More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_00945 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001302  ANIA_03894  aconitate hydratase, mitochondrial, putative (Eurofung)  49.47 
 
 		 796 aa  734    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.26439  normal  0.611037 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05300  aconitate hydratase, putative (Eurofung)  50.59 
 
 		 798 aa  776    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.29403  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05525  Aconitase Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J267]  60.51 
 
 		 783 aa  929    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.842678 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00945  aconitate hydratase  100 
 
 		 755 aa  1563    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.181334  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85181  Aconitase, mitochondrial  59.08 
 
 		 780 aa  895    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.154992  normal  0.331758 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2025  aconitate hydratase  68.57 
 
 		 755 aa  1084    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90724  aconitate hydratase  52.62 
 
 		 800 aa  799    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.319181 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01770  aconitate hydratase, putative  51.96 
 
 		 787 aa  747    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00912812  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02620  aconitase, putative  58.13 
 
 		 792 aa  904    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01590  aconitate hydratase, putative  51.62 
 
 		 770 aa  789    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2016  aconitate hydratase  67.55 
 
 		 757 aa  1063    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964954 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1482  aconitate hydratase  57.35 
 
 		 754 aa  887    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1208  aconitate hydratase  68.71 
 
 		 756 aa  1073    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.2348  normal  0.0471939 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1952  aconitate hydratase  76.23 
 
 		 765 aa  1210    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0660  aconitate hydratase  75.27 
 
 		 758 aa  1172    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2223  aconitate hydratase  74.8 
 
 		 755 aa  1185    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274844  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2702  aconitate hydratase  60.13 
 
 		 751 aa  955    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0971  aconitate hydratase  76.25 
 
 		 760 aa  1219    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1408  aconitate hydratase  54.62 
 
 		 755 aa  859    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0606  aconitate hydratase  36.3 
 
 		 655 aa  370  1e-101  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0585  aconitate hydratase  37.05 
 
 		 645 aa  368  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.674704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0423  aconitate hydratase  37.05 
 
 		 645 aa  368  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.82263  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0524  aconitate hydratase  36.86 
 
 		 643 aa  364  4e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000206753  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3158  aconitate hydratase  36.29 
 
 		 642 aa  360  7e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107146  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0416  aconitate hydratase  35.89 
 
 		 639 aa  357  5e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3767  aconitate hydratase  35.22 
 
 		 640 aa  352  2e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1882  aconitate hydratase  36.19 
 
 		 641 aa  347  4e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.111034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2176  aconitate hydratase  35.5 
 
 		 642 aa  347  5e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0828952  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0285  aconitate hydratase  35.55 
 
 		 646 aa  343  5.999999999999999e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1930  aconitate hydratase  34.16 
 
 		 642 aa  342  2e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.221002  normal  0.0834672 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1771  aconitate hydratase  35.44 
 
 		 641 aa  340  5e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3193  aconitate hydratase  34.3 
 
 		 640 aa  339  9.999999999999999e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.249489  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1406  aconitate hydratase  33.38 
 
 		 643 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.258962  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1102  aconitate hydratase  33.88 
 
 		 642 aa  330  7e-89  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2445  aconitate hydratase  34.2 
 
 		 645 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.430041  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1966  aconitate hydratase  33.97 
 
 		 648 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0020  aconitate hydratase  35.51 
 
 		 644 aa  327  5e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2258  aconitate hydratase  32.74 
 
 		 648 aa  325  2e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2763  aconitate hydratase  33.1 
 
 		 648 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1265  aconitate hydratase  35.24 
 
 		 644 aa  323  9.999999999999999e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3021  aconitate hydratase  33.53 
 
 		 641 aa  320  9e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1612  aconitate hydratase  34.72 
 
 		 646 aa  318  3e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2707  aconitate hydratase  32.69 
 
 		 660 aa  312  1e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2153  aconitate hydratase  34.26 
 
 		 644 aa  305  3.0000000000000004e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2450  aconitate hydratase  34.08 
 
 		 644 aa  301  3e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2106  aconitate hydratase  31.46 
 
 		 645 aa  299  1e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.12781  normal  0.0131142 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3383  aconitate hydratase  32.85 
 
 		 657 aa  298  2e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1336  aconitate hydratase  31.4 
 
 		 656 aa  288  2e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0098  aconitate hydratase  32.84 
 
 		 661 aa  286  1.0000000000000001e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23930  aconitate hydratase  31.13 
 
 		 649 aa  285  3.0000000000000004e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.161871  normal  0.0821905 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4177  aconitate hydratase  30.77 
 
 		 647 aa  283  7.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.13774  normal  0.304204 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1803  aconitate hydratase  31.92 
 
 		 657 aa  280  9e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0597  aconitate hydratase  32.35 
 
 		 658 aa  277  4e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0908  aconitate hydratase  30.08 
 
 		 668 aa  277  5e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.410888  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4932  aconitate hydratase  29.42 
 
 		 652 aa  270  7e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2774  aconitate hydratase  29.08 
 
 		 661 aa  269  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3640  aconitate hydratase  30.01 
 
 		 656 aa  266  1e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.506746  normal  0.0138117 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5705  aconitate hydratase  29.95 
 
 		 659 aa  264  4.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.762683  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4768  aconitate hydratase  30.32 
 
 		 674 aa  254  5.000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.682164  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1467  aconitate hydratase  30.44 
 
 		 840 aa  251  3e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2068  aconitate hydratase 1  29.04 
 
 		 855 aa  240  9e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.461258  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0224  aconitase  27.76 
 
 		 907 aa  225  3e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2824  aconitate hydratase  34.86 
 
 		 660 aa  224  3e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1682  aconitate hydratase  29.06 
 
 		 906 aa  224  4e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00945136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05770  aconitate hydratase  29.26 
 
 		 647 aa  224  6e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.295611  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1224  aconitate hydratase 1  26.7 
 
 		 914 aa  220  1e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2060  aconitate hydratase  28.3 
 
 		 897 aa  219  2e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2084  aconitate hydratase 1  28.59 
 
 		 915 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.962704  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0626  aconitate hydratase  28.05 
 
 		 895 aa  217  7e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08420  aconitase  28.29 
 
 		 884 aa  216  9.999999999999999e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0660302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3296  aconitate hydratase  28.79 
 
 		 861 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0890897 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0174  aconitate hydratase 1  27.5 
 
 		 900 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0847223  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1593  aconitate hydratase  27.45 
 
 		 907 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0153252 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3580  aconitate hydratase 1  27.67 
 
 		 899 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.068843  normal  0.451076 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3408  aconitate hydratase  27.27 
 
 		 907 aa  215  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.741284  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3370  aconitate hydratase  27.27 
 
 		 907 aa  215  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3320  aconitate hydratase  27.27 
 
 		 907 aa  215  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3627  aconitate hydratase  27.27 
 
 		 907 aa  215  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0135995 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3677  aconitate hydratase  27.27 
 
 		 907 aa  215  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2264  aconitate hydratase  27.32 
 
 		 907 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02721  aconitate hydratase  27.18 
 
 		 863 aa  214  3.9999999999999995e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3724  aconitate hydratase  27.15 
 
 		 907 aa  214  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.489907  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07642  aconitate hydratase, hypothetical (Eurofung)  44.27 
 
 		 326 aa  214  5.999999999999999e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.409922  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3635  aconitate hydratase  27.33 
 
 		 907 aa  214  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533912  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3640  aconitate hydratase  27.33 
 
 		 907 aa  214  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.593974  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2866  aconitate hydratase 1  27.04 
 
 		 907 aa  213  7.999999999999999e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3302  aconitate hydratase  27.22 
 
 		 907 aa  213  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.12237  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2760  aconitate hydratase 1  27.77 
 
 		 899 aa  213  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02395  aconitate hydratase  27.63 
 
 		 869 aa  213  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4105  aconitate hydratase  28.78 
 
 		 905 aa  212  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.974309  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0620  aconitate hydratase  29.24 
 
 		 874 aa  211  3e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.343199  normal  0.507089 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1226  aconitate hydratase 1  28.95 
 
 		 912 aa  211  5e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2127  aconitate hydratase 1  28.67 
 
 		 903 aa  211  5e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.760339 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1937  aconitate hydratase  28.07 
 
 		 862 aa  211  5e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000188613 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1777  aconitate hydratase  27.88 
 
 		 862 aa  211  5e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00224724  hitchhiker  0.000953384 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2637  aconitate hydratase 1  27.84 
 
 		 899 aa  210  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2862  aconitate hydratase 1  27.84 
 
 		 899 aa  210  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4049  aconitate hydratase  28.05 
 
 		 863 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2030  aconitate hydratase  26.63 
 
 		 890 aa  208  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.326085  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2230  aconitate hydratase  26.63 
 
 		 890 aa  209  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000744692  decreased coverage  0.000375286 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>