More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3158 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1612  aconitate hydratase  54.04 
 
 
646 aa  694    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0524  aconitate hydratase  76.33 
 
 
643 aa  1016    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000206753  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0606  aconitate hydratase  61.63 
 
 
655 aa  822    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4768  aconitate hydratase  52.03 
 
 
674 aa  654    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.682164  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2445  aconitate hydratase  56.37 
 
 
645 aa  726    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.430041  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1336  aconitate hydratase  53.47 
 
 
656 aa  715    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1966  aconitate hydratase  55.9 
 
 
648 aa  727    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1265  aconitate hydratase  55.61 
 
 
644 aa  731    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0585  aconitate hydratase  61.53 
 
 
645 aa  821    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.674704  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1771  aconitate hydratase  54.37 
 
 
641 aa  684    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0423  aconitate hydratase  61.53 
 
 
645 aa  821    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.82263  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23930  aconitate hydratase  51.01 
 
 
649 aa  674    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.161871  normal  0.0821905 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4177  aconitate hydratase  52.05 
 
 
647 aa  662    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.13774  normal  0.304204 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2707  aconitate hydratase  53.26 
 
 
660 aa  691    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1803  aconitate hydratase  51.24 
 
 
657 aa  703    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3767  aconitate hydratase  68.02 
 
 
640 aa  914    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2450  aconitate hydratase  51.79 
 
 
644 aa  674    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2763  aconitate hydratase  55.28 
 
 
648 aa  719    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1406  aconitate hydratase  56.72 
 
 
643 aa  732    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.258962  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3193  aconitate hydratase  55.21 
 
 
640 aa  698    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.249489  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1882  aconitate hydratase  68.91 
 
 
641 aa  886    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.111034  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0597  aconitate hydratase  51.46 
 
 
658 aa  690    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0416  aconitate hydratase  72.03 
 
 
639 aa  957    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2176  aconitate hydratase  85.18 
 
 
642 aa  1145    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0828952  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2824  aconitate hydratase  50.54 
 
 
660 aa  657    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2153  aconitate hydratase  61.84 
 
 
644 aa  829    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0285  aconitate hydratase  60.71 
 
 
646 aa  796    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2106  aconitate hydratase  53.89 
 
 
645 aa  709    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.12781  normal  0.0131142 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0098  aconitate hydratase  51.07 
 
 
661 aa  676    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0020  aconitate hydratase  56.5 
 
 
644 aa  754    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2774  aconitate hydratase  48.53 
 
 
661 aa  639    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3021  aconitate hydratase  56.96 
 
 
641 aa  717    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1930  aconitate hydratase  57.57 
 
 
642 aa  735    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.221002  normal  0.0834672 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3383  aconitate hydratase  51.77 
 
 
657 aa  706    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3158  aconitate hydratase  100 
 
 
642 aa  1316    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107146  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2258  aconitate hydratase  56.12 
 
 
648 aa  728    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1102  aconitate hydratase  59.53 
 
 
642 aa  785    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3640  aconitate hydratase  49.62 
 
 
656 aa  663    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.506746  normal  0.0138117 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0908  aconitate hydratase  50.15 
 
 
668 aa  632  1e-180  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.410888  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5705  aconitate hydratase  48.53 
 
 
659 aa  633  1e-180  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.762683  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4932  aconitate hydratase  49.38 
 
 
652 aa  627  1e-178  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450299  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05770  aconitate hydratase  48.61 
 
 
647 aa  622  1e-177  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.295611  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0971  aconitate hydratase  34.92 
 
 
760 aa  363  7.0000000000000005e-99  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00945  aconitate hydratase  36.29 
 
 
755 aa  360  5e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.181334  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2025  aconitate hydratase  35.25 
 
 
755 aa  359  8e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1408  aconitate hydratase  33.66 
 
 
755 aa  358  1.9999999999999998e-97  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2223  aconitate hydratase  35.5 
 
 
755 aa  357  3.9999999999999996e-97  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274844  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND02620  aconitase, putative  35.2 
 
 
792 aa  355  1e-96  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1482  aconitate hydratase  35.08 
 
 
754 aa  355  2e-96  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1208  aconitate hydratase  34.62 
 
 
756 aa  352  2e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.2348  normal  0.0471939 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2016  aconitate hydratase  34.57 
 
 
757 aa  350  6e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00964954 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0660  aconitate hydratase  34.57 
 
 
758 aa  348  2e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03894  aconitate hydratase, mitochondrial, putative (Eurofung)  33.38 
 
 
796 aa  341  2e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.26439  normal  0.611037 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01590  aconitate hydratase, putative  33.65 
 
 
770 aa  342  2e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90724  aconitate hydratase  33.51 
 
 
800 aa  341  2e-92  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.319181 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01770  aconitate hydratase, putative  33.02 
 
 
787 aa  338  9.999999999999999e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00912812  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05300  aconitate hydratase, putative (Eurofung)  32.52 
 
 
798 aa  330  7e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.29403  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05525  Aconitase Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J267]  33.92 
 
 
783 aa  327  5e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.842678 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2702  aconitate hydratase  33.75 
 
 
751 aa  326  1e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1952  aconitate hydratase  33.38 
 
 
765 aa  321  1.9999999999999998e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85181  Aconitase, mitochondrial  33.88 
 
 
780 aa  317  3e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.154992  normal  0.331758 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0621  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.91 
 
 
418 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0188797  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0646  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.91 
 
 
418 aa  306  6e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00455068  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1466  homoaconitate hydratase family protein  37.56 
 
 
429 aa  289  1e-76  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0167474  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1100  3-isopropylmalate dehydratase  38.13 
 
 
418 aa  283  7.000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2965  homoaconitase  32.66 
 
 
655 aa  281  3e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.556593  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1191  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  38.39 
 
 
424 aa  276  1.0000000000000001e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88705  homoaconitase  31.09 
 
 
677 aa  276  1.0000000000000001e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.933626  normal  0.508507 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0015  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.19 
 
 
418 aa  274  4.0000000000000004e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0448  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.08 
 
 
417 aa  271  2e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1630  3-isopropylmalate dehydratase  37.32 
 
 
418 aa  271  2e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0402  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.39 
 
 
418 aa  270  5.9999999999999995e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.344506 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2220  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  37.89 
 
 
415 aa  267  5e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_390  aconitase/homoaconitase/3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  36.6 
 
 
417 aa  267  5e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0425  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.08 
 
 
431 aa  264  4e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2254  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38 
 
 
421 aa  262  1e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0129  homoaconitate hydratase family protein  35.8 
 
 
418 aa  262  2e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.525388  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1588  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  36.04 
 
 
419 aa  261  2e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1704  homoaconitate hydratase family protein  33.66 
 
 
419 aa  258  2e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1458  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.2 
 
 
419 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.888399  normal  0.260054 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2075  3-isopropylmalate dehydratase  36.75 
 
 
416 aa  255  1.0000000000000001e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0596  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.78 
 
 
420 aa  253  9.000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000659262  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10870  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  36.34 
 
 
420 aa  252  1e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1693  homoaconitate hydratase family protein  35.63 
 
 
424 aa  251  2e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27842  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1610  homoaconitate hydratase family protein  35.4 
 
 
417 aa  250  4e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3356  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  36.82 
 
 
421 aa  249  8e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0519  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.24 
 
 
424 aa  249  8e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000192959  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3516  3-isopropylmalate dehydratase  35.63 
 
 
410 aa  248  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2485  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.02 
 
 
424 aa  248  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.836058  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0356  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.02 
 
 
420 aa  248  3e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.928431  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2728  3-isopropylmalate dehydratase  38.33 
 
 
416 aa  248  3e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0390  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.87 
 
 
419 aa  248  4e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2338  homoaconitate hydratase family protein  33.65 
 
 
418 aa  247  6e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1036  homoaconitate hydratase family protein  34.37 
 
 
418 aa  246  6.999999999999999e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2211  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.49 
 
 
419 aa  246  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00871543  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0126  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.25 
 
 
419 aa  245  1.9999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1030  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.26 
 
 
431 aa  244  3e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000620705 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2101  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.67 
 
 
429 aa  243  5e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0493977  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0747  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.69 
 
 
416 aa  243  1e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0741  homoaconitate hydratase family protein  34.94 
 
 
432 aa  242  1e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375835  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>