More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_90724 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001302  ANIA_03894  aconitate hydratase, mitochondrial, putative (Eurofung)  63.85 
 
 
796 aa  980    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.26439  normal  0.611037 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05300  aconitate hydratase, putative (Eurofung)  48.77 
 
 
798 aa  761    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.29403  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05525  Aconitase Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J267]  56.71 
 
 
783 aa  858    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.842678 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2016  aconitate hydratase  55.5 
 
 
757 aa  800    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00964954 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90724  aconitate hydratase  100 
 
 
800 aa  1660    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.319181 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0660  aconitate hydratase  54.88 
 
 
758 aa  772    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01770  aconitate hydratase, putative  61.85 
 
 
787 aa  962    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00912812  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02620  aconitase, putative  57.5 
 
 
792 aa  894    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01590  aconitate hydratase, putative  50.53 
 
 
770 aa  765    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2025  aconitate hydratase  55.48 
 
 
755 aa  792    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2702  aconitate hydratase  51.98 
 
 
751 aa  760    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1408  aconitate hydratase  49.28 
 
 
755 aa  748    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1482  aconitate hydratase  50.33 
 
 
754 aa  755    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1208  aconitate hydratase  52.98 
 
 
756 aa  772    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.2348  normal  0.0471939 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85181  Aconitase, mitochondrial  53.88 
 
 
780 aa  840    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.154992  normal  0.331758 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1952  aconitate hydratase  54.29 
 
 
765 aa  802    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2223  aconitate hydratase  55.27 
 
 
755 aa  789    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274844  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00945  aconitate hydratase  52.62 
 
 
755 aa  799    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.181334  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0971  aconitate hydratase  54.97 
 
 
760 aa  825    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0606  aconitate hydratase  36.76 
 
 
655 aa  370  1e-101  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3767  aconitate hydratase  34.77 
 
 
640 aa  360  6e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0423  aconitate hydratase  37.44 
 
 
645 aa  354  2.9999999999999997e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.82263  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0585  aconitate hydratase  37.44 
 
 
645 aa  354  2.9999999999999997e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.674704  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0285  aconitate hydratase  35.64 
 
 
646 aa  353  8e-96  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0416  aconitate hydratase  33.91 
 
 
639 aa  352  1e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1406  aconitate hydratase  33.74 
 
 
643 aa  350  7e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.258962  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1882  aconitate hydratase  35.79 
 
 
641 aa  344  4e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.111034  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3158  aconitate hydratase  33.51 
 
 
642 aa  341  2.9999999999999998e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107146  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1771  aconitate hydratase  32.97 
 
 
641 aa  341  2.9999999999999998e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1930  aconitate hydratase  32.93 
 
 
642 aa  341  2.9999999999999998e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.221002  normal  0.0834672 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1102  aconitate hydratase  32.93 
 
 
642 aa  339  9.999999999999999e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3193  aconitate hydratase  32.88 
 
 
640 aa  339  9.999999999999999e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.249489  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2176  aconitate hydratase  33.88 
 
 
642 aa  337  5e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0828952  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0020  aconitate hydratase  34.15 
 
 
644 aa  328  3e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0524  aconitate hydratase  34.91 
 
 
643 aa  326  1e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000206753  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3021  aconitate hydratase  32.84 
 
 
641 aa  320  5e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2763  aconitate hydratase  34.31 
 
 
648 aa  320  9e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1265  aconitate hydratase  33.15 
 
 
644 aa  317  4e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2258  aconitate hydratase  32.56 
 
 
648 aa  316  9.999999999999999e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2106  aconitate hydratase  32.44 
 
 
645 aa  313  1e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.12781  normal  0.0131142 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1612  aconitate hydratase  31.94 
 
 
646 aa  310  5.9999999999999995e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2445  aconitate hydratase  33.74 
 
 
645 aa  310  8e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.430041  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3383  aconitate hydratase  32.35 
 
 
657 aa  308  2.0000000000000002e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1803  aconitate hydratase  32.7 
 
 
657 aa  307  4.0000000000000004e-82  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1966  aconitate hydratase  31.92 
 
 
648 aa  308  4.0000000000000004e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2824  aconitate hydratase  33.53 
 
 
660 aa  307  4.0000000000000004e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2450  aconitate hydratase  32.7 
 
 
644 aa  307  5.0000000000000004e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1336  aconitate hydratase  33.24 
 
 
656 aa  303  1e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2707  aconitate hydratase  31.58 
 
 
660 aa  301  4e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2153  aconitate hydratase  33.75 
 
 
644 aa  299  1e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0098  aconitate hydratase  32.94 
 
 
661 aa  292  1e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0597  aconitate hydratase  31.56 
 
 
658 aa  292  2e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23930  aconitate hydratase  31.01 
 
 
649 aa  288  4e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.161871  normal  0.0821905 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4177  aconitate hydratase  32.25 
 
 
647 aa  287  5e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.13774  normal  0.304204 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5705  aconitate hydratase  31.4 
 
 
659 aa  287  7e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.762683  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2774  aconitate hydratase  31.37 
 
 
661 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0908  aconitate hydratase  29.89 
 
 
668 aa  282  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.410888  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3640  aconitate hydratase  30.92 
 
 
656 aa  271  2e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.506746  normal  0.0138117 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4932  aconitate hydratase  29.95 
 
 
652 aa  269  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450299  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05770  aconitate hydratase  29.25 
 
 
647 aa  263  1e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.295611  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4768  aconitate hydratase  30.35 
 
 
674 aa  254  4.0000000000000004e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.682164  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07642  aconitate hydratase, hypothetical (Eurofung)  50 
 
 
326 aa  249  2e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.409922  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1467  aconitate hydratase  28.5 
 
 
840 aa  227  6e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2068  aconitate hydratase 1  28.75 
 
 
855 aa  224  4.9999999999999996e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.461258  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1246  aconitate hydratase  27.74 
 
 
887 aa  210  7e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2603  aconitate hydratase  29.46 
 
 
872 aa  206  9e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120412  hitchhiker  0.000028644 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1309  aconitate hydratase  28 
 
 
885 aa  202  9.999999999999999e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2861  aconitase  26.16 
 
 
891 aa  203  9.999999999999999e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.509308  normal  0.643421 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02395  aconitate hydratase  28.23 
 
 
869 aa  199  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1112  aconitate hydratase  27.65 
 
 
885 aa  199  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.58218 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003390  2-methylcitrate dehydratase FeS dependent  28.42 
 
 
863 aa  197  8.000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.828333  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2060  aconitate hydratase  26.23 
 
 
897 aa  196  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0954  aconitate hydratase  26.3 
 
 
868 aa  195  3e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1925  aconitate hydratase  25.47 
 
 
916 aa  194  4e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128572  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08420  aconitase  28.35 
 
 
884 aa  194  4e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0660302  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3871  aconitate hydratase  27.4 
 
 
888 aa  193  9e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309785  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1859  aconitate hydratase  27.36 
 
 
870 aa  193  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0212  aconitate hydratase  26.62 
 
 
895 aa  192  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2113  aconitate hydratase  27.89 
 
 
868 aa  191  5e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1777  aconitate hydratase  26.56 
 
 
862 aa  191  5e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00224724  hitchhiker  0.000953384 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0365  aconitate hydratase  26.37 
 
 
872 aa  190  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0804  aconitate hydratase  26.89 
 
 
873 aa  189  2e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0916  aconitate hydratase 1  26.97 
 
 
904 aa  188  3e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02721  aconitate hydratase  26.23 
 
 
863 aa  188  3e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1421  aconitate hydratase  27.51 
 
 
868 aa  187  6e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0408  aconitate hydratase  25.51 
 
 
905 aa  187  7e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6080  aconitate hydratase  27.2 
 
 
865 aa  187  9e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.76062 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1766  aconitate hydratase  26.82 
 
 
864 aa  187  9e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2497  aconitate hydratase  27.69 
 
 
869 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00662485 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3296  aconitate hydratase  27.24 
 
 
861 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0890897 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2820  aconitate hydratase  27.14 
 
 
868 aa  186  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.551214  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2866  aconitate hydratase 1  24.97 
 
 
907 aa  186  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1937  aconitate hydratase  26.06 
 
 
862 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000188613 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1867  aconitate hydratase  25.81 
 
 
868 aa  186  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0648101 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0620  aconitate hydratase  26.8 
 
 
874 aa  185  3e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.343199  normal  0.507089 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1583  aconitate hydratase  27.32 
 
 
873 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2301  aconitate hydratase  27.51 
 
 
865 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22008 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0224  aconitase  26.08 
 
 
907 aa  184  6e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0614  aconitate hydratase  27.47 
 
 
878 aa  184  7e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.219296  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2336  aconitate hydratase  25.94 
 
 
862 aa  184  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000568872 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>