More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1482 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001302  ANIA_03894  aconitate hydratase, mitochondrial, putative (Eurofung)  48.23 
 
 
796 aa  714    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.26439  normal  0.611037 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05300  aconitate hydratase, putative (Eurofung)  49.07 
 
 
798 aa  751    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.29403  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05525  Aconitase Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J267]  55.6 
 
 
783 aa  840    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.842678 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0660  aconitate hydratase  57.09 
 
 
758 aa  875    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01770  aconitate hydratase, putative  51.06 
 
 
787 aa  741    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00912812  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02620  aconitase, putative  55.01 
 
 
792 aa  857    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01590  aconitate hydratase, putative  51.28 
 
 
770 aa  787    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85181  Aconitase, mitochondrial  54.86 
 
 
780 aa  816    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.154992  normal  0.331758 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90724  aconitate hydratase  50.33 
 
 
800 aa  755    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.319181 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2016  aconitate hydratase  57.85 
 
 
757 aa  892    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00964954 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0971  aconitate hydratase  56.97 
 
 
760 aa  882    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1482  aconitate hydratase  100 
 
 
754 aa  1560    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1408  aconitate hydratase  54.65 
 
 
755 aa  857    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2702  aconitate hydratase  52.88 
 
 
751 aa  820    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1208  aconitate hydratase  56.3 
 
 
756 aa  872    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.2348  normal  0.0471939 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2223  aconitate hydratase  57.1 
 
 
755 aa  882    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274844  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00945  aconitate hydratase  57.35 
 
 
755 aa  887    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.181334  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2025  aconitate hydratase  56.42 
 
 
755 aa  881    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1952  aconitate hydratase  57.99 
 
 
765 aa  895    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0416  aconitate hydratase  36.66 
 
 
639 aa  402  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0585  aconitate hydratase  37.63 
 
 
645 aa  384  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.674704  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0423  aconitate hydratase  37.63 
 
 
645 aa  384  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.82263  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0606  aconitate hydratase  36.07 
 
 
655 aa  381  1e-104  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3767  aconitate hydratase  34.89 
 
 
640 aa  382  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0524  aconitate hydratase  36.38 
 
 
643 aa  374  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000206753  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1930  aconitate hydratase  34.8 
 
 
642 aa  375  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.221002  normal  0.0834672 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1406  aconitate hydratase  34.85 
 
 
643 aa  367  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.258962  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3193  aconitate hydratase  34.29 
 
 
640 aa  365  1e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.249489  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0285  aconitate hydratase  35.91 
 
 
646 aa  361  2e-98  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1882  aconitate hydratase  36.45 
 
 
641 aa  358  1.9999999999999998e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.111034  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2176  aconitate hydratase  35.08 
 
 
642 aa  355  1e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0828952  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3158  aconitate hydratase  35.08 
 
 
642 aa  355  2e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107146  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1771  aconitate hydratase  34.11 
 
 
641 aa  354  2.9999999999999997e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3021  aconitate hydratase  33.98 
 
 
641 aa  350  4e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1966  aconitate hydratase  33.98 
 
 
648 aa  346  1e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2258  aconitate hydratase  33.29 
 
 
648 aa  343  5.999999999999999e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2763  aconitate hydratase  33.33 
 
 
648 aa  343  7e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2153  aconitate hydratase  35.87 
 
 
644 aa  343  1e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2445  aconitate hydratase  33.65 
 
 
645 aa  340  4e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.430041  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1612  aconitate hydratase  34.44 
 
 
646 aa  340  8e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0020  aconitate hydratase  33.06 
 
 
644 aa  339  9.999999999999999e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0597  aconitate hydratase  35.95 
 
 
658 aa  337  5e-91  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1102  aconitate hydratase  34.81 
 
 
642 aa  337  7e-91  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3383  aconitate hydratase  34.58 
 
 
657 aa  336  1e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1265  aconitate hydratase  33.58 
 
 
644 aa  334  4e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2707  aconitate hydratase  32.65 
 
 
660 aa  334  5e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2450  aconitate hydratase  32.47 
 
 
644 aa  331  3e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2824  aconitate hydratase  34.13 
 
 
660 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1336  aconitate hydratase  34.76 
 
 
656 aa  327  4.0000000000000003e-88  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1803  aconitate hydratase  34.95 
 
 
657 aa  326  1e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23930  aconitate hydratase  32.56 
 
 
649 aa  325  3e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.161871  normal  0.0821905 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0908  aconitate hydratase  32.78 
 
 
668 aa  322  9.999999999999999e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.410888  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0098  aconitate hydratase  35.34 
 
 
661 aa  322  9.999999999999999e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2106  aconitate hydratase  32.65 
 
 
645 aa  322  1.9999999999999998e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.12781  normal  0.0131142 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4932  aconitate hydratase  33.47 
 
 
652 aa  314  3.9999999999999997e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450299  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4177  aconitate hydratase  33.53 
 
 
647 aa  313  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.13774  normal  0.304204 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3640  aconitate hydratase  31.29 
 
 
656 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.506746  normal  0.0138117 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5705  aconitate hydratase  31.92 
 
 
659 aa  306  7e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.762683  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2774  aconitate hydratase  31.47 
 
 
661 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4768  aconitate hydratase  31.8 
 
 
674 aa  283  1e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.682164  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05770  aconitate hydratase  30.9 
 
 
647 aa  280  6e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.295611  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1467  aconitate hydratase  29.21 
 
 
840 aa  253  1e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2230  aconitate hydratase  27.87 
 
 
890 aa  244  3.9999999999999997e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000744692  decreased coverage  0.000375286 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2068  aconitate hydratase 1  28.71 
 
 
855 aa  244  5e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.461258  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2060  aconitate hydratase  28.5 
 
 
897 aa  244  5e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1920  aconitate hydratase  27.75 
 
 
890 aa  243  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00387998  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2030  aconitate hydratase  28.18 
 
 
890 aa  242  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.326085  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0828  aconitate hydratase  28.45 
 
 
883 aa  239  2e-61  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00982227  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0921  aconitate hydratase  28.37 
 
 
901 aa  237  7e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.446396  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1031  aconitate hydratase  28.43 
 
 
875 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0204  aconitate hydratase  28.07 
 
 
906 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0875867 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1439  aconitate hydratase  28.07 
 
 
901 aa  235  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0727527  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1412  aconitate hydratase  28.07 
 
 
901 aa  235  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.881286  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2862  aconitate hydratase 1  28.31 
 
 
899 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2637  aconitate hydratase 1  28.31 
 
 
899 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2861  aconitase  28.43 
 
 
891 aa  233  7.000000000000001e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.509308  normal  0.643421 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2654  aconitate hydratase  27.76 
 
 
890 aa  232  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0109909  unclonable  0.0000000764154 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0330  aconitate hydratase  29.96 
 
 
877 aa  230  6e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00865335  normal  0.101223 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2760  aconitate hydratase 1  27.97 
 
 
899 aa  230  7e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08420  aconitase  27.33 
 
 
884 aa  230  9e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0660302  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0291  aconitate hydratase  26.57 
 
 
905 aa  229  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0448672 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2113  aconitate hydratase  27.3 
 
 
868 aa  228  3e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3580  aconitate hydratase 1  27.83 
 
 
899 aa  228  4e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.068843  normal  0.451076 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0224  aconitase  27.63 
 
 
907 aa  228  4e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1246  aconitate hydratase  28.59 
 
 
887 aa  228  4e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1402  aconitate hydratase 1  26.89 
 
 
934 aa  227  7e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.365694  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0199  aconitate hydratase  27.08 
 
 
905 aa  227  7e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00485304  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3640  aconitate hydratase  27.81 
 
 
907 aa  226  8e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.593974  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3635  aconitate hydratase  27.81 
 
 
907 aa  226  9e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533912  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3408  aconitate hydratase  27.81 
 
 
907 aa  226  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.741284  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3370  aconitate hydratase  27.81 
 
 
907 aa  226  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3320  aconitate hydratase  27.81 
 
 
907 aa  226  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3677  aconitate hydratase  27.81 
 
 
907 aa  226  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3627  aconitate hydratase  27.81 
 
 
907 aa  226  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0135995 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2264  aconitate hydratase  27.93 
 
 
907 aa  226  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1224  aconitate hydratase 1  26.9 
 
 
914 aa  226  1e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0525  aconitate hydratase  26.63 
 
 
905 aa  226  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.123163  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1925  aconitate hydratase  27.07 
 
 
916 aa  225  3e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128572  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6684  aconitate hydratase 1  27.65 
 
 
901 aa  224  4e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.641683  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3871  aconitate hydratase  28.99 
 
 
888 aa  223  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309785  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>