More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0607 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0607  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  100 
 
 		 392 aa  805    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.181914 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2075  3-isopropylmalate dehydratase  73.21 
 
 		 416 aa  610  9.999999999999999e-175  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0185  homoaconitate hydratase family protein  74.49 
 
 		 419 aa  607  9.999999999999999e-173  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.576372  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1949  homoaconitate hydratase family protein  74.05 
 
 		 417 aa  590  1e-167  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2361  homoaconitate hydratase family protein  70.15 
 
 		 417 aa  571  1e-161  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.859627 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2167  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  60.15 
 
 		 431 aa  501  1e-140  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0990  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  59.64 
 
 		 423 aa  495  1e-139  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1883  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  60.15 
 
 		 428 aa  486  1e-136  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0436  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  54.89 
 
 		 424 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.560563  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0399  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  54.64 
 
 		 424 aa  449  1e-125  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.320252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0471  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  54.89 
 
 		 424 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.699773  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1520  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  54.14 
 
 		 424 aa  442  1e-123  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.984893  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0289  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  53.5 
 
 		 425 aa  435  1e-121  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1100  3-isopropylmalate dehydratase  51.28 
 
 		 418 aa  403  1e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2263  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  52.54 
 
 		 413 aa  395  1e-109  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2338  homoaconitate hydratase family protein  47.83 
 
 		 418 aa  392  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0376  3-isopropylmalate dehydratase  48.72 
 
 		 416 aa  384  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0356  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  49.49 
 
 		 420 aa  381  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.928431  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1194  homoaconitate hydratase family protein  47.46 
 
 		 418 aa  376  1e-103  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1588  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  50.63 
 
 		 419 aa  378  1e-103  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0390  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  52.33 
 
 		 419 aa  377  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0596  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  49.74 
 
 		 420 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0098  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  47.72 
 
 		 418 aa  375  1e-103  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2254  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  50.89 
 
 		 421 aa  374  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0724  homoaconitate hydratase family protein  47.21 
 
 		 418 aa  373  1e-102  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.694886  normal  0.102444 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1191  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  48.09 
 
 		 424 aa  372  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0828  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  49.23 
 
 		 416 aa  371  1e-101  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1961  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  49.87 
 
 		 413 aa  369  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.344282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_732  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  48.98 
 
 		 417 aa  369  1e-101  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.999081  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1366  3-isopropylmalate dehydratase  47.3 
 
 		 420 aa  370  1e-101  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1466  homoaconitate hydratase family protein  47.09 
 
 		 429 aa  368  1e-101  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0167474  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1458  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  48.45 
 
 		 419 aa  370  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.888399  normal  0.260054 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0747  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  49.23 
 
 		 416 aa  370  1e-101  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0311  3-isopropylmalate dehydratase  45.09 
 
 		 421 aa  367  1e-100  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0789  homoaconitate hydratase family protein  46.08 
 
 		 418 aa  367  1e-100  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2485  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  47.97 
 
 		 424 aa  367  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.836058  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1630  3-isopropylmalate dehydratase  44.9 
 
 		 418 aa  365  1e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0402  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  47.58 
 
 		 418 aa  364  2e-99  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.344506 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0519  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  46.56 
 
 		 424 aa  363  4e-99  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000192959  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0448  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  47.72 
 
 		 417 aa  360  2e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0286  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  47.21 
 
 		 418 aa  360  2e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1036  homoaconitate hydratase family protein  48.08 
 
 		 418 aa  360  2e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0788  3-isopropylmalate dehydratase  49.87 
 
 		 382 aa  358  9.999999999999999e-98  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_390  aconitase/homoaconitase/3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  46.95 
 
 		 417 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3219  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  49.1 
 
 		 418 aa  356  3.9999999999999996e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0476  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  49.62 
 
 		 431 aa  354  2e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0146744  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1102  3-isopropylmalate dehydratase  45.45 
 
 		 437 aa  353  2.9999999999999997e-96  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1742  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  48.32 
 
 		 420 aa  353  4e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.482523  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0621  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  48.09 
 
 		 418 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0188797  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0646  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  47.84 
 
 		 418 aa  352  7e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00455068  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1704  homoaconitate hydratase family protein  44.73 
 
 		 419 aa  352  8.999999999999999e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10870  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  47.07 
 
 		 420 aa  351  1e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2220  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  45.41 
 
 		 415 aa  350  2e-95  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2762  3-isopropylmalate dehydratase  46.94 
 
 		 413 aa  350  3e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.452591  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0129  homoaconitate hydratase family protein  45.08 
 
 		 418 aa  349  4e-95  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.525388  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0425  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  46.8 
 
 		 431 aa  349  4e-95  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2987  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  46.06 
 
 		 419 aa  347  1e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3029  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  46.06 
 
 		 419 aa  347  1e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.367513 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0383  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  48.85 
 
 		 417 aa  347  3e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1792  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  49.59 
 
 		 418 aa  346  5e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.602442 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0366  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  48.85 
 
 		 417 aa  345  8e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2142  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  47.7 
 
 		 419 aa  344  1e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.245729  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3474  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.81 
 
 		 419 aa  340  2e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0568206  hitchhiker  0.00508785 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1053  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.56 
 
 		 421 aa  340  2.9999999999999998e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1622  homoaconitate hydratase family protein  44.78 
 
 		 418 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1800  3-isopropylmalate dehydratase  45.64 
 
 		 404 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.947019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04370  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  48.21 
 
 		 423 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.910728 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0015  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  46.8 
 
 		 418 aa  333  2e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2211  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  46.31 
 
 		 419 aa  333  5e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00871543  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0506  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.85 
 
 		 420 aa  332  7.000000000000001e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0227  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  46.29 
 
 		 421 aa  332  8e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0741  homoaconitate hydratase family protein  46.19 
 
 		 432 aa  332  1e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375835  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1610  homoaconitate hydratase family protein  44.62 
 
 		 417 aa  330  2e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1030  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  43.8 
 
 		 431 aa  329  6e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000620705 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0126  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  46.19 
 
 		 419 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2101  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  46.46 
 
 		 429 aa  327  3e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0493977  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3516  3-isopropylmalate dehydratase  43.44 
 
 		 410 aa  321  9.999999999999999e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1903  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.5 
 
 		 427 aa  319  5e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473608  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3356  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  44.42 
 
 		 421 aa  316  5e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3302  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  43.48 
 
 		 421 aa  315  6e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.879653  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2728  homoaconitate hydratase family protein  42.96 
 
 		 439 aa  315  7e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339985  normal  0.0109667 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0583  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  43.99 
 
 		 422 aa  315  7e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00310931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1693  homoaconitate hydratase family protein  42.75 
 
 		 424 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27842  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0420  3-isopropylmalate dehydratase  41 
 
 		 422 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0665356 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2143  3-isopropylmalate dehydratase  44.5 
 
 		 406 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2017  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  43.26 
 
 		 419 aa  312  7.999999999999999e-84  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1268  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  43 
 
 		 427 aa  310  4e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000132862  hitchhiker  0.0000000000181918 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3165  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  43.5 
 
 		 427 aa  310  4e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.770733  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0195  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.13 
 
 		 421 aa  310  4e-83  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2737  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  43.11 
 
 		 427 aa  308  9e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000214153  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3602  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  43.77 
 
 		 417 aa  308  9e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.187655 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1504  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  43.11 
 
 		 427 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.691126 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0634  3-isopropylmalate dehydratase  45.5 
 
 		 403 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0544933  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0608  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.16 
 
 		 421 aa  308  2.0000000000000002e-82  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3709  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  43.5 
 
 		 427 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129198  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0124  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.03 
 
 		 419 aa  306  4.0000000000000004e-82  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0233  hypothetical protein  44.13 
 
 		 417 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2259  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  41.67 
 
 		 421 aa  302  8.000000000000001e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000792323  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0738  homoaconitate hydratase family protein  41.4 
 
 		 432 aa  301  1e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1364  homoaconitate hydratase family protein  41.46 
 
 		 426 aa  300  3e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>