More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2707 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3640  aconitate hydratase  65.75 
 
 		 656 aa  882    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.506746  normal  0.0138117 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2445  aconitate hydratase  55.88 
 
 		 645 aa  743    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.430041  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3767  aconitate hydratase  53.03 
 
 		 640 aa  690    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4932  aconitate hydratase  62.15 
 
 		 652 aa  817    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4177  aconitate hydratase  62.01 
 
 		 647 aa  793    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.13774  normal  0.304204 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23930  aconitate hydratase  62.71 
 
 		 649 aa  856    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.161871  normal  0.0821905 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0908  aconitate hydratase  63.78 
 
 		 668 aa  842    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.410888  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5705  aconitate hydratase  65.53 
 
 		 659 aa  865    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.762683  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2707  aconitate hydratase  100 
 
 		 660 aa  1361    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2450  aconitate hydratase  56.59 
 
 		 644 aa  746    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2774  aconitate hydratase  64.76 
 
 		 661 aa  872    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2763  aconitate hydratase  56.26 
 
 		 648 aa  744    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05770  aconitate hydratase  62.1 
 
 		 647 aa  793    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.295611  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1882  aconitate hydratase  53.65 
 
 		 641 aa  643    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.111034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2258  aconitate hydratase  58.14 
 
 		 648 aa  759    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0606  aconitate hydratase  51.46 
 
 		 655 aa  681    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1265  aconitate hydratase  55.9 
 
 		 644 aa  734    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0423  aconitate hydratase  53.57 
 
 		 645 aa  675    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.82263  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2176  aconitate hydratase  50.39 
 
 		 642 aa  660    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0828952  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0020  aconitate hydratase  50.77 
 
 		 644 aa  647    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2106  aconitate hydratase  55.5 
 
 		 645 aa  725    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.12781  normal  0.0131142 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4768  aconitate hydratase  64.19 
 
 		 674 aa  841    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.682164  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1612  aconitate hydratase  56.48 
 
 		 646 aa  733    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1966  aconitate hydratase  57.83 
 
 		 648 aa  755    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0524  aconitate hydratase  53.67 
 
 		 643 aa  682    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000206753  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0416  aconitate hydratase  54.76 
 
 		 639 aa  685    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3158  aconitate hydratase  53.26 
 
 		 642 aa  691    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107146  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0585  aconitate hydratase  53.57 
 
 		 645 aa  675    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.674704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1406  aconitate hydratase  48.07 
 
 		 643 aa  610  1e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.258962  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0285  aconitate hydratase  48.67 
 
 		 646 aa  611  1e-173  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2824  aconitate hydratase  50 
 
 		 660 aa  608  9.999999999999999e-173  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3193  aconitate hydratase  48.62 
 
 		 640 aa  600  1e-170  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.249489  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1336  aconitate hydratase  48.47 
 
 		 656 aa  601  1e-170  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1930  aconitate hydratase  48.24 
 
 		 642 aa  598  1e-169  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.221002  normal  0.0834672 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3383  aconitate hydratase  47.97 
 
 		 657 aa  597  1e-169  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1803  aconitate hydratase  47.59 
 
 		 657 aa  594  1e-168  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3021  aconitate hydratase  47.68 
 
 		 641 aa  587  1e-166  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2153  aconitate hydratase  47.66 
 
 		 644 aa  585  1e-166  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1102  aconitate hydratase  46.88 
 
 		 642 aa  574  1.0000000000000001e-162  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0597  aconitate hydratase  49.14 
 
 		 658 aa  575  1.0000000000000001e-162  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1771  aconitate hydratase  47.66 
 
 		 641 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0098  aconitate hydratase  44.38 
 
 		 661 aa  562  1.0000000000000001e-159  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1482  aconitate hydratase  32.65 
 
 		 754 aa  334  4e-90  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1408  aconitate hydratase  33.15 
 
 		 755 aa  333  5e-90  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2025  aconitate hydratase  32.28 
 
 		 755 aa  323  9.000000000000001e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1208  aconitate hydratase  32.6 
 
 		 756 aa  319  1e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.2348  normal  0.0471939 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2223  aconitate hydratase  33.43 
 
 		 755 aa  315  9.999999999999999e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85181  Aconitase, mitochondrial  31.87 
 
 		 780 aa  315  1.9999999999999998e-84  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.154992  normal  0.331758 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00945  aconitate hydratase  32.69 
 
 		 755 aa  312  1e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.181334  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2016  aconitate hydratase  32.14 
 
 		 757 aa  312  1e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964954 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05300  aconitate hydratase, putative (Eurofung)  33.15 
 
 		 798 aa  310  8e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.29403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0660  aconitate hydratase  31.82 
 
 		 758 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND02620  aconitase, putative  32.09 
 
 		 792 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01590  aconitate hydratase, putative  32.03 
 
 		 770 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03894  aconitate hydratase, mitochondrial, putative (Eurofung)  31.25 
 
 		 796 aa  306  1.0000000000000001e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.26439  normal  0.611037 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2702  aconitate hydratase  32.24 
 
 		 751 aa  305  1.0000000000000001e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05525  Aconitase Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J267]  32.05 
 
 		 783 aa  303  7.000000000000001e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.842678 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0971  aconitate hydratase  32.64 
 
 		 760 aa  301  3e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90724  aconitate hydratase  31.58 
 
 		 800 aa  301  3e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.319181 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01770  aconitate hydratase, putative  32.58 
 
 		 787 aa  296  6e-79  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00912812  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1952  aconitate hydratase  31.12 
 
 		 765 aa  295  3e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1466  homoaconitate hydratase family protein  33.09 
 
 		 429 aa  244  3.9999999999999997e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0167474  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0402  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.25 
 
 		 418 aa  236  1.0000000000000001e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.344506 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1630  3-isopropylmalate dehydratase  34.6 
 
 		 418 aa  232  2e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0646  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.65 
 
 		 418 aa  227  5.0000000000000005e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00455068  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1704  homoaconitate hydratase family protein  32.05 
 
 		 419 aa  227  7e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0621  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.41 
 
 		 418 aa  225  2e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0188797  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1100  3-isopropylmalate dehydratase  33.33 
 
 		 418 aa  224  4e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2965  homoaconitase  27.88 
 
 		 655 aa  221  5e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.556593  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2220  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  34.13 
 
 		 415 aa  219  1e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1191  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  31.76 
 
 		 424 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0448  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  32.69 
 
 		 417 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2159  3-isopropylmalate dehydratase  33.82 
 
 		 398 aa  213  7e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.219475 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2075  3-isopropylmalate dehydratase  31.82 
 
 		 416 aa  213  9e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_390  aconitase/homoaconitase/3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  32.45 
 
 		 417 aa  212  2e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1588  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  32.69 
 
 		 419 aa  211  3e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88705  homoaconitase  27.67 
 
 		 677 aa  211  4e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.933626  normal  0.508507 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0425  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  32.62 
 
 		 431 aa  210  6e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2458  hypothetical protein  27.68 
 
 		 763 aa  209  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0160078  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0601  3-isopropylmalate dehydratase  34.1 
 
 		 431 aa  209  2e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1133  hypothetical protein  27.79 
 
 		 783 aa  208  3e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000753668  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2338  homoaconitate hydratase family protein  32.85 
 
 		 418 aa  207  4e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0519  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  30.95 
 
 		 424 aa  206  8e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000192959  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21050  hypothetical protein  27.76 
 
 		 781 aa  206  9e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1693  homoaconitate hydratase family protein  33.1 
 
 		 424 aa  206  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27842  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0015  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.12 
 
 		 418 aa  205  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0356  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.65 
 
 		 420 aa  204  3e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.928431  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0129  homoaconitate hydratase family protein  31.12 
 
 		 418 aa  204  3e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.525388  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3219  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.83 
 
 		 418 aa  204  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0848  homoaconitate hydratase family protein  32.95 
 
 		 431 aa  204  3e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.288921  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1102  3-isopropylmalate dehydratase  31.15 
 
 		 437 aa  204  5e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3356  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  33.97 
 
 		 421 aa  204  6e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0596  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  31.1 
 
 		 420 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2194  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  32.86 
 
 		 421 aa  202  1.9999999999999998e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.454447  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1903  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  31.86 
 
 		 427 aa  201  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473608  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0738  homoaconitate hydratase family protein  32.41 
 
 		 432 aa  201  3e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1900  3-isopropylmalate dehydratase  32.41 
 
 		 431 aa  201  3.9999999999999996e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0390  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.57 
 
 		 419 aa  200  7e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2068  aconitate hydratase 1  27.46 
 
 		 855 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.461258  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2017  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  31.12 
 
 		 419 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>