More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0971 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001302  ANIA_03894  aconitate hydratase, mitochondrial, putative (Eurofung)  52.51 
 
 		 796 aa  754    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.26439  normal  0.611037 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05300  aconitate hydratase, putative (Eurofung)  51.05 
 
 		 798 aa  772    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.29403  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05525  Aconitase Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J267]  60 
 
 		 783 aa  913    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.842678 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2025  aconitate hydratase  70.28 
 
 		 755 aa  1104    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01770  aconitate hydratase, putative  51.11 
 
 		 787 aa  733    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00912812  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02620  aconitase, putative  59.08 
 
 		 792 aa  899    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01590  aconitate hydratase, putative  51.74 
 
 		 770 aa  782    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0971  aconitate hydratase  100 
 
 		 760 aa  1577    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00945  aconitate hydratase  76.25 
 
 		 755 aa  1219    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.181334  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1952  aconitate hydratase  78.91 
 
 		 765 aa  1246    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85181  Aconitase, mitochondrial  60.4 
 
 		 780 aa  899    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.154992  normal  0.331758 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1208  aconitate hydratase  70.77 
 
 		 756 aa  1103    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.2348  normal  0.0471939 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1408  aconitate hydratase  55.93 
 
 		 755 aa  855    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90724  aconitate hydratase  54.97 
 
 		 800 aa  825    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.319181 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1482  aconitate hydratase  56.97 
 
 		 754 aa  882    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2223  aconitate hydratase  75.5 
 
 		 755 aa  1203    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0660  aconitate hydratase  76.12 
 
 		 758 aa  1201    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2702  aconitate hydratase  60.29 
 
 		 751 aa  951    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2016  aconitate hydratase  70.01 
 
 		 757 aa  1108    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964954 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0585  aconitate hydratase  38.28 
 
 		 645 aa  396  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.674704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0423  aconitate hydratase  38.28 
 
 		 645 aa  396  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.82263  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3767  aconitate hydratase  37.18 
 
 		 640 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0606  aconitate hydratase  36.82 
 
 		 655 aa  386  1e-106  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0524  aconitate hydratase  37.91 
 
 		 643 aa  378  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000206753  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0416  aconitate hydratase  37.39 
 
 		 639 aa  376  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2176  aconitate hydratase  37.08 
 
 		 642 aa  370  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0828952  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1882  aconitate hydratase  37.38 
 
 		 641 aa  371  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.111034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0020  aconitate hydratase  36.2 
 
 		 644 aa  370  1e-101  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0285  aconitate hydratase  36.31 
 
 		 646 aa  363  8e-99  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3158  aconitate hydratase  34.92 
 
 		 642 aa  363  9e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107146  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3193  aconitate hydratase  34.88 
 
 		 640 aa  360  4e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.249489  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1406  aconitate hydratase  34.52 
 
 		 643 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.258962  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1930  aconitate hydratase  34.68 
 
 		 642 aa  352  1e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.221002  normal  0.0834672 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1771  aconitate hydratase  34.56 
 
 		 641 aa  347  4e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1265  aconitate hydratase  34.75 
 
 		 644 aa  345  2e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1966  aconitate hydratase  33.93 
 
 		 648 aa  344  4e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1102  aconitate hydratase  35.64 
 
 		 642 aa  343  5.999999999999999e-93  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3021  aconitate hydratase  35.07 
 
 		 641 aa  342  2e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2258  aconitate hydratase  34.15 
 
 		 648 aa  340  5e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2445  aconitate hydratase  34.15 
 
 		 645 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.430041  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2763  aconitate hydratase  33.79 
 
 		 648 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1612  aconitate hydratase  35.16 
 
 		 646 aa  332  2e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2153  aconitate hydratase  35.02 
 
 		 644 aa  322  1.9999999999999998e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2106  aconitate hydratase  33.65 
 
 		 645 aa  317  7e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.12781  normal  0.0131142 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2450  aconitate hydratase  35.19 
 
 		 644 aa  313  4.999999999999999e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2824  aconitate hydratase  35.05 
 
 		 660 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1803  aconitate hydratase  34.02 
 
 		 657 aa  304  4.0000000000000003e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3383  aconitate hydratase  32.88 
 
 		 657 aa  303  7.000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4177  aconitate hydratase  32.74 
 
 		 647 aa  303  1e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.13774  normal  0.304204 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2707  aconitate hydratase  32.64 
 
 		 660 aa  301  4e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0098  aconitate hydratase  32.65 
 
 		 661 aa  300  5e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1336  aconitate hydratase  32.57 
 
 		 656 aa  300  5e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3640  aconitate hydratase  33.33 
 
 		 656 aa  298  2e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.506746  normal  0.0138117 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23930  aconitate hydratase  31.6 
 
 		 649 aa  293  1e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.161871  normal  0.0821905 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0597  aconitate hydratase  33.38 
 
 		 658 aa  291  2e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0908  aconitate hydratase  31.6 
 
 		 668 aa  290  6e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.410888  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2774  aconitate hydratase  31.54 
 
 		 661 aa  290  9e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5705  aconitate hydratase  32.17 
 
 		 659 aa  288  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.762683  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4932  aconitate hydratase  33.58 
 
 		 652 aa  288  4e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4768  aconitate hydratase  33.09 
 
 		 674 aa  282  2e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.682164  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05770  aconitate hydratase  31.96 
 
 		 647 aa  258  4e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.295611  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1467  aconitate hydratase  29.35 
 
 		 840 aa  248  4e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2068  aconitate hydratase 1  29.38 
 
 		 855 aa  237  5.0000000000000005e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.461258  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6080  aconitate hydratase  28.55 
 
 		 865 aa  228  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.76062 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2301  aconitate hydratase  27.78 
 
 		 865 aa  224  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22008 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02721  aconitate hydratase  26.82 
 
 		 863 aa  222  1.9999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0828  aconitate hydratase  28.19 
 
 		 883 aa  220  7e-56  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00982227  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1682  aconitate hydratase  28.62 
 
 		 906 aa  219  1e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00945136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2264  aconitate hydratase  29.36 
 
 		 907 aa  219  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3296  aconitate hydratase  27.81 
 
 		 861 aa  219  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0890897 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1031  aconitate hydratase  27.9 
 
 		 875 aa  217  5e-55  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0224  aconitase  27.73 
 
 		 907 aa  217  7e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5861  aconitate hydratase  27.11 
 
 		 875 aa  217  7e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.370174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4023  aconitate hydratase  27.92 
 
 		 871 aa  217  8e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4049  aconitate hydratase  27.65 
 
 		 863 aa  216  9e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3947  aconitate hydratase  27.65 
 
 		 867 aa  216  9e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003390  2-methylcitrate dehydratase FeS dependent  28.2 
 
 		 863 aa  216  9.999999999999999e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.828333  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3587  aconitate hydratase  27.25 
 
 		 875 aa  216  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00350966 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2603  aconitate hydratase  27.62 
 
 		 872 aa  216  9.999999999999999e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120412  hitchhiker  0.000028644 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3646  aconitate hydratase  27.65 
 
 		 871 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2497  aconitate hydratase  28.27 
 
 		 869 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00662485 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3408  aconitate hydratase  29.02 
 
 		 907 aa  216  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.741284  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3370  aconitate hydratase  29.02 
 
 		 907 aa  216  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3320  aconitate hydratase  29.02 
 
 		 907 aa  216  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1925  aconitate hydratase  27.86 
 
 		 916 aa  216  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128572  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3677  aconitate hydratase  29.02 
 
 		 907 aa  216  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4142  aconitate hydratase  27.65 
 
 		 863 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3627  aconitate hydratase  29.02 
 
 		 907 aa  216  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0135995 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6708  aconitate hydratase  27.25 
 
 		 870 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3635  aconitate hydratase  28.89 
 
 		 907 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533912  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2866  aconitate hydratase 1  28.18 
 
 		 907 aa  215  2.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2113  aconitate hydratase  27.19 
 
 		 868 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0285  aconitate hydratase  28.54 
 
 		 917 aa  215  2.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.016836  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2060  aconitate hydratase  28.01 
 
 		 897 aa  214  3.9999999999999995e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0954  aconitate hydratase  28.93 
 
 		 868 aa  214  3.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3640  aconitate hydratase  28.89 
 
 		 907 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.593974  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1859  aconitate hydratase  26.39 
 
 		 870 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5346  aconitate hydratase  28.55 
 
 		 864 aa  214  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.992618  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4757  aconitate hydratase  28.55 
 
 		 864 aa  214  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.592103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5515  aconitate hydratase  28.55 
 
 		 864 aa  214  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.12009  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>