 aa  204  6e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0519  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  30.9 
 
 		 424 aa  203  8e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000192959  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2458  hypothetical protein  25.92 
 
 		 763 aa  203  9e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0160078  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2254  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.28 
 
 		 421 aa  203  9e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2068  aconitate hydratase 1  28 
 
 		 855 aa  202  9.999999999999999e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.461258  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0105  aconitate hydratase  27.98 
 
 		 861 aa  202  9.999999999999999e-51  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.227514  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0442  3-isopropylmalate dehydratase  37.88 
 
 		 423 aa  201  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0357426 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1191  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  32.46 
 
 		 424 aa  202  1.9999999999999998e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2728  3-isopropylmalate dehydratase  37.88 
 
 		 416 aa  202  1.9999999999999998e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0376  3-isopropylmalate dehydratase  32.54 
 
 		 416 aa  202  1.9999999999999998e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88705  homoaconitase  28.48 
 
 		 677 aa  201  3e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.933626  normal  0.508507 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2485  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  32.46 
 
 		 424 aa  200  6e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.836058  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10870  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  32.3 
 
 		 420 aa  200  7.999999999999999e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3516  3-isopropylmalate dehydratase  34.2 
 
 		 410 aa  199  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2075  3-isopropylmalate dehydratase  31.63 
 
 		 416 aa  197  6e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>