More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1208 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001302  ANIA_03894  aconitate hydratase, mitochondrial, putative (Eurofung)  55.89 
 
 		 796 aa  817    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.26439  normal  0.611037 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05300  aconitate hydratase, putative (Eurofung)  52.37 
 
 		 798 aa  787    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.29403  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05525  Aconitase Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J267]  61.91 
 
 		 783 aa  953    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.842678 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2702  aconitate hydratase  60.53 
 
 		 751 aa  981    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01770  aconitate hydratase, putative  51.91 
 
 		 787 aa  752    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00912812  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02620  aconitase, putative  59.95 
 
 		 792 aa  933    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01590  aconitate hydratase, putative  52.64 
 
 		 770 aa  805    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1208  aconitate hydratase  100 
 
 		 756 aa  1565    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.2348  normal  0.0471939 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2025  aconitate hydratase  81.07 
 
 		 755 aa  1277    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0660  aconitate hydratase  73.77 
 
 		 758 aa  1155    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0971  aconitate hydratase  70.77 
 
 		 760 aa  1119    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1482  aconitate hydratase  56.3 
 
 		 754 aa  887    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1952  aconitate hydratase  72.5 
 
 		 765 aa  1142    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90724  aconitate hydratase  52.98 
 
 		 800 aa  790    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.319181 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00945  aconitate hydratase  68.71 
 
 		 755 aa  1097    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.181334  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2223  aconitate hydratase  75.1 
 
 		 755 aa  1183    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1408  aconitate hydratase  59.19 
 
 		 755 aa  899    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85181  Aconitase, mitochondrial  60.24 
 
 		 780 aa  917    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.154992  normal  0.331758 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2016  aconitate hydratase  79.07 
 
 		 757 aa  1244    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964954 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0606  aconitate hydratase  36.91 
 
 		 655 aa  392  1e-108  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0585  aconitate hydratase  39.12 
 
 		 645 aa  386  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.674704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0423  aconitate hydratase  39.12 
 
 		 645 aa  386  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.82263  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3767  aconitate hydratase  37.62 
 
 		 640 aa  378  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0524  aconitate hydratase  35.26 
 
 		 643 aa  374  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000206753  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0416  aconitate hydratase  35.71 
 
 		 639 aa  370  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1771  aconitate hydratase  35.9 
 
 		 641 aa  368  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1882  aconitate hydratase  37.26 
 
 		 641 aa  365  1e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.111034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1102  aconitate hydratase  36.6 
 
 		 642 aa  361  3e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2176  aconitate hydratase  34.84 
 
 		 642 aa  360  4e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0828952  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1406  aconitate hydratase  35.25 
 
 		 643 aa  356  8.999999999999999e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.258962  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2258  aconitate hydratase  34.57 
 
 		 648 aa  356  8.999999999999999e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3158  aconitate hydratase  34.71 
 
 		 642 aa  354  2.9999999999999997e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107146  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0020  aconitate hydratase  36 
 
 		 644 aa  353  5.9999999999999994e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0285  aconitate hydratase  35.9 
 
 		 646 aa  351  3e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1966  aconitate hydratase  34.16 
 
 		 648 aa  350  4e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1930  aconitate hydratase  33.84 
 
 		 642 aa  343  8e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.221002  normal  0.0834672 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3193  aconitate hydratase  34.95 
 
 		 640 aa  342  1e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.249489  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2450  aconitate hydratase  35.47 
 
 		 644 aa  335  1e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1265  aconitate hydratase  34.7 
 
 		 644 aa  336  1e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2153  aconitate hydratase  34.7 
 
 		 644 aa  335  3e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3021  aconitate hydratase  33.84 
 
 		 641 aa  332  2e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1612  aconitate hydratase  34.21 
 
 		 646 aa  330  6e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0098  aconitate hydratase  36.46 
 
 		 661 aa  328  2.0000000000000001e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2707  aconitate hydratase  32.83 
 
 		 660 aa  327  6e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2445  aconitate hydratase  32.97 
 
 		 645 aa  326  8.000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.430041  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2106  aconitate hydratase  33.83 
 
 		 645 aa  326  9e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.12781  normal  0.0131142 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0597  aconitate hydratase  36.73 
 
 		 658 aa  325  1e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1803  aconitate hydratase  36.24 
 
 		 657 aa  324  4e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3383  aconitate hydratase  34.95 
 
 		 657 aa  322  1.9999999999999998e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1336  aconitate hydratase  34.71 
 
 		 656 aa  319  1e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2763  aconitate hydratase  33.48 
 
 		 648 aa  319  2e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23930  aconitate hydratase  31.55 
 
 		 649 aa  308  2.0000000000000002e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.161871  normal  0.0821905 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0908  aconitate hydratase  31.5 
 
 		 668 aa  300  6e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.410888  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3640  aconitate hydratase  32.05 
 
 		 656 aa  300  8e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.506746  normal  0.0138117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4177  aconitate hydratase  32.22 
 
 		 647 aa  295  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.13774  normal  0.304204 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2824  aconitate hydratase  32.2 
 
 		 660 aa  295  3e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2774  aconitate hydratase  31 
 
 		 661 aa  294  5e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4932  aconitate hydratase  32.51 
 
 		 652 aa  287  5e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5705  aconitate hydratase  30.84 
 
 		 659 aa  286  7e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.762683  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4768  aconitate hydratase  31.66 
 
 		 674 aa  272  1e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.682164  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05770  aconitate hydratase  30 
 
 		 647 aa  261  3e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.295611  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0224  aconitase  29.63 
 
 		 907 aa  259  2e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6080  aconitate hydratase  29.37 
 
 		 865 aa  242  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.76062 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2068  aconitate hydratase 1  29.99 
 
 		 855 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.461258  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2127  aconitate hydratase 1  30.45 
 
 		 903 aa  239  2e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.760339 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5861  aconitate hydratase  28.87 
 
 		 875 aa  238  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.370174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3587  aconitate hydratase  28.99 
 
 		 875 aa  239  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00350966 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1467  aconitate hydratase  29.35 
 
 		 840 aa  239  2e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02721  aconitate hydratase  29.18 
 
 		 863 aa  239  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1777  aconitate hydratase  29.43 
 
 		 862 aa  237  7e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00224724  hitchhiker  0.000953384 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2301  aconitate hydratase  29.35 
 
 		 865 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22008 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23230  aconitate hydratase  30.17 
 
 		 867 aa  234  6e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.438078  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1937  aconitate hydratase  29.25 
 
 		 862 aa  233  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000188613 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07642  aconitate hydratase, hypothetical (Eurofung)  46.48 
 
 		 326 aa  231  3e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.409922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3434  aconitate hydratase  28.89 
 
 		 863 aa  231  4e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.070835  normal  0.23906 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1766  aconitate hydratase  28.96 
 
 		 864 aa  231  5e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0313  aconitate hydratase  29.56 
 
 		 863 aa  231  5e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2336  aconitate hydratase  28.89 
 
 		 862 aa  230  6e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000568872 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3947  aconitate hydratase  29.7 
 
 		 867 aa  230  6e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3631  aconitate hydratase  29.88 
 
 		 863 aa  230  8e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2603  aconitate hydratase  28.96 
 
 		 872 aa  229  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120412  hitchhiker  0.000028644 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4049  aconitate hydratase  29.7 
 
 		 863 aa  229  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4142  aconitate hydratase  29.57 
 
 		 863 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6708  aconitate hydratase  29.37 
 
 		 870 aa  229  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4023  aconitate hydratase  29.7 
 
 		 871 aa  229  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3646  aconitate hydratase  29.57 
 
 		 871 aa  228  3e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1585  aconitate hydratase  29.68 
 
 		 865 aa  228  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0614327  normal  0.918701 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3827  aconitate hydratase  29.21 
 
 		 863 aa  228  3e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4724  aconitate hydratase  28.37 
 
 		 868 aa  228  4e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2060  aconitate hydratase  28.17 
 
 		 897 aa  228  4e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53970  aconitate hydratase  28.37 
 
 		 868 aa  228  4e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3296  aconitate hydratase  29.55 
 
 		 861 aa  227  6e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0890897 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0343  aconitate hydratase  29.38 
 
 		 867 aa  227  6e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3289  aconitate hydratase  29.6 
 
 		 866 aa  226  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0578513 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0877  aconitate hydratase  29.42 
 
 		 864 aa  226  1e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1868  aconitate hydratase  29.42 
 
 		 864 aa  226  1e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2861  aconitase  28.49 
 
 		 891 aa  226  1e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.509308  normal  0.643421 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2087  aconitate hydratase  28.99 
 
 		 862 aa  225  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664826 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1164  aconitate hydratase  29.3 
 
 		 864 aa  226  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2141  aconitate hydratase  29.3 
 
 		 864 aa  226  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>