More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1053 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1053  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  100 
 
 		 421 aa  844    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3474  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  95.45 
 
 		 419 aa  807    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0568206  hitchhiker  0.00508785 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3302  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  72.62 
 
 		 421 aa  619  1e-176  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.879653  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3602  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  69.86 
 
 		 417 aa  557  1e-157  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.187655 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2728  3-isopropylmalate dehydratase  55.95 
 
 		 416 aa  438  9.999999999999999e-123  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0442  3-isopropylmalate dehydratase  54.52 
 
 		 423 aa  429  1e-119  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0357426 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1156  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  53.49 
 
 		 419 aa  397  1e-109  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.369104 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0356  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  47.87 
 
 		 420 aa  379  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.928431  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0724  homoaconitate hydratase family protein  41.67 
 
 		 418 aa  365  1e-100  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.694886  normal  0.102444 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2263  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  46.28 
 
 		 413 aa  367  1e-100  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1588  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  41.77 
 
 		 419 aa  364  1e-99  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0129  homoaconitate hydratase family protein  44.42 
 
 		 418 aa  363  2e-99  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.525388  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1194  homoaconitate hydratase family protein  41.67 
 
 		 418 aa  363  3e-99  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0098  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  41.43 
 
 		 418 aa  363  4e-99  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1100  3-isopropylmalate dehydratase  45.93 
 
 		 418 aa  361  1e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1366  3-isopropylmalate dehydratase  44.31 
 
 		 420 aa  358  8e-98  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1191  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  43.4 
 
 		 424 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2762  3-isopropylmalate dehydratase  48.07 
 
 		 413 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.452591  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2254  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  45.86 
 
 		 421 aa  353  2e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0286  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.18 
 
 		 418 aa  353  2e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0519  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.18 
 
 		 424 aa  353  4e-96  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000192959  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2075  3-isopropylmalate dehydratase  43.44 
 
 		 416 aa  352  5e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0596  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  43.5 
 
 		 420 aa  352  5.9999999999999994e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1630  3-isopropylmalate dehydratase  43.5 
 
 		 418 aa  350  2e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1466  homoaconitate hydratase family protein  44 
 
 		 429 aa  351  2e-95  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0167474  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0621  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  43.46 
 
 		 418 aa  349  4e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0188797  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10870  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  43.16 
 
 		 420 aa  349  7e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1458  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  43.23 
 
 		 419 aa  348  1e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.888399  normal  0.260054 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0015  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  43.23 
 
 		 418 aa  348  2e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2220  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  40.05 
 
 		 415 aa  347  2e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0402  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.36 
 
 		 418 aa  346  4e-94  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.344506 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0990  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  43.53 
 
 		 423 aa  345  6e-94  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0646  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.99 
 
 		 418 aa  345  8.999999999999999e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00455068  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1030  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  43.36 
 
 		 431 aa  345  1e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000620705 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2101  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.05 
 
 		 429 aa  344  2e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0493977  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0383  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  43.91 
 
 		 417 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0789  homoaconitate hydratase family protein  39.86 
 
 		 418 aa  343  4e-93  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0788  3-isopropylmalate dehydratase  48.71 
 
 		 382 aa  343  4e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1742  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  43.47 
 
 		 420 aa  343  5e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.482523  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1961  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.95 
 
 		 413 aa  341  2e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.344282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0366  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.23 
 
 		 417 aa  340  2e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1949  homoaconitate hydratase family protein  45.24 
 
 		 417 aa  340  2e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0289  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.79 
 
 		 425 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0399  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.02 
 
 		 424 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.320252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0436  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.53 
 
 		 424 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.560563  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_390  aconitase/homoaconitase/3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  45.5 
 
 		 417 aa  340  4e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2485  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.59 
 
 		 424 aa  340  4e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.836058  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0311  3-isopropylmalate dehydratase  41.04 
 
 		 421 aa  339  5e-92  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0126  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.28 
 
 		 419 aa  338  7e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0448  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  45.02 
 
 		 417 aa  338  8e-92  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0471  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.72 
 
 		 424 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.699773  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2987  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  43.71 
 
 		 419 aa  337  1.9999999999999998e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3029  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  43.71 
 
 		 419 aa  337  1.9999999999999998e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.367513 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1704  homoaconitate hydratase family protein  41.01 
 
 		 419 aa  336  3.9999999999999995e-91  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1520  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.79 
 
 		 424 aa  335  5.999999999999999e-91  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.984893  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2211  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.45 
 
 		 419 aa  335  1e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00871543  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0185  homoaconitate hydratase family protein  43.2 
 
 		 419 aa  334  2e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.576372  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0425  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.79 
 
 		 431 aa  332  1e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2167  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.57 
 
 		 431 aa  331  2e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0227  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  44 
 
 		 421 aa  329  5.0000000000000004e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3516  3-isopropylmalate dehydratase  44.21 
 
 		 410 aa  329  6e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2361  homoaconitate hydratase family protein  42.96 
 
 		 417 aa  329  6e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.859627 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1622  homoaconitate hydratase family protein  39.57 
 
 		 418 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2338  homoaconitate hydratase family protein  41.08 
 
 		 418 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0828  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.11 
 
 		 416 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0747  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.34 
 
 		 416 aa  326  4.0000000000000003e-88  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1610  homoaconitate hydratase family protein  42.52 
 
 		 417 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0607  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  44.56 
 
 		 392 aa  326  6e-88  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.181914 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0376  3-isopropylmalate dehydratase  42.55 
 
 		 416 aa  324  2e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_732  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  41.87 
 
 		 417 aa  323  4e-87  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.999081  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0476  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.55 
 
 		 431 aa  322  8e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0146744  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0390  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.86 
 
 		 419 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0506  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.67 
 
 		 420 aa  318  1e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3356  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  40.19 
 
 		 421 aa  318  2e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1792  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  43.47 
 
 		 418 aa  317  3e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.602442 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2194  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.01 
 
 		 421 aa  315  8e-85  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.454447  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4843  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.96 
 
 		 435 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1883  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.67 
 
 		 428 aa  312  9e-84  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04370  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  42.62 
 
 		 423 aa  311  1e-83  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.910728 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3219  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.15 
 
 		 418 aa  310  2e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1036  homoaconitate hydratase family protein  42.32 
 
 		 418 aa  310  2e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2259  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  39.62 
 
 		 421 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000792323  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2142  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.61 
 
 		 419 aa  308  1.0000000000000001e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.245729  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1167  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.21 
 
 		 415 aa  306  6e-82  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1800  3-isopropylmalate dehydratase  43.81 
 
 		 404 aa  303  5.000000000000001e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.947019  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1102  3-isopropylmalate dehydratase  40.14 
 
 		 437 aa  303  5.000000000000001e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2017  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.71 
 
 		 419 aa  302  9e-81  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0124  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.84 
 
 		 419 aa  300  5e-80  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0599  3-isopropylmalate dehydratase  43.41 
 
 		 403 aa  298  2e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.588182  normal  0.202427 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0583  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  39.05 
 
 		 422 aa  298  2e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00310931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0608  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.86 
 
 		 421 aa  296  4e-79  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0741  homoaconitate hydratase family protein  40.55 
 
 		 432 aa  296  4e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375835  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0275  3-isopropylmalate dehydratase  37.47 
 
 		 415 aa  296  5e-79  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.772667  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1910  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.57 
 
 		 428 aa  295  8e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0830  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.95 
 
 		 415 aa  295  9e-79  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0798  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.57 
 
 		 429 aa  295  9e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.963683  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0195  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.95 
 
 		 421 aa  295  1e-78  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1903  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.58 
 
 		 427 aa  293  4e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473608  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3159  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.8 
 
 		 431 aa  290  3e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000477252  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0420  3-isopropylmalate dehydratase  37.03 
 
 		 422 aa  289  6e-77  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0665356 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>