More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNG01590 on replicon NC_006692
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001302  ANIA_03894  aconitate hydratase, mitochondrial, putative (Eurofung)  50.77 
 
 
796 aa  764    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.26439  normal  0.611037 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05300  aconitate hydratase, putative (Eurofung)  50.93 
 
 
798 aa  771    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.29403  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05525  Aconitase Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J267]  57.97 
 
 
783 aa  913    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.842678 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85181  Aconitase, mitochondrial  56.71 
 
 
780 aa  893    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.154992  normal  0.331758 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2025  aconitate hydratase  54.25 
 
 
755 aa  830    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2016  aconitate hydratase  53.65 
 
 
757 aa  828    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00964954 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01770  aconitate hydratase, putative  53.23 
 
 
787 aa  771    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00912812  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02620  aconitase, putative  57.42 
 
 
792 aa  934    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01590  aconitate hydratase, putative  100 
 
 
770 aa  1596    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0971  aconitate hydratase  51.74 
 
 
760 aa  782    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1952  aconitate hydratase  52.44 
 
 
765 aa  781    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90724  aconitate hydratase  50.53 
 
 
800 aa  765    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.319181 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00945  aconitate hydratase  51.62 
 
 
755 aa  789    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.181334  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1408  aconitate hydratase  50.47 
 
 
755 aa  773    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1482  aconitate hydratase  51.28 
 
 
754 aa  787    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2702  aconitate hydratase  48.51 
 
 
751 aa  751    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2223  aconitate hydratase  52.91 
 
 
755 aa  791    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274844  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1208  aconitate hydratase  52.64 
 
 
756 aa  794    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.2348  normal  0.0471939 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0660  aconitate hydratase  52.5 
 
 
758 aa  780    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0416  aconitate hydratase  34.02 
 
 
639 aa  366  1e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3767  aconitate hydratase  34.36 
 
 
640 aa  357  3.9999999999999996e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0423  aconitate hydratase  36.79 
 
 
645 aa  352  1e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.82263  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1406  aconitate hydratase  34.03 
 
 
643 aa  352  1e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.258962  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0020  aconitate hydratase  35.87 
 
 
644 aa  352  1e-95  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0585  aconitate hydratase  36.79 
 
 
645 aa  352  1e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.674704  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3193  aconitate hydratase  35.71 
 
 
640 aa  349  1e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.249489  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0606  aconitate hydratase  34.48 
 
 
655 aa  347  7e-94  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2176  aconitate hydratase  33.47 
 
 
642 aa  342  1e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0828952  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3158  aconitate hydratase  33.65 
 
 
642 aa  342  2e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107146  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1930  aconitate hydratase  33.38 
 
 
642 aa  342  2e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.221002  normal  0.0834672 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1882  aconitate hydratase  36.97 
 
 
641 aa  338  1.9999999999999998e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.111034  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1966  aconitate hydratase  33.94 
 
 
648 aa  336  7.999999999999999e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1102  aconitate hydratase  34.9 
 
 
642 aa  335  1e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2258  aconitate hydratase  34.17 
 
 
648 aa  335  2e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0524  aconitate hydratase  34.72 
 
 
643 aa  334  5e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000206753  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1771  aconitate hydratase  34.03 
 
 
641 aa  331  3e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1265  aconitate hydratase  33.38 
 
 
644 aa  326  1e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0285  aconitate hydratase  33.03 
 
 
646 aa  326  1e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3021  aconitate hydratase  32.41 
 
 
641 aa  323  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1612  aconitate hydratase  31.89 
 
 
646 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2450  aconitate hydratase  32.92 
 
 
644 aa  320  7.999999999999999e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2763  aconitate hydratase  32.36 
 
 
648 aa  318  3e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2445  aconitate hydratase  32.22 
 
 
645 aa  317  5e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.430041  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2707  aconitate hydratase  32.03 
 
 
660 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23930  aconitate hydratase  32.22 
 
 
649 aa  303  5.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.161871  normal  0.0821905 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2153  aconitate hydratase  33.58 
 
 
644 aa  303  9e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3383  aconitate hydratase  32.71 
 
 
657 aa  302  2e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1803  aconitate hydratase  33.58 
 
 
657 aa  301  3e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2824  aconitate hydratase  33.19 
 
 
660 aa  301  3e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1336  aconitate hydratase  32.76 
 
 
656 aa  298  3e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2106  aconitate hydratase  31.77 
 
 
645 aa  297  5e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.12781  normal  0.0131142 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5705  aconitate hydratase  31.88 
 
 
659 aa  295  3e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.762683  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0098  aconitate hydratase  32.01 
 
 
661 aa  289  1e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0597  aconitate hydratase  32.84 
 
 
658 aa  288  2e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4177  aconitate hydratase  31.28 
 
 
647 aa  289  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.13774  normal  0.304204 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2774  aconitate hydratase  32.06 
 
 
661 aa  287  4e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0908  aconitate hydratase  31.01 
 
 
668 aa  284  5.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.410888  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4932  aconitate hydratase  31.57 
 
 
652 aa  274  5.000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450299  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3640  aconitate hydratase  30.89 
 
 
656 aa  268  2.9999999999999995e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.506746  normal  0.0138117 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05770  aconitate hydratase  32.17 
 
 
647 aa  265  2e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.295611  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4768  aconitate hydratase  32.15 
 
 
674 aa  263  8e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.682164  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02395  aconitate hydratase  28.13 
 
 
869 aa  232  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07642  aconitate hydratase, hypothetical (Eurofung)  47.18 
 
 
326 aa  230  7e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.409922  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1937  aconitate hydratase  29.61 
 
 
862 aa  226  8e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000188613 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1467  aconitate hydratase  29.99 
 
 
840 aa  226  9e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3434  aconitate hydratase  27.43 
 
 
863 aa  225  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.070835  normal  0.23906 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2603  aconitate hydratase  30.3 
 
 
872 aa  224  4e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120412  hitchhiker  0.000028644 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2336  aconitate hydratase  28.34 
 
 
862 aa  224  6e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000568872 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003390  2-methylcitrate dehydratase FeS dependent  28.03 
 
 
863 aa  222  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.828333  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0828  aconitate hydratase  29.25 
 
 
883 aa  221  6e-56  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00982227  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0343  aconitate hydratase  28.82 
 
 
867 aa  219  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0313  aconitate hydratase  30.09 
 
 
863 aa  218  2e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03372  aconitate hydratase  27.73 
 
 
863 aa  217  5.9999999999999996e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2264  aconitate hydratase  30.35 
 
 
907 aa  217  8e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1920  aconitate hydratase  28.22 
 
 
890 aa  216  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00387998  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3296  aconitate hydratase  29.07 
 
 
861 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0890897 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2030  aconitate hydratase  28.22 
 
 
890 aa  215  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.326085  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1031  aconitate hydratase  28.69 
 
 
875 aa  216  1.9999999999999998e-54  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6708  aconitate hydratase  29.23 
 
 
870 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2230  aconitate hydratase  28.1 
 
 
890 aa  215  2.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000744692  decreased coverage  0.000375286 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0365  aconitate hydratase  29.62 
 
 
872 aa  214  4.9999999999999996e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0120  aconitate hydratase  28.29 
 
 
865 aa  214  5.999999999999999e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1867  aconitate hydratase  28.39 
 
 
868 aa  214  5.999999999999999e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0648101 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1766  aconitate hydratase  28.92 
 
 
864 aa  213  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1822  aconitate hydratase  31.28 
 
 
862 aa  213  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.490581  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3631  aconitate hydratase  29.31 
 
 
863 aa  213  1e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2082  aconitate hydratase  28.5 
 
 
873 aa  212  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.700898  normal  0.185792 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53970  aconitate hydratase  27.59 
 
 
868 aa  212  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4724  aconitate hydratase  27.57 
 
 
868 aa  211  4e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4787  aconitate hydratase  28.07 
 
 
875 aa  211  4e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0629785  normal  0.0288471 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3827  aconitate hydratase  28.9 
 
 
863 aa  211  5e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1859  aconitate hydratase  29.67 
 
 
870 aa  210  6e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3646  aconitate hydratase  30.09 
 
 
871 aa  210  8e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4142  aconitate hydratase  29.96 
 
 
863 aa  210  9e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0954  aconitate hydratase  27.44 
 
 
868 aa  210  9e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1199  aconitate hydratase  30.39 
 
 
903 aa  209  1e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2068  aconitate hydratase 1  27.69 
 
 
855 aa  208  2e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.461258  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3028  aconitate hydratase  28.54 
 
 
872 aa  209  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2087  aconitate hydratase  28.57 
 
 
862 aa  209  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00664826 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4023  aconitate hydratase  29.78 
 
 
871 aa  209  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>