More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2965 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006680  CNK00580  homoaconitate hydratase, putative  50.92 
 
 
728 aa  647    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2965  homoaconitase  100 
 
 
655 aa  1354    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.556593  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88705  homoaconitase  50 
 
 
677 aa  662    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.933626  normal  0.508507 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06521  Homoaconitase, mitochondrial Precursor (EC 4.2.1.36)(Homoaconitate hydratase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q92412]  46.56 
 
 
776 aa  619  1e-176  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0129  homoaconitate hydratase family protein  38.27 
 
 
418 aa  317  3e-85  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.525388  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1100  3-isopropylmalate dehydratase  39.64 
 
 
418 aa  313  4.999999999999999e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1366  3-isopropylmalate dehydratase  38.19 
 
 
420 aa  307  3e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0524  aconitate hydratase  32.81 
 
 
643 aa  300  5e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000206753  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1630  3-isopropylmalate dehydratase  36.93 
 
 
418 aa  293  6e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0383  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.62 
 
 
417 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0366  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.39 
 
 
417 aa  288  2.9999999999999996e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0621  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.36 
 
 
418 aa  286  9e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0188797  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0646  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.9 
 
 
418 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00455068  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2176  aconitate hydratase  32.72 
 
 
642 aa  285  2.0000000000000002e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0828952  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2220  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  37.01 
 
 
415 aa  282  1e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3158  aconitate hydratase  32.66 
 
 
642 aa  281  3e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107146  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1588  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  36.78 
 
 
419 aa  278  3e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2338  homoaconitate hydratase family protein  35.31 
 
 
418 aa  278  3e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1458  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.07 
 
 
419 aa  273  8.000000000000001e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.888399  normal  0.260054 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1036  homoaconitate hydratase family protein  37.95 
 
 
418 aa  272  1e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1882  aconitate hydratase  32.6 
 
 
641 aa  272  1e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.111034  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1704  homoaconitate hydratase family protein  34.93 
 
 
419 aa  271  2e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0990  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.93 
 
 
423 aa  272  2e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0828  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.79 
 
 
416 aa  268  2.9999999999999995e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2167  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.07 
 
 
431 aa  266  1e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1191  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  35.07 
 
 
424 aa  264  3e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2017  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.65 
 
 
419 aa  263  4.999999999999999e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0098  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  35.32 
 
 
418 aa  263  4.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_732  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  37.56 
 
 
417 aa  263  6.999999999999999e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.999081  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0416  aconitate hydratase  33.28 
 
 
639 aa  263  8.999999999999999e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0747  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.33 
 
 
416 aa  263  1e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1610  homoaconitate hydratase family protein  33.56 
 
 
417 aa  260  6e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0376  3-isopropylmalate dehydratase  33.71 
 
 
416 aa  259  1e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2762  3-isopropylmalate dehydratase  36.93 
 
 
413 aa  258  2e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.452591  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1742  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.6 
 
 
420 aa  258  2e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.482523  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0311  3-isopropylmalate dehydratase  34.54 
 
 
421 aa  258  2e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2211  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.76 
 
 
419 aa  258  2e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00871543  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2263  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.55 
 
 
413 aa  258  3e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10870  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  35.84 
 
 
420 aa  257  4e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1194  homoaconitate hydratase family protein  34.4 
 
 
418 aa  258  4e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0390  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.16 
 
 
419 aa  256  6e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2728  3-isopropylmalate dehydratase  36.43 
 
 
416 aa  256  7e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0596  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.84 
 
 
420 aa  256  7e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000659262  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0583  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  36.24 
 
 
422 aa  256  1.0000000000000001e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00310931  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3767  aconitate hydratase  30.23 
 
 
640 aa  256  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2101  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.25 
 
 
429 aa  255  2.0000000000000002e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0493977  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0423  aconitate hydratase  31.72 
 
 
645 aa  255  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.82263  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0606  aconitate hydratase  32.67 
 
 
655 aa  255  2.0000000000000002e-66  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0585  aconitate hydratase  31.72 
 
 
645 aa  255  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.674704  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3219  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.16 
 
 
418 aa  254  3e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0724  homoaconitate hydratase family protein  34.4 
 
 
418 aa  254  3e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.694886  normal  0.102444 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2075  3-isopropylmalate dehydratase  34.17 
 
 
416 aa  254  4.0000000000000004e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2258  aconitate hydratase  30.12 
 
 
648 aa  254  4.0000000000000004e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0126  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.07 
 
 
419 aa  254  4.0000000000000004e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1406  aconitate hydratase  30.59 
 
 
643 aa  252  1e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.258962  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0015  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.29 
 
 
418 aa  252  1e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0402  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.49 
 
 
418 aa  251  2e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.344506 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1966  aconitate hydratase  29.82 
 
 
648 aa  251  3e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2254  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.16 
 
 
421 aa  251  4e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0506  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.55 
 
 
420 aa  251  4e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0399  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.93 
 
 
424 aa  249  9e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.320252  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1930  aconitate hydratase  31.5 
 
 
642 aa  249  1e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.221002  normal  0.0834672 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1520  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.7 
 
 
424 aa  249  1e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.984893  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3516  3-isopropylmalate dehydratase  35.55 
 
 
410 aa  248  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2153  aconitate hydratase  30.87 
 
 
644 aa  248  2e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0436  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.47 
 
 
424 aa  248  2e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.560563  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2194  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.47 
 
 
421 aa  248  3e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.454447  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0185  homoaconitate hydratase family protein  34.86 
 
 
419 aa  248  4e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.576372  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2106  aconitate hydratase  31.17 
 
 
645 aa  247  4.9999999999999997e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.12781  normal  0.0131142 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0519  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.77 
 
 
424 aa  247  4.9999999999999997e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000192959  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0442  3-isopropylmalate dehydratase  34.32 
 
 
423 aa  246  9.999999999999999e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0357426 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0788  3-isopropylmalate dehydratase  36.07 
 
 
382 aa  246  9.999999999999999e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0789  homoaconitate hydratase family protein  32.71 
 
 
418 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1792  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.52 
 
 
418 aa  243  7.999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.602442 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1030  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.33 
 
 
431 aa  242  1e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000620705 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0285  aconitate hydratase  30.02 
 
 
646 aa  243  1e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0020  aconitate hydratase  32.45 
 
 
644 aa  242  2e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2259  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  33.18 
 
 
421 aa  241  2e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000792323  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1693  homoaconitate hydratase family protein  35.93 
 
 
424 aa  241  2e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27842  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1883  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.24 
 
 
428 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1466  homoaconitate hydratase family protein  31.89 
 
 
429 aa  241  2.9999999999999997e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0167474  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2159  3-isopropylmalate dehydratase  34.98 
 
 
398 aa  241  2.9999999999999997e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.219475 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3356  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  34.7 
 
 
421 aa  241  4e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0356  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.33 
 
 
420 aa  240  5e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.928431  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0124  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  32.65 
 
 
419 aa  240  5.999999999999999e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2485  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.03 
 
 
424 aa  240  6.999999999999999e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.836058  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1961  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.07 
 
 
413 aa  239  8e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.344282  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0286  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.25 
 
 
418 aa  239  9e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0448  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.4 
 
 
417 aa  239  1e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0476  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.79 
 
 
431 aa  239  1e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0146744  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1053  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.79 
 
 
421 aa  238  2e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1265  aconitate hydratase  30.1 
 
 
644 aa  239  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3474  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.56 
 
 
419 aa  238  3e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0568206  hitchhiker  0.00508785 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1949  homoaconitate hydratase family protein  34.78 
 
 
417 aa  238  3e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2361  homoaconitate hydratase family protein  34.17 
 
 
417 aa  237  5.0000000000000005e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.859627 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_390  aconitase/homoaconitase/3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  34.17 
 
 
417 aa  236  9e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1771  aconitate hydratase  31.6 
 
 
641 aa  236  9e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0471  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  32.88 
 
 
424 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.699773  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1102  aconitate hydratase  28.31 
 
 
642 aa  236  1.0000000000000001e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0607  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  35.91 
 
 
392 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.181914 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>