More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0285 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_3767  aconitate hydratase  59.72 
 
 		 640 aa  767    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2445  aconitate hydratase  52.93 
 
 		 645 aa  672    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.430041  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1966  aconitate hydratase  50.93 
 
 		 648 aa  641    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0524  aconitate hydratase  57.3 
 
 		 643 aa  754    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000206753  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2176  aconitate hydratase  57.76 
 
 		 642 aa  768    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0828952  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2450  aconitate hydratase  52.02 
 
 		 644 aa  645    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0585  aconitate hydratase  58.79 
 
 		 645 aa  726    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.674704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2763  aconitate hydratase  52.55 
 
 		 648 aa  668    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1406  aconitate hydratase  52.16 
 
 		 643 aa  654    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.258962  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0597  aconitate hydratase  52.38 
 
 		 658 aa  646    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1882  aconitate hydratase  60.56 
 
 		 641 aa  723    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.111034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1336  aconitate hydratase  53.16 
 
 		 656 aa  680    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1265  aconitate hydratase  51.71 
 
 		 644 aa  659    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3021  aconitate hydratase  52.47 
 
 		 641 aa  639    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2153  aconitate hydratase  50.92 
 
 		 644 aa  671    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0416  aconitate hydratase  59.22 
 
 		 639 aa  753    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3193  aconitate hydratase  51.94 
 
 		 640 aa  642    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.249489  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3383  aconitate hydratase  52.77 
 
 		 657 aa  674    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0285  aconitate hydratase  100 
 
 		 646 aa  1325    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0020  aconitate hydratase  53.98 
 
 		 644 aa  669    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2106  aconitate hydratase  51.63 
 
 		 645 aa  646    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.12781  normal  0.0131142 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0098  aconitate hydratase  52.22 
 
 		 661 aa  651    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0423  aconitate hydratase  58.79 
 
 		 645 aa  726    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.82263  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2258  aconitate hydratase  51.32 
 
 		 648 aa  649    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1930  aconitate hydratase  54.66 
 
 		 642 aa  672    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.221002  normal  0.0834672 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1803  aconitate hydratase  53.93 
 
 		 657 aa  685    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0606  aconitate hydratase  56.37 
 
 		 655 aa  737    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3158  aconitate hydratase  60.71 
 
 		 642 aa  796    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107146  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1771  aconitate hydratase  53.35 
 
 		 641 aa  654    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1612  aconitate hydratase  53.58 
 
 		 646 aa  667    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1102  aconitate hydratase  49.22 
 
 		 642 aa  626  1e-178  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3640  aconitate hydratase  48.24 
 
 		 656 aa  611  1e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.506746  normal  0.0138117 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2707  aconitate hydratase  48.67 
 
 		 660 aa  611  1e-173  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2824  aconitate hydratase  50.16 
 
 		 660 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23930  aconitate hydratase  46.08 
 
 		 649 aa  593  1e-168  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.161871  normal  0.0821905 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5705  aconitate hydratase  47.66 
 
 		 659 aa  593  1e-168  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.762683  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0908  aconitate hydratase  47.12 
 
 		 668 aa  589  1e-167  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.410888  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2774  aconitate hydratase  46.3 
 
 		 661 aa  586  1e-166  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4177  aconitate hydratase  47.57 
 
 		 647 aa  586  1e-166  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.13774  normal  0.304204 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4768  aconitate hydratase  46.97 
 
 		 674 aa  581  1e-164  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.682164  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4932  aconitate hydratase  47.23 
 
 		 652 aa  567  1e-160  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05770  aconitate hydratase  47.3 
 
 		 647 aa  567  1e-160  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.295611  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0971  aconitate hydratase  36.31 
 
 		 760 aa  363  7.0000000000000005e-99  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1482  aconitate hydratase  35.91 
 
 		 754 aa  361  2e-98  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90724  aconitate hydratase  35.64 
 
 		 800 aa  353  5.9999999999999994e-96  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.319181 
 
 
-
 
NC_006686  CND02620  aconitase, putative  36.76 
 
 		 792 aa  352  1e-95  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0660  aconitate hydratase  35.86 
 
 		 758 aa  350  4e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2223  aconitate hydratase  35.31 
 
 		 755 aa  350  4e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1208  aconitate hydratase  35.45 
 
 		 756 aa  345  1e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.2348  normal  0.0471939 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2025  aconitate hydratase  35.96 
 
 		 755 aa  343  5e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00945  aconitate hydratase  35.55 
 
 		 755 aa  343  5e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.181334  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05525  Aconitase Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J267]  36.27 
 
 		 783 aa  341  2e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.842678 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2016  aconitate hydratase  34.21 
 
 		 757 aa  340  7e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964954 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2702  aconitate hydratase  34.56 
 
 		 751 aa  337  5e-91  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1952  aconitate hydratase  35.05 
 
 		 765 aa  334  4e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1408  aconitate hydratase  36.48 
 
 		 755 aa  333  6e-90  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03894  aconitate hydratase, mitochondrial, putative (Eurofung)  33.88 
 
 		 796 aa  333  8e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.26439  normal  0.611037 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01770  aconitate hydratase, putative  34.29 
 
 		 787 aa  330  5.0000000000000004e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00912812  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01590  aconitate hydratase, putative  33.03 
 
 		 770 aa  326  8.000000000000001e-88  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85181  Aconitase, mitochondrial  34.84 
 
 		 780 aa  323  5e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.154992  normal  0.331758 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05300  aconitate hydratase, putative (Eurofung)  34.43 
 
 		 798 aa  322  9.999999999999999e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.29403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0646  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.97 
 
 		 418 aa  264  4e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00455068  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0621  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.12 
 
 		 418 aa  263  8.999999999999999e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0188797  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1693  homoaconitate hydratase family protein  37.44 
 
 		 424 aa  258  4e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27842  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1100  3-isopropylmalate dehydratase  36.3 
 
 		 418 aa  256  6e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0448  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.41 
 
 		 417 aa  256  7e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0425  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.41 
 
 		 431 aa  253  7e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0402  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.25 
 
 		 418 aa  252  1e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.344506 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_390  aconitase/homoaconitase/3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  34.93 
 
 		 417 aa  252  2e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2220  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  34.78 
 
 		 415 aa  248  2e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1630  3-isopropylmalate dehydratase  34.45 
 
 		 418 aa  248  3e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1466  homoaconitate hydratase family protein  33.81 
 
 		 429 aa  247  4e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0167474  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1704  homoaconitate hydratase family protein  34.22 
 
 		 419 aa  243  1e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2965  homoaconitase  30.02 
 
 		 655 aa  243  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.556593  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0129  homoaconitate hydratase family protein  33.65 
 
 		 418 aa  239  8e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.525388  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2458  hypothetical protein  27.69 
 
 		 763 aa  239  1e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0160078  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1191  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  34.74 
 
 		 424 aa  239  1e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1030  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.4 
 
 		 431 aa  238  2e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000620705 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10870  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  34.99 
 
 		 420 aa  238  2e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0875  hypothetical protein  28.1 
 
 		 753 aa  238  3e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1588  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  32.7 
 
 		 419 aa  238  3e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1036  homoaconitate hydratase family protein  35.8 
 
 		 418 aa  238  3e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0596  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.12 
 
 		 420 aa  237  6e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2338  homoaconitate hydratase family protein  34.05 
 
 		 418 aa  236  8e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2485  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.75 
 
 		 424 aa  236  8e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.836058  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3516  3-isopropylmalate dehydratase  35.15 
 
 		 410 aa  236  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0519  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.02 
 
 		 424 aa  235  2.0000000000000002e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000192959  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0436  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  32.48 
 
 		 424 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.560563  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0794  hypothetical protein  27.82 
 
 		 753 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0376  3-isopropylmalate dehydratase  34.13 
 
 		 416 aa  235  2.0000000000000002e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0825  hypothetical protein  27.82 
 
 		 761 aa  234  3e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.125653  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2075  3-isopropylmalate dehydratase  33.65 
 
 		 416 aa  234  4.0000000000000004e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2891  hypothetical protein  27.82 
 
 		 753 aa  234  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0493763 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0356  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.46 
 
 		 420 aa  234  4.0000000000000004e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.928431  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2871  aconitate hydratase domain protein  27.69 
 
 		 753 aa  233  1e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0798  hypothetical protein  27.69 
 
 		 761 aa  233  1e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0978109  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0126  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.92 
 
 		 419 aa  231  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0233  hypothetical protein  34.27 
 
 		 417 aa  229  1e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0227  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  35.39 
 
 		 421 aa  228  2e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0471  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  31.29 
 
 		 424 aa  228  2e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.699773  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>