More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0585 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0585  aconitate hydratase  100 
 
 		 645 aa  1310    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.674704  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2445  aconitate hydratase  55.99 
 
 		 645 aa  704    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.430041  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2153  aconitate hydratase  52.47 
 
 		 644 aa  676    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3193  aconitate hydratase  56.47 
 
 		 640 aa  673    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.249489  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1265  aconitate hydratase  56.39 
 
 		 644 aa  724    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1966  aconitate hydratase  56.92 
 
 		 648 aa  702    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1336  aconitate hydratase  51.45 
 
 		 656 aa  656    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2707  aconitate hydratase  53.57 
 
 		 660 aa  675    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2258  aconitate hydratase  57.36 
 
 		 648 aa  706    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2450  aconitate hydratase  55.3 
 
 		 644 aa  680    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3383  aconitate hydratase  50.54 
 
 		 657 aa  649    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2763  aconitate hydratase  55.75 
 
 		 648 aa  694    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1406  aconitate hydratase  58.31 
 
 		 643 aa  711    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.258962  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1882  aconitate hydratase  65.16 
 
 		 641 aa  799    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.111034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5705  aconitate hydratase  52.24 
 
 		 659 aa  640    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.762683  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1612  aconitate hydratase  57.76 
 
 		 646 aa  708    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0423  aconitate hydratase  100 
 
 		 645 aa  1310    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.82263  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2824  aconitate hydratase  53.01 
 
 		 660 aa  649    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1771  aconitate hydratase  54.98 
 
 		 641 aa  668    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0416  aconitate hydratase  61.37 
 
 		 639 aa  813    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0020  aconitate hydratase  62.15 
 
 		 644 aa  781    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2176  aconitate hydratase  58.94 
 
 		 642 aa  791    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0828952  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0285  aconitate hydratase  58.79 
 
 		 646 aa  726    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2106  aconitate hydratase  55.9 
 
 		 645 aa  688    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.12781  normal  0.0131142 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0524  aconitate hydratase  59.84 
 
 		 643 aa  787    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000206753  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0606  aconitate hydratase  60.49 
 
 		 655 aa  791    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1102  aconitate hydratase  50.86 
 
 		 642 aa  644    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0098  aconitate hydratase  50.77 
 
 		 661 aa  638    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1930  aconitate hydratase  59.47 
 
 		 642 aa  734    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.221002  normal  0.0834672 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1803  aconitate hydratase  51.31 
 
 		 657 aa  644    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3158  aconitate hydratase  61.53 
 
 		 642 aa  821    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107146  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3021  aconitate hydratase  58.31 
 
 		 641 aa  691    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3767  aconitate hydratase  64.12 
 
 		 640 aa  840    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23930  aconitate hydratase  50.62 
 
 		 649 aa  633  1e-180  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.161871  normal  0.0821905 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2774  aconitate hydratase  51 
 
 		 661 aa  634  1e-180  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0597  aconitate hydratase  50.23 
 
 		 658 aa  628  1e-179  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3640  aconitate hydratase  50.46 
 
 		 656 aa  620  1e-176  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.506746  normal  0.0138117 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0908  aconitate hydratase  49.46 
 
 		 668 aa  618  1e-175  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.410888  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4177  aconitate hydratase  51.26 
 
 		 647 aa  604  1.0000000000000001e-171  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.13774  normal  0.304204 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4768  aconitate hydratase  48.92 
 
 		 674 aa  600  1e-170  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.682164  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05770  aconitate hydratase  50.31 
 
 		 647 aa  599  1e-170  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.295611  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4932  aconitate hydratase  49.92 
 
 		 652 aa  593  1e-168  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0971  aconitate hydratase  38.28 
 
 		 760 aa  396  1e-109  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2223  aconitate hydratase  40.33 
 
 		 755 aa  392  1e-107  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1408  aconitate hydratase  39.88 
 
 		 755 aa  387  1e-106  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1208  aconitate hydratase  38.71 
 
 		 756 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.2348  normal  0.0471939 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1482  aconitate hydratase  37.63 
 
 		 754 aa  384  1e-105  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0660  aconitate hydratase  37.93 
 
 		 758 aa  380  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2016  aconitate hydratase  37.91 
 
 		 757 aa  378  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964954 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2025  aconitate hydratase  40.35 
 
 		 755 aa  374  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00945  aconitate hydratase  37.05 
 
 		 755 aa  368  1e-100  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.181334  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1952  aconitate hydratase  38.75 
 
 		 765 aa  364  3e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05300  aconitate hydratase, putative (Eurofung)  36.45 
 
 		 798 aa  362  2e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.29403  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01770  aconitate hydratase, putative  36.2 
 
 		 787 aa  359  9.999999999999999e-98  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00912812  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05525  Aconitase Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J267]  36.16 
 
 		 783 aa  356  6.999999999999999e-97  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.842678 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85181  Aconitase, mitochondrial  37.33 
 
 		 780 aa  356  8.999999999999999e-97  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.154992  normal  0.331758 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90724  aconitate hydratase  37.44 
 
 		 800 aa  354  2e-96  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.319181 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2702  aconitate hydratase  34.3 
 
 		 751 aa  353  4e-96  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01590  aconitate hydratase, putative  36.79 
 
 		 770 aa  352  1e-95  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02620  aconitase, putative  34.76 
 
 		 792 aa  336  7.999999999999999e-91  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03894  aconitate hydratase, mitochondrial, putative (Eurofung)  36.7 
 
 		 796 aa  333  5e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.26439  normal  0.611037 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0621  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.5 
 
 		 418 aa  270  7e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0188797  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0646  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.5 
 
 		 418 aa  268  2.9999999999999995e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00455068  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2220  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  37.8 
 
 		 415 aa  265  1e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1704  homoaconitate hydratase family protein  34.95 
 
 		 419 aa  260  5.0000000000000005e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1466  homoaconitate hydratase family protein  35.17 
 
 		 429 aa  258  2e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0167474  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1630  3-isopropylmalate dehydratase  36.36 
 
 		 418 aa  258  3e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2965  homoaconitase  31.72 
 
 		 655 aa  255  2.0000000000000002e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.556593  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0402  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.69 
 
 		 418 aa  254  3e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.344506 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1100  3-isopropylmalate dehydratase  36.54 
 
 		 418 aa  254  3e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0289  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.51 
 
 		 425 aa  248  3e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88705  homoaconitase  28.72 
 
 		 677 aa  247  6e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.933626  normal  0.508507 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1030  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.56 
 
 		 431 aa  242  1e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000620705 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0376  3-isopropylmalate dehydratase  36.36 
 
 		 416 aa  241  2.9999999999999997e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0596  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.39 
 
 		 420 aa  241  4e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2338  homoaconitate hydratase family protein  35.8 
 
 		 418 aa  238  2e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0390  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.59 
 
 		 419 aa  238  2e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0471  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.19 
 
 		 424 aa  238  3e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.699773  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0436  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.88 
 
 		 424 aa  237  6e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.560563  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3219  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.53 
 
 		 418 aa  236  7e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0448  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.63 
 
 		 417 aa  236  9e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1906  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.81 
 
 		 426 aa  236  9e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0606993  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0425  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.89 
 
 		 431 aa  236  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1458  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.88 
 
 		 419 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.888399  normal  0.260054 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2737  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.98 
 
 		 427 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000214153  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1504  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.21 
 
 		 427 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.691126 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0399  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.19 
 
 		 424 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.320252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1191  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  33.97 
 
 		 424 aa  234  4.0000000000000004e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1520  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.8 
 
 		 424 aa  233  9e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.984893  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_390  aconitase/homoaconitase/3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  35.39 
 
 		 417 aa  232  2e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1036  homoaconitate hydratase family protein  36.52 
 
 		 418 aa  231  3e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2728  3-isopropylmalate dehydratase  37.91 
 
 		 416 aa  231  3e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2075  3-isopropylmalate dehydratase  34.21 
 
 		 416 aa  231  4e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3516  3-isopropylmalate dehydratase  37.05 
 
 		 410 aa  231  4e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1588  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  33.57 
 
 		 419 aa  230  5e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00580  homoaconitate hydratase, putative  30.86 
 
 		 728 aa  230  6e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0741  homoaconitate hydratase family protein  36.78 
 
 		 432 aa  230  7e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375835  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0129  homoaconitate hydratase family protein  33.65 
 
 		 418 aa  229  9e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.525388  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0506  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.55 
 
 		 420 aa  229  9e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1903  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.89 
 
 		 427 aa  229  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473608  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>