More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0908 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0908  aconitate hydratase  100 
 
 		 668 aa  1362    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.410888  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4932  aconitate hydratase  61.02 
 
 		 652 aa  759    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4177  aconitate hydratase  65.14 
 
 		 647 aa  822    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.13774  normal  0.304204 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2445  aconitate hydratase  55.4 
 
 		 645 aa  728    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.430041  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2258  aconitate hydratase  55.61 
 
 		 648 aa  709    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1966  aconitate hydratase  54.98 
 
 		 648 aa  704    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0416  aconitate hydratase  52.4 
 
 		 639 aa  654    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23930  aconitate hydratase  60.87 
 
 		 649 aa  779    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.161871  normal  0.0821905 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3767  aconitate hydratase  48.6 
 
 		 640 aa  642    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05770  aconitate hydratase  61.21 
 
 		 647 aa  770    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.295611  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2707  aconitate hydratase  63.78 
 
 		 660 aa  842    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2774  aconitate hydratase  63.68 
 
 		 661 aa  845    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2450  aconitate hydratase  55.64 
 
 		 644 aa  717    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2763  aconitate hydratase  56.14 
 
 		 648 aa  729    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5705  aconitate hydratase  64.76 
 
 		 659 aa  851    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.762683  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4768  aconitate hydratase  62.27 
 
 		 674 aa  786    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.682164  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1612  aconitate hydratase  55.45 
 
 		 646 aa  712    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3640  aconitate hydratase  61.46 
 
 		 656 aa  795    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.506746  normal  0.0138117 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2106  aconitate hydratase  56.92 
 
 		 645 aa  736    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.12781  normal  0.0131142 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1265  aconitate hydratase  54.63 
 
 		 644 aa  716    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0524  aconitate hydratase  51.47 
 
 		 643 aa  640    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000206753  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3158  aconitate hydratase  50.15 
 
 		 642 aa  632  1e-180  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107146  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0606  aconitate hydratase  49.39 
 
 		 655 aa  630  1e-179  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0585  aconitate hydratase  49.46 
 
 		 645 aa  618  1e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.674704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0423  aconitate hydratase  49.46 
 
 		 645 aa  618  1e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.82263  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1882  aconitate hydratase  51.08 
 
 		 641 aa  605  9.999999999999999e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.111034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2824  aconitate hydratase  48.64 
 
 		 660 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2176  aconitate hydratase  47.36 
 
 		 642 aa  601  1e-170  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0828952  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1930  aconitate hydratase  48.53 
 
 		 642 aa  596  1e-169  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.221002  normal  0.0834672 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0285  aconitate hydratase  47.12 
 
 		 646 aa  589  1e-167  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1803  aconitate hydratase  48.36 
 
 		 657 aa  586  1e-166  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1336  aconitate hydratase  48.45 
 
 		 656 aa  582  1.0000000000000001e-165  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3383  aconitate hydratase  46.56 
 
 		 657 aa  581  1e-164  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1406  aconitate hydratase  47.74 
 
 		 643 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.258962  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3193  aconitate hydratase  47.92 
 
 		 640 aa  574  1.0000000000000001e-162  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.249489  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0020  aconitate hydratase  47.03 
 
 		 644 aa  565  1e-160  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2153  aconitate hydratase  46.85 
 
 		 644 aa  559  1e-158  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0098  aconitate hydratase  45.52 
 
 		 661 aa  559  1e-158  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3021  aconitate hydratase  48.47 
 
 		 641 aa  561  1e-158  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0597  aconitate hydratase  47.45 
 
 		 658 aa  556  1e-157  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1102  aconitate hydratase  43.63 
 
 		 642 aa  550  1e-155  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1771  aconitate hydratase  45.19 
 
 		 641 aa  534  1e-150  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1482  aconitate hydratase  32.78 
 
 		 754 aa  322  9.999999999999999e-87  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1408  aconitate hydratase  32.71 
 
 		 755 aa  303  6.000000000000001e-81  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1208  aconitate hydratase  31.36 
 
 		 756 aa  299  1e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.2348  normal  0.0471939 
 
 
-
 
NC_006686  CND02620  aconitase, putative  31.38 
 
 		 792 aa  298  2e-79  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0971  aconitate hydratase  31.6 
 
 		 760 aa  290  5.0000000000000004e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2702  aconitate hydratase  30.75 
 
 		 751 aa  290  6e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2025  aconitate hydratase  31.68 
 
 		 755 aa  288  2.9999999999999996e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2223  aconitate hydratase  32 
 
 		 755 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274844  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03894  aconitate hydratase, mitochondrial, putative (Eurofung)  32.48 
 
 		 796 aa  287  4e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.26439  normal  0.611037 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2016  aconitate hydratase  32.24 
 
 		 757 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964954 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85181  Aconitase, mitochondrial  30.96 
 
 		 780 aa  285  3.0000000000000004e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.154992  normal  0.331758 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01590  aconitate hydratase, putative  31.01 
 
 		 770 aa  284  4.0000000000000003e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90724  aconitate hydratase  29.89 
 
 		 800 aa  282  2e-74  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.319181 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0660  aconitate hydratase  30.63 
 
 		 758 aa  281  3e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05525  Aconitase Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J267]  30.76 
 
 		 783 aa  280  6e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.842678 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01770  aconitate hydratase, putative  31.9 
 
 		 787 aa  280  8e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00912812  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00945  aconitate hydratase  30.08 
 
 		 755 aa  277  4e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.181334  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1952  aconitate hydratase  29.17 
 
 		 765 aa  269  1e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05300  aconitate hydratase, putative (Eurofung)  31.73 
 
 		 798 aa  266  8.999999999999999e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.29403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0402  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  32.3 
 
 		 418 aa  221  3e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.344506 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1630  3-isopropylmalate dehydratase  33.25 
 
 		 418 aa  216  8e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1466  homoaconitate hydratase family protein  32.61 
 
 		 429 aa  216  9.999999999999999e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0167474  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2871  aconitate hydratase domain protein  26.69 
 
 		 753 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0794  hypothetical protein  26.69 
 
 		 753 aa  214  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0875  hypothetical protein  26.83 
 
 		 753 aa  214  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0798  hypothetical protein  26.69 
 
 		 761 aa  214  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0978109  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2891  hypothetical protein  26.69 
 
 		 753 aa  214  5.999999999999999e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0493763 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2458  hypothetical protein  27.11 
 
 		 763 aa  213  7e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0160078  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0825  hypothetical protein  26.69 
 
 		 761 aa  213  7e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.125653  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0646  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  32.3 
 
 		 418 aa  211  3e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00455068  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0621  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  32.3 
 
 		 418 aa  210  7e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0188797  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0099  hypothetical protein  28.39 
 
 		 768 aa  209  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1704  homoaconitate hydratase family protein  31.16 
 
 		 419 aa  207  7e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2965  homoaconitase  27.98 
 
 		 655 aa  206  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.556593  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1693  homoaconitate hydratase family protein  34.76 
 
 		 424 aa  203  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27842  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1100  3-isopropylmalate dehydratase  33.65 
 
 		 418 aa  200  6e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21050  hypothetical protein  25.77 
 
 		 781 aa  200  7.999999999999999e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1588  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  32.13 
 
 		 419 aa  198  3e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0224  aconitase  27.39 
 
 		 907 aa  193  8e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00580  homoaconitate hydratase, putative  27.71 
 
 		 728 aa  193  9e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88705  homoaconitase  28.29 
 
 		 677 aa  191  2.9999999999999997e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.933626  normal  0.508507 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0204  aconitate hydratase  27.19 
 
 		 906 aa  191  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0875867 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1191  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  31.69 
 
 		 424 aa  191  4e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2220  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  31.58 
 
 		 415 aa  190  5.999999999999999e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1133  hypothetical protein  26.37 
 
 		 783 aa  190  7e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000753668  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0174  aconitate hydratase 1  27.57 
 
 		 900 aa  189  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0847223  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1458  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.74 
 
 		 419 aa  189  1e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.888399  normal  0.260054 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2760  aconitate hydratase 1  27.3 
 
 		 899 aa  188  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0601  3-isopropylmalate dehydratase  30.77 
 
 		 431 aa  188  2e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0525  aconitate hydratase  27.04 
 
 		 905 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.123163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0519  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  30.82 
 
 		 424 aa  188  3e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000192959  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1402  aconitate hydratase 1  27.82 
 
 		 934 aa  188  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.365694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0390  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.1 
 
 		 419 aa  188  3e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2861  aconitase  26.9 
 
 		 891 aa  187  5e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.509308  normal  0.643421 
 
 
-
 
NC_002936  DET0448  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  31.34 
 
 		 417 aa  187  6e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0425  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  32.13 
 
 		 431 aa  187  7e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0738  homoaconitate hydratase family protein  30.14 
 
 		 432 aa  186  8e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0291  aconitate hydratase  26.73 
 
 		 905 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0448672 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>