More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0990 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0990  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  100 
 
 		 423 aa  871    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2167  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  65.27 
 
 		 431 aa  593  1e-168  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1883  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  65.39 
 
 		 428 aa  565  1e-160  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2075  3-isopropylmalate dehydratase  60.67 
 
 		 416 aa  527  1e-148  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1949  homoaconitate hydratase family protein  62.74 
 
 		 417 aa  518  1e-146  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0185  homoaconitate hydratase family protein  60.57 
 
 		 419 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.576372  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2361  homoaconitate hydratase family protein  59.29 
 
 		 417 aa  498  1e-140  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.859627 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0607  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  59.64 
 
 		 392 aa  479  1e-134  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.181914 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0471  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  55.08 
 
 		 424 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.699773  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0289  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  55.53 
 
 		 425 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0399  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  54.25 
 
 		 424 aa  462  1e-129  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.320252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0436  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  54.48 
 
 		 424 aa  464  1e-129  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.560563  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1520  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  53.54 
 
 		 424 aa  456  1e-127  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.984893  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2263  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  53.72 
 
 		 413 aa  433  1e-120  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1961  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  53.12 
 
 		 413 aa  426  1e-118  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.344282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0376  3-isopropylmalate dehydratase  47.84 
 
 		 416 aa  417  9.999999999999999e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1588  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  50 
 
 		 419 aa  412  1e-114  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1100  3-isopropylmalate dehydratase  49.4 
 
 		 418 aa  412  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1466  homoaconitate hydratase family protein  48.45 
 
 		 429 aa  408  1e-113  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0167474  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0311  3-isopropylmalate dehydratase  47.04 
 
 		 421 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1191  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  47.51 
 
 		 424 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1102  3-isopropylmalate dehydratase  47.39 
 
 		 437 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1704  homoaconitate hydratase family protein  46.15 
 
 		 419 aa  400  9.999999999999999e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0098  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  46.19 
 
 		 418 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2338  homoaconitate hydratase family protein  46.04 
 
 		 418 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1194  homoaconitate hydratase family protein  46.19 
 
 		 418 aa  397  1e-109  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0596  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  47.98 
 
 		 420 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0724  homoaconitate hydratase family protein  45.95 
 
 		 418 aa  397  1e-109  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.694886  normal  0.102444 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1630  3-isopropylmalate dehydratase  45.8 
 
 		 418 aa  397  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0129  homoaconitate hydratase family protein  46.78 
 
 		 418 aa  396  1e-109  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.525388  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1036  homoaconitate hydratase family protein  48.44 
 
 		 418 aa  389  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0402  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  47.37 
 
 		 418 aa  390  1e-107  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.344506 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1366  3-isopropylmalate dehydratase  46.43 
 
 		 420 aa  390  1e-107  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0286  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  47.97 
 
 		 418 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0448  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  47.37 
 
 		 417 aa  385  1e-106  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0356  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  47.62 
 
 		 420 aa  387  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.928431  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0519  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  45.24 
 
 		 424 aa  385  1e-106  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000192959  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10870  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  49.05 
 
 		 420 aa  386  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0788  3-isopropylmalate dehydratase  51.42 
 
 		 382 aa  386  1e-106  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2485  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  45.71 
 
 		 424 aa  385  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.836058  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0789  homoaconitate hydratase family protein  45.71 
 
 		 418 aa  387  1e-106  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_390  aconitase/homoaconitase/3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  46.65 
 
 		 417 aa  382  1e-105  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0621  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  47.61 
 
 		 418 aa  384  1e-105  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0188797  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2762  3-isopropylmalate dehydratase  47.58 
 
 		 413 aa  385  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.452591  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0646  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  47.37 
 
 		 418 aa  383  1e-105  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00455068  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2987  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  47.85 
 
 		 419 aa  384  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3029  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  47.85 
 
 		 419 aa  384  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.367513 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0383  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  48.33 
 
 		 417 aa  379  1e-104  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2142  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  47.38 
 
 		 419 aa  379  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.245729  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0425  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  45.93 
 
 		 431 aa  375  1e-103  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2254  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  47.62 
 
 		 421 aa  376  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3516  3-isopropylmalate dehydratase  46.27 
 
 		 410 aa  375  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0366  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  48.33 
 
 		 417 aa  377  1e-103  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0828  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  46.04 
 
 		 416 aa  369  1e-101  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_732  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  46.04 
 
 		 417 aa  367  1e-100  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.999081  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2220  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  43.03 
 
 		 415 aa  365  1e-100  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0747  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  45.8 
 
 		 416 aa  365  1e-100  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0390  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  46.3 
 
 		 419 aa  364  1e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0015  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.87 
 
 		 418 aa  363  3e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0227  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  46.56 
 
 		 421 aa  360  2e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3356  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  45 
 
 		 421 aa  359  4e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1458  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.39 
 
 		 419 aa  358  7e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.888399  normal  0.260054 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2101  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.39 
 
 		 429 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0493977  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2211  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  45 
 
 		 419 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00871543  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1622  homoaconitate hydratase family protein  43.65 
 
 		 418 aa  355  1e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0126  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  45 
 
 		 419 aa  353  4e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1742  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  45.71 
 
 		 420 aa  352  7e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.482523  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0583  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  46.54 
 
 		 422 aa  352  1e-95  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00310931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0476  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.29 
 
 		 431 aa  350  3e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0146744  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1610  homoaconitate hydratase family protein  44.12 
 
 		 417 aa  350  4e-95  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0506  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.52 
 
 		 420 aa  348  1e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3219  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.71 
 
 		 418 aa  347  2e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04370  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  46.3 
 
 		 423 aa  347  2e-94  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.910728 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0738  homoaconitate hydratase family protein  42.33 
 
 		 432 aa  346  3e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0124  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.89 
 
 		 419 aa  346  3e-94  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1800  3-isopropylmalate dehydratase  43.83 
 
 		 404 aa  346  4e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.947019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1053  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  43.53 
 
 		 421 aa  345  6e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2194  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  43.71 
 
 		 421 aa  345  8e-94  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.454447  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3474  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.59 
 
 		 419 aa  343  2.9999999999999997e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0568206  hitchhiker  0.00508785 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1792  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  45.73 
 
 		 418 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.602442 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2017  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  43.91 
 
 		 419 aa  342  7e-93  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1030  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.6 
 
 		 431 aa  340  4e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000620705 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1903  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  43.46 
 
 		 427 aa  339  7e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473608  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2259  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  42.65 
 
 		 421 aa  338  8e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000792323  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0741  homoaconitate hydratase family protein  42.82 
 
 		 432 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375835  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0420  3-isopropylmalate dehydratase  40.19 
 
 		 422 aa  335  1e-90  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0665356 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1364  homoaconitate hydratase family protein  42.22 
 
 		 426 aa  334  2e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0233  hypothetical protein  43.99 
 
 		 417 aa  334  2e-90  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3602  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  45.43 
 
 		 417 aa  333  3e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.187655 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0195  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  43.26 
 
 		 421 aa  333  3e-90  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0601  3-isopropylmalate dehydratase  41.4 
 
 		 431 aa  332  1e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0275  3-isopropylmalate dehydratase  42.14 
 
 		 415 aa  328  9e-89  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.772667  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0110  homoaconitate hydratase family protein  40.65 
 
 		 435 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0608  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  43.71 
 
 		 421 aa  327  2.0000000000000001e-88  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1722  homoaconitate hydratase family protein  41.53 
 
 		 432 aa  326  4.0000000000000003e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.410724 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0848  homoaconitate hydratase family protein  41.38 
 
 		 431 aa  325  7e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.288921  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1900  3-isopropylmalate dehydratase  40.51 
 
 		 431 aa  325  1e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2143  3-isopropylmalate dehydratase  44.18 
 
 		 406 aa  325  1e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3302  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.15 
 
 		 421 aa  323  3e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.879653  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2175  homoaconitate hydratase family protein  40.84 
 
 		 431 aa  323  5e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>