More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2025 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001302  ANIA_03894  aconitate hydratase, mitochondrial, putative (Eurofung)  54.1 
 
 		 796 aa  784    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.26439  normal  0.611037 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05300  aconitate hydratase, putative (Eurofung)  52.58 
 
 		 798 aa  790    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.29403  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05525  Aconitase Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J267]  63.02 
 
 		 783 aa  959    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.842678 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1482  aconitate hydratase  56.42 
 
 		 754 aa  881    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1408  aconitate hydratase  58.88 
 
 		 755 aa  906    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01770  aconitate hydratase, putative  53.14 
 
 		 787 aa  761    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00912812  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02620  aconitase, putative  61.94 
 
 		 792 aa  944    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01590  aconitate hydratase, putative  54.25 
 
 		 770 aa  830    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2702  aconitate hydratase  62.52 
 
 		 751 aa  992    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90724  aconitate hydratase  55.48 
 
 		 800 aa  792    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.319181 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1208  aconitate hydratase  81.07 
 
 		 756 aa  1256    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.2348  normal  0.0471939 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0660  aconitate hydratase  76.03 
 
 		 758 aa  1177    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1952  aconitate hydratase  72.5 
 
 		 765 aa  1146    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2016  aconitate hydratase  79.79 
 
 		 757 aa  1264    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964954 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0971  aconitate hydratase  70.28 
 
 		 760 aa  1104    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2223  aconitate hydratase  75.33 
 
 		 755 aa  1178    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85181  Aconitase, mitochondrial  62.14 
 
 		 780 aa  935    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.154992  normal  0.331758 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2025  aconitate hydratase  100 
 
 		 755 aa  1561    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00945  aconitate hydratase  68.57 
 
 		 755 aa  1084    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.181334  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0606  aconitate hydratase  38.5 
 
 		 655 aa  384  1e-105  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0423  aconitate hydratase  40.35 
 
 		 645 aa  374  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.82263  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0585  aconitate hydratase  40.35 
 
 		 645 aa  374  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.674704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3767  aconitate hydratase  36.43 
 
 		 640 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0416  aconitate hydratase  35.88 
 
 		 639 aa  367  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0524  aconitate hydratase  37.1 
 
 		 643 aa  363  6e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000206753  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2176  aconitate hydratase  34.44 
 
 		 642 aa  362  2e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0828952  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3158  aconitate hydratase  35.25 
 
 		 642 aa  359  9e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107146  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1771  aconitate hydratase  36.29 
 
 		 641 aa  359  9e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1406  aconitate hydratase  33.93 
 
 		 643 aa  357  5e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.258962  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0020  aconitate hydratase  37.43 
 
 		 644 aa  357  5e-97  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1102  aconitate hydratase  35.15 
 
 		 642 aa  351  3e-95  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1882  aconitate hydratase  36.58 
 
 		 641 aa  348  2e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.111034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1966  aconitate hydratase  34.99 
 
 		 648 aa  347  4e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1930  aconitate hydratase  34.6 
 
 		 642 aa  347  4e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.221002  normal  0.0834672 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2258  aconitate hydratase  33.97 
 
 		 648 aa  345  1e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0285  aconitate hydratase  35.96 
 
 		 646 aa  343  5.999999999999999e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1265  aconitate hydratase  35.88 
 
 		 644 aa  342  2e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3193  aconitate hydratase  35.45 
 
 		 640 aa  341  2.9999999999999998e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.249489  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3021  aconitate hydratase  33.74 
 
 		 641 aa  331  3e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1612  aconitate hydratase  34.21 
 
 		 646 aa  330  6e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2153  aconitate hydratase  34.46 
 
 		 644 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2445  aconitate hydratase  34.07 
 
 		 645 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.430041  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0098  aconitate hydratase  35.69 
 
 		 661 aa  323  7e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2450  aconitate hydratase  34.43 
 
 		 644 aa  323  9.000000000000001e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2707  aconitate hydratase  32.28 
 
 		 660 aa  323  9.999999999999999e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2763  aconitate hydratase  34.27 
 
 		 648 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3383  aconitate hydratase  35.16 
 
 		 657 aa  318  2e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1336  aconitate hydratase  35.09 
 
 		 656 aa  315  1.9999999999999998e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0597  aconitate hydratase  35.42 
 
 		 658 aa  315  1.9999999999999998e-84  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1803  aconitate hydratase  35.12 
 
 		 657 aa  311  2.9999999999999997e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23930  aconitate hydratase  32.6 
 
 		 649 aa  305  2.0000000000000002e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.161871  normal  0.0821905 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2106  aconitate hydratase  33.58 
 
 		 645 aa  305  3.0000000000000004e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.12781  normal  0.0131142 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2824  aconitate hydratase  32.41 
 
 		 660 aa  293  8e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4177  aconitate hydratase  31.64 
 
 		 647 aa  291  4e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.13774  normal  0.304204 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0908  aconitate hydratase  31.68 
 
 		 668 aa  288  4e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.410888  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2774  aconitate hydratase  30.92 
 
 		 661 aa  284  5.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5705  aconitate hydratase  32.7 
 
 		 659 aa  282  1e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.762683  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3640  aconitate hydratase  30.23 
 
 		 656 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.506746  normal  0.0138117 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4932  aconitate hydratase  30.48 
 
 		 652 aa  273  7e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4768  aconitate hydratase  31.56 
 
 		 674 aa  264  4e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.682164  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6080  aconitate hydratase  29.98 
 
 		 865 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.76062 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2301  aconitate hydratase  29.6 
 
 		 865 aa  250  7e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22008 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0224  aconitase  28.57 
 
 		 907 aa  250  7e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05770  aconitate hydratase  30.65 
 
 		 647 aa  249  1e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.295611  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02721  aconitate hydratase  29.3 
 
 		 863 aa  248  4e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53970  aconitate hydratase  28.84 
 
 		 868 aa  242  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1937  aconitate hydratase  28.94 
 
 		 862 aa  241  4e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000188613 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2336  aconitate hydratase  28.94 
 
 		 862 aa  240  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000568872 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3434  aconitate hydratase  28.94 
 
 		 863 aa  240  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.070835  normal  0.23906 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2068  aconitate hydratase 1  28.48 
 
 		 855 aa  239  1e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.461258  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003390  2-methylcitrate dehydratase FeS dependent  28.5 
 
 		 863 aa  239  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.828333  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0174  aconitate hydratase 1  29.32 
 
 		 900 aa  239  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0847223  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1777  aconitate hydratase  28.5 
 
 		 862 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00224724  hitchhiker  0.000953384 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1766  aconitate hydratase  28.8 
 
 		 864 aa  239  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4724  aconitate hydratase  28.6 
 
 		 868 aa  239  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6708  aconitate hydratase  29.55 
 
 		 870 aa  239  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1868  aconitate hydratase  28.35 
 
 		 864 aa  238  3e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0877  aconitate hydratase  28.35 
 
 		 864 aa  238  3e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0828  aconitate hydratase  28.24 
 
 		 883 aa  238  4e-61  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00982227  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2141  aconitate hydratase  28.23 
 
 		 864 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5861  aconitate hydratase  29.16 
 
 		 875 aa  237  5.0000000000000005e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.370174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1164  aconitate hydratase  28.23 
 
 		 864 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1738  aconitate hydratase  28.52 
 
 		 864 aa  237  8e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0384  aconitate hydratase  28.52 
 
 		 864 aa  236  8e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.419357  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0290  aconitate hydratase  28.52 
 
 		 864 aa  236  8e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3289  aconitate hydratase  28.85 
 
 		 866 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0578513 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02395  aconitate hydratase  28.78 
 
 		 869 aa  236  1.0000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2861  aconitase  28.38 
 
 		 891 aa  236  1.0000000000000001e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.509308  normal  0.643421 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23230  aconitate hydratase  29.98 
 
 		 867 aa  236  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.438078  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03372  aconitate hydratase  29.16 
 
 		 863 aa  235  2.0000000000000002e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1925  aconitate hydratase  27.61 
 
 		 916 aa  235  3e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128572  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3587  aconitate hydratase  29.04 
 
 		 875 aa  234  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00350966 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0620  aconitate hydratase  29.48 
 
 		 874 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.343199  normal  0.507089 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0313  aconitate hydratase  29.23 
 
 		 863 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2060  aconitate hydratase  28.78 
 
 		 897 aa  233  8.000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1467  aconitate hydratase  29.83 
 
 		 840 aa  233  1e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2264  aconitate hydratase  28.14 
 
 		 907 aa  233  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1112  aconitate hydratase  27.92 
 
 		 885 aa  232  2e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.58218 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2603  aconitate hydratase  28.82 
 
 		 872 aa  232  2e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120412  hitchhiker  0.000028644 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3631  aconitate hydratase  28.99 
 
 		 863 aa  231  3e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>