More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2450 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4768  aconitate hydratase  54.29 
 
 		 674 aa  694    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.682164  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2445  aconitate hydratase  66.87 
 
 		 645 aa  904    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.430041  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05770  aconitate hydratase  53.7 
 
 		 647 aa  677    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.295611  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1612  aconitate hydratase  68.74 
 
 		 646 aa  920    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1265  aconitate hydratase  67.86 
 
 		 644 aa  924    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0524  aconitate hydratase  54.45 
 
 		 643 aa  696    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000206753  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2707  aconitate hydratase  56.59 
 
 		 660 aa  746    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2450  aconitate hydratase  100 
 
 		 644 aa  1313    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2763  aconitate hydratase  66.1 
 
 		 648 aa  887    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1882  aconitate hydratase  53.89 
 
 		 641 aa  645    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.111034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0423  aconitate hydratase  55.3 
 
 		 645 aa  680    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.82263  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0908  aconitate hydratase  55.64 
 
 		 668 aa  717    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.410888  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2176  aconitate hydratase  50.47 
 
 		 642 aa  654    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0828952  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3640  aconitate hydratase  54.77 
 
 		 656 aa  705    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.506746  normal  0.0138117 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23930  aconitate hydratase  53.55 
 
 		 649 aa  704    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.161871  normal  0.0821905 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2258  aconitate hydratase  65.11 
 
 		 648 aa  874    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0606  aconitate hydratase  53.38 
 
 		 655 aa  700    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0285  aconitate hydratase  52.02 
 
 		 646 aa  645    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3767  aconitate hydratase  53.12 
 
 		 640 aa  690    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2106  aconitate hydratase  69.05 
 
 		 645 aa  931    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.12781  normal  0.0131142 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2774  aconitate hydratase  55.37 
 
 		 661 aa  705    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0020  aconitate hydratase  52.79 
 
 		 644 aa  640    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4177  aconitate hydratase  56.06 
 
 		 647 aa  718    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.13774  normal  0.304204 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5705  aconitate hydratase  56.24 
 
 		 659 aa  713    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.762683  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1336  aconitate hydratase  50.46 
 
 		 656 aa  641    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3383  aconitate hydratase  50.7 
 
 		 657 aa  648    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1966  aconitate hydratase  65.26 
 
 		 648 aa  876    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0416  aconitate hydratase  53.28 
 
 		 639 aa  675    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3158  aconitate hydratase  51.79 
 
 		 642 aa  674    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107146  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4932  aconitate hydratase  52.91 
 
 		 652 aa  660    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0585  aconitate hydratase  55.3 
 
 		 645 aa  680    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.674704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1930  aconitate hydratase  52.49 
 
 		 642 aa  632  1e-180  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.221002  normal  0.0834672 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1803  aconitate hydratase  50.55 
 
 		 657 aa  625  1e-178  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2824  aconitate hydratase  51.39 
 
 		 660 aa  627  1e-178  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3021  aconitate hydratase  51.79 
 
 		 641 aa  619  1e-176  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1406  aconitate hydratase  50.31 
 
 		 643 aa  611  1e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.258962  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3193  aconitate hydratase  52.19 
 
 		 640 aa  611  1e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.249489  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0597  aconitate hydratase  49.92 
 
 		 658 aa  609  1e-173  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1771  aconitate hydratase  51.16 
 
 		 641 aa  604  1.0000000000000001e-171  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2153  aconitate hydratase  46.8 
 
 		 644 aa  600  1e-170  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0098  aconitate hydratase  47.78 
 
 		 661 aa  593  1e-168  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1102  aconitate hydratase  45.6 
 
 		 642 aa  593  1e-168  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1482  aconitate hydratase  32.47 
 
 		 754 aa  331  3e-89  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1208  aconitate hydratase  35.24 
 
 		 756 aa  329  9e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.2348  normal  0.0471939 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03894  aconitate hydratase, mitochondrial, putative (Eurofung)  34.15 
 
 		 796 aa  326  8.000000000000001e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.26439  normal  0.611037 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2025  aconitate hydratase  34.43 
 
 		 755 aa  323  7e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1408  aconitate hydratase  34.54 
 
 		 755 aa  322  9.000000000000001e-87  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01590  aconitate hydratase, putative  32.92 
 
 		 770 aa  320  6e-86  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0971  aconitate hydratase  35.19 
 
 		 760 aa  313  3.9999999999999997e-84  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2223  aconitate hydratase  33.74 
 
 		 755 aa  311  2e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274844  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND02620  aconitase, putative  33.33 
 
 		 792 aa  309  1.0000000000000001e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90724  aconitate hydratase  32.7 
 
 		 800 aa  307  4.0000000000000004e-82  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.319181 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05300  aconitate hydratase, putative (Eurofung)  34.82 
 
 		 798 aa  304  3.0000000000000004e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.29403  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00945  aconitate hydratase  34.08 
 
 		 755 aa  301  2e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.181334  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0660  aconitate hydratase  33.15 
 
 		 758 aa  300  5e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1952  aconitate hydratase  33.2 
 
 		 765 aa  300  5e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85181  Aconitase, mitochondrial  34.22 
 
 		 780 aa  299  1e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.154992  normal  0.331758 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2016  aconitate hydratase  32.48 
 
 		 757 aa  298  2e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964954 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2702  aconitate hydratase  32.41 
 
 		 751 aa  297  5e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05525  Aconitase Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J267]  33.58 
 
 		 783 aa  288  2e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.842678 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0646  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.49 
 
 		 418 aa  240  5.999999999999999e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00455068  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0621  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.49 
 
 		 418 aa  239  1e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0188797  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0402  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.49 
 
 		 418 aa  235  1.0000000000000001e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.344506 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01770  aconitate hydratase, putative  35.78 
 
 		 787 aa  233  1e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00912812  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2965  homoaconitase  28.25 
 
 		 655 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.556593  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2220  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  33.89 
 
 		 415 aa  219  8.999999999999998e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1100  3-isopropylmalate dehydratase  33.65 
 
 		 418 aa  218  2e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1630  3-isopropylmalate dehydratase  32.08 
 
 		 418 aa  218  2e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1466  homoaconitate hydratase family protein  31.49 
 
 		 429 aa  216  9.999999999999999e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0167474  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88705  homoaconitase  27.66 
 
 		 677 aa  213  1e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.933626  normal  0.508507 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00580  homoaconitate hydratase, putative  27.37 
 
 		 728 aa  211  4e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1704  homoaconitate hydratase family protein  31.72 
 
 		 419 aa  211  4e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1102  3-isopropylmalate dehydratase  33.17 
 
 		 437 aa  210  6e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0356  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  32.94 
 
 		 420 aa  209  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.928431  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0425  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.6 
 
 		 431 aa  207  6e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0448  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.84 
 
 		 417 aa  207  7e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0596  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  31.91 
 
 		 420 aa  207  7e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0519  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  31.53 
 
 		 424 aa  206  9e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000192959  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2338  homoaconitate hydratase family protein  32.14 
 
 		 418 aa  206  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1458  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.52 
 
 		 419 aa  206  1e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.888399  normal  0.260054 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1588  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  32.13 
 
 		 419 aa  205  2e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1191  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  32.86 
 
 		 424 aa  206  2e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_390  aconitase/homoaconitase/3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  33.84 
 
 		 417 aa  205  2e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0289  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  31.22 
 
 		 425 aa  204  5e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21050  hypothetical protein  26.74 
 
 		 781 aa  203  7e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2458  hypothetical protein  25.35 
 
 		 763 aa  203  8e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0160078  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1030  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  32.63 
 
 		 431 aa  201  3e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000620705 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1792  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33 
 
 		 418 aa  199  9e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.602442 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0788  3-isopropylmalate dehydratase  37.28 
 
 		 382 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1742  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.59 
 
 		 420 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.482523  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2254  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.65 
 
 		 421 aa  199  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0436  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  29.81 
 
 		 424 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.560563  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2159  3-isopropylmalate dehydratase  32.23 
 
 		 398 aa  197  6e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.219475 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0129  homoaconitate hydratase family protein  31.74 
 
 		 418 aa  197  7e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.525388  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0741  homoaconitate hydratase family protein  30.93 
 
 		 432 aa  196  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375835  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0399  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  29.18 
 
 		 424 aa  194  3e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.320252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2101  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  32.86 
 
 		 429 aa  194  4e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0493977  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1693  homoaconitate hydratase family protein  32.54 
 
 		 424 aa  194  5e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27842  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0227  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  33.49 
 
 		 421 aa  194  5e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2194  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  32.08 
 
 		 421 aa  193  6e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.454447  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>