More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1952 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001302  ANIA_03894  aconitate hydratase, mitochondrial, putative (Eurofung)  51.99 
 
 		 796 aa  744    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.26439  normal  0.611037 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05300  aconitate hydratase, putative (Eurofung)  51.12 
 
 		 798 aa  767    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.29403  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05525  Aconitase Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J267]  61.59 
 
 		 783 aa  923    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.842678 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85181  Aconitase, mitochondrial  61.34 
 
 		 780 aa  921    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.154992  normal  0.331758 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90724  aconitate hydratase  54.29 
 
 		 800 aa  802    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.319181 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00945  aconitate hydratase  76.23 
 
 		 755 aa  1210    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.181334  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2702  aconitate hydratase  60.24 
 
 		 751 aa  943    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01770  aconitate hydratase, putative  52.08 
 
 		 787 aa  739    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00912812  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02620  aconitase, putative  61.48 
 
 		 792 aa  944    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01590  aconitate hydratase, putative  52.44 
 
 		 770 aa  781    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1208  aconitate hydratase  72.5 
 
 		 756 aa  1118    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.2348  normal  0.0471939 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2016  aconitate hydratase  72.44 
 
 		 757 aa  1131    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964954 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1482  aconitate hydratase  57.99 
 
 		 754 aa  895    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2025  aconitate hydratase  72.5 
 
 		 755 aa  1146    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2223  aconitate hydratase  76.96 
 
 		 755 aa  1206    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0660  aconitate hydratase  77.17 
 
 		 758 aa  1187    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0971  aconitate hydratase  78.91 
 
 		 760 aa  1246    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1952  aconitate hydratase  100 
 
 		 765 aa  1583    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1408  aconitate hydratase  56.39 
 
 		 755 aa  855    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0423  aconitate hydratase  38.75 
 
 		 645 aa  364  4e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.82263  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0585  aconitate hydratase  38.75 
 
 		 645 aa  364  4e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.674704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0606  aconitate hydratase  35.55 
 
 		 655 aa  358  2.9999999999999997e-97  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3767  aconitate hydratase  35.65 
 
 		 640 aa  351  4e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0524  aconitate hydratase  35.02 
 
 		 643 aa  343  7e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000206753  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0416  aconitate hydratase  34.47 
 
 		 639 aa  337  7e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1102  aconitate hydratase  34.23 
 
 		 642 aa  334  4e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0285  aconitate hydratase  35.05 
 
 		 646 aa  334  4e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1771  aconitate hydratase  35.08 
 
 		 641 aa  331  3e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1882  aconitate hydratase  36.03 
 
 		 641 aa  331  3e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.111034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1406  aconitate hydratase  32.97 
 
 		 643 aa  330  8e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.258962  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2176  aconitate hydratase  34.08 
 
 		 642 aa  325  2e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0828952  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0020  aconitate hydratase  34.42 
 
 		 644 aa  324  4e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3158  aconitate hydratase  33.38 
 
 		 642 aa  321  1.9999999999999998e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107146  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1930  aconitate hydratase  34.31 
 
 		 642 aa  322  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.221002  normal  0.0834672 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3021  aconitate hydratase  33.93 
 
 		 641 aa  319  2e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3193  aconitate hydratase  33.56 
 
 		 640 aa  316  9e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.249489  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1966  aconitate hydratase  32.84 
 
 		 648 aa  316  9.999999999999999e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2258  aconitate hydratase  32.69 
 
 		 648 aa  312  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1265  aconitate hydratase  32.7 
 
 		 644 aa  310  5.9999999999999995e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2445  aconitate hydratase  31.54 
 
 		 645 aa  304  4.0000000000000003e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.430041  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1803  aconitate hydratase  34.17 
 
 		 657 aa  304  4.0000000000000003e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2763  aconitate hydratase  30.85 
 
 		 648 aa  303  9e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3383  aconitate hydratase  33.88 
 
 		 657 aa  303  1e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2153  aconitate hydratase  33.68 
 
 		 644 aa  301  4e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1612  aconitate hydratase  31.23 
 
 		 646 aa  300  5e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2450  aconitate hydratase  33.2 
 
 		 644 aa  300  6e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0597  aconitate hydratase  33.88 
 
 		 658 aa  295  2e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2707  aconitate hydratase  31.12 
 
 		 660 aa  295  3e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1336  aconitate hydratase  32.71 
 
 		 656 aa  292  1e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23930  aconitate hydratase  31.14 
 
 		 649 aa  290  5.0000000000000004e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.161871  normal  0.0821905 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0098  aconitate hydratase  32.94 
 
 		 661 aa  290  6e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2106  aconitate hydratase  30.38 
 
 		 645 aa  279  1e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.12781  normal  0.0131142 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4177  aconitate hydratase  29.66 
 
 		 647 aa  273  6e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.13774  normal  0.304204 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0908  aconitate hydratase  29.17 
 
 		 668 aa  269  1e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.410888  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2774  aconitate hydratase  30.36 
 
 		 661 aa  261  4e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4932  aconitate hydratase  29.81 
 
 		 652 aa  258  3e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5705  aconitate hydratase  29.64 
 
 		 659 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.762683  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3640  aconitate hydratase  28.08 
 
 		 656 aa  251  4e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.506746  normal  0.0138117 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4768  aconitate hydratase  30.46 
 
 		 674 aa  242  1e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.682164  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1467  aconitate hydratase  29.91 
 
 		 840 aa  241  2.9999999999999997e-62  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1031  aconitate hydratase  29.14 
 
 		 875 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05770  aconitate hydratase  29.38 
 
 		 647 aa  234  5e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.295611  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0828  aconitate hydratase  28.71 
 
 		 883 aa  231  3e-59  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00982227  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6080  aconitate hydratase  28.25 
 
 		 865 aa  230  9e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.76062 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2068  aconitate hydratase 1  28.65 
 
 		 855 aa  229  2e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.461258  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02721  aconitate hydratase  27.77 
 
 		 863 aa  229  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2824  aconitate hydratase  36.02 
 
 		 660 aa  228  3e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6708  aconitate hydratase  27.98 
 
 		 870 aa  224  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3289  aconitate hydratase  28.11 
 
 		 866 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0578513 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07642  aconitate hydratase, hypothetical (Eurofung)  46.46 
 
 		 326 aa  221  3e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.409922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2301  aconitate hydratase  27.9 
 
 		 865 aa  221  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22008 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2289  aconitase family protein  28.25 
 
 		 863 aa  220  7e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.425235  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2861  aconitase  28.77 
 
 		 891 aa  220  1e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.509308  normal  0.643421 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0174  aconitate hydratase 1  29.11 
 
 		 900 aa  218  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0847223  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3028  aconitate hydratase  27.41 
 
 		 872 aa  217  5.9999999999999996e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03372  aconitate hydratase  27.35 
 
 		 863 aa  217  7e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2087  aconitate hydratase  27.75 
 
 		 862 aa  217  8e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664826 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5861  aconitate hydratase  27.41 
 
 		 875 aa  215  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.370174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4757  aconitate hydratase  28.45 
 
 		 864 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.592103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5346  aconitate hydratase  28.45 
 
 		 864 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.992618  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1777  aconitate hydratase  27.73 
 
 		 862 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00224724  hitchhiker  0.000953384 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5515  aconitate hydratase  28.45 
 
 		 864 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.12009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3587  aconitate hydratase  27.34 
 
 		 875 aa  215  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00350966 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3434  aconitate hydratase  27.19 
 
 		 863 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.070835  normal  0.23906 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4840  aconitate hydratase  28.11 
 
 		 865 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1925  aconitate hydratase  26.73 
 
 		 916 aa  213  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128572  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1766  aconitate hydratase  27.96 
 
 		 864 aa  213  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1937  aconitate hydratase  27.32 
 
 		 862 aa  213  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000188613 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0224  aconitase  27.28 
 
 		 907 aa  213  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003390  2-methylcitrate dehydratase FeS dependent  27.8 
 
 		 863 aa  213  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.828333  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1859  aconitate hydratase  27.61 
 
 		 870 aa  213  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3947  aconitate hydratase  27.44 
 
 		 867 aa  213  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3664  aconitate hydratase 1  28.01 
 
 		 900 aa  213  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.183384  hitchhiker  0.00133985 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2336  aconitate hydratase  27.19 
 
 		 862 aa  212  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000568872 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3646  aconitate hydratase  27.59 
 
 		 871 aa  212  2e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4049  aconitate hydratase  27.44 
 
 		 863 aa  213  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2113  aconitate hydratase  26.89 
 
 		 868 aa  212  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1682  aconitate hydratase  28.83 
 
 		 906 aa  211  3e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00945136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4023  aconitate hydratase  27.44 
 
 		 871 aa  211  3e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1585  aconitate hydratase  28.35 
 
 		 865 aa  211  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0614327  normal  0.918701 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>