More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1036 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1036  homoaconitate hydratase family protein  100 
 
 		 418 aa  849    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2338  homoaconitate hydratase family protein  73.44 
 
 		 418 aa  659    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1100  3-isopropylmalate dehydratase  70.81 
 
 		 418 aa  628  1e-179  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0376  3-isopropylmalate dehydratase  68.66 
 
 		 416 aa  608  1e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1704  homoaconitate hydratase family protein  60.29 
 
 		 419 aa  539  9.999999999999999e-153  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1630  3-isopropylmalate dehydratase  56.59 
 
 		 418 aa  512  1e-144  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1466  homoaconitate hydratase family protein  53.33 
 
 		 429 aa  465  9.999999999999999e-131  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0167474  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3516  3-isopropylmalate dehydratase  54.92 
 
 		 410 aa  461  9.999999999999999e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0621  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  54.29 
 
 		 418 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0188797  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0646  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  54.05 
 
 		 418 aa  444  1e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00455068  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0448  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  52.87 
 
 		 417 aa  435  1e-121  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0402  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  50.84 
 
 		 418 aa  435  1e-121  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.344506 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1588  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  48.93 
 
 		 419 aa  432  1e-120  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_390  aconitase/homoaconitase/3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  51.91 
 
 		 417 aa  427  1e-118  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0425  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  51.91 
 
 		 431 aa  426  1e-118  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0129  homoaconitate hydratase family protein  47.26 
 
 		 418 aa  422  1e-117  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.525388  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2254  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  50.36 
 
 		 421 aa  422  1e-117  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10870  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  49.76 
 
 		 420 aa  421  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0356  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  51.43 
 
 		 420 aa  419  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.928431  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1961  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  50.97 
 
 		 413 aa  415  9.999999999999999e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.344282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2987  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  52.03 
 
 		 419 aa  417  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3029  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  52.03 
 
 		 419 aa  417  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.367513 
 
 
-
 
NC_002936  DET0828  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  50.24 
 
 		 416 aa  412  1e-114  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2167  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  49.88 
 
 		 431 aa  414  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_732  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  50 
 
 		 417 aa  411  1e-113  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.999081  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2762  3-isopropylmalate dehydratase  50 
 
 		 413 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.452591  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2142  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  49.16 
 
 		 419 aa  405  1.0000000000000001e-112  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.245729  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1191  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  47.49 
 
 		 424 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0390  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  51.92 
 
 		 419 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2075  3-isopropylmalate dehydratase  48.44 
 
 		 416 aa  402  1e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1883  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  49.88 
 
 		 428 aa  402  1e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0990  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  48.44 
 
 		 423 aa  402  1e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1366  3-isopropylmalate dehydratase  47.71 
 
 		 420 aa  402  1e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0519  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  47 
 
 		 424 aa  404  1e-111  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000192959  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0747  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  49.04 
 
 		 416 aa  399  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0286  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  48.33 
 
 		 418 aa  398  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2263  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  49.03 
 
 		 413 aa  397  1e-109  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1102  3-isopropylmalate dehydratase  49.88 
 
 		 437 aa  396  1e-109  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1949  homoaconitate hydratase family protein  50.48 
 
 		 417 aa  395  1e-109  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0436  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  46.46 
 
 		 424 aa  395  1e-109  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.560563  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0227  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  50.36 
 
 		 421 aa  394  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2485  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  46.08 
 
 		 424 aa  393  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.836058  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2361  homoaconitate hydratase family protein  48.67 
 
 		 417 aa  394  1e-108  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.859627 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0471  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  45.99 
 
 		 424 aa  393  1e-108  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.699773  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2220  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  45.54 
 
 		 415 aa  389  1e-107  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0788  3-isopropylmalate dehydratase  52.21 
 
 		 382 aa  390  1e-107  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0185  homoaconitate hydratase family protein  49.16 
 
 		 419 aa  387  1e-106  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.576372  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1520  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  45.28 
 
 		 424 aa  385  1e-106  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.984893  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3219  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  49.4 
 
 		 418 aa  385  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0596  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  46.65 
 
 		 420 aa  388  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1792  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  50.75 
 
 		 418 aa  385  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.602442 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0399  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  45.52 
 
 		 424 aa  386  1e-106  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.320252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0015  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  46.28 
 
 		 418 aa  388  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2101  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  45.22 
 
 		 429 aa  382  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0493977  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1742  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  49.4 
 
 		 420 aa  379  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.482523  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0476  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  47.03 
 
 		 431 aa  377  1e-103  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0146744  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2211  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  46.54 
 
 		 419 aa  378  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00871543  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0383  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  48.8 
 
 		 417 aa  373  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0289  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44 
 
 		 425 aa  372  1e-102  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0126  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  45.58 
 
 		 419 aa  372  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0311  3-isopropylmalate dehydratase  43.87 
 
 		 421 aa  372  1e-102  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0366  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  48.56 
 
 		 417 aa  371  1e-101  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1458  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  45.91 
 
 		 419 aa  370  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.888399  normal  0.260054 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0506  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  46.19 
 
 		 420 aa  369  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0098  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  42.24 
 
 		 418 aa  369  1e-101  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0724  homoaconitate hydratase family protein  42.24 
 
 		 418 aa  367  1e-100  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.694886  normal  0.102444 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1194  homoaconitate hydratase family protein  42 
 
 		 418 aa  364  2e-99  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0583  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  45.56 
 
 		 422 aa  364  2e-99  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00310931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0789  homoaconitate hydratase family protein  41.77 
 
 		 418 aa  363  4e-99  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04370  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  47 
 
 		 423 aa  362  8e-99  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.910728 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0607  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  48.08 
 
 		 392 aa  361  1e-98  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.181914 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1610  homoaconitate hydratase family protein  45.08 
 
 		 417 aa  359  5e-98  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2728  3-isopropylmalate dehydratase  47.24 
 
 		 416 aa  356  3.9999999999999996e-97  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3356  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  43.33 
 
 		 421 aa  355  7.999999999999999e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2194  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.08 
 
 		 421 aa  349  5e-95  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.454447  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0124  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.05 
 
 		 419 aa  348  7e-95  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0195  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.29 
 
 		 421 aa  348  1e-94  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1903  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  43.36 
 
 		 427 aa  346  4e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473608  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1622  homoaconitate hydratase family protein  40.77 
 
 		 418 aa  346  4e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2259  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  43.68 
 
 		 421 aa  346  5e-94  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000792323  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0608  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.08 
 
 		 421 aa  346  5e-94  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0442  3-isopropylmalate dehydratase  46.28 
 
 		 423 aa  346  5e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0357426 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1030  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.69 
 
 		 431 aa  345  7e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000620705 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1268  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.2 
 
 		 427 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000132862  hitchhiker  0.0000000000181918 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1800  3-isopropylmalate dehydratase  44.58 
 
 		 404 aa  341  1e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.947019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3302  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  45.18 
 
 		 421 aa  342  1e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.879653  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3709  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.96 
 
 		 427 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129198  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2159  3-isopropylmalate dehydratase  43.88 
 
 		 398 aa  333  3e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.219475 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2017  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.81 
 
 		 419 aa  332  6e-90  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0599  3-isopropylmalate dehydratase  46.45 
 
 		 403 aa  331  2e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.588182  normal  0.202427 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0624  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.99 
 
 		 427 aa  328  8e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.588299  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1926  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.99 
 
 		 427 aa  328  8e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.700325  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3474  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.59 
 
 		 419 aa  326  4.0000000000000003e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0568206  hitchhiker  0.00508785 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1693  homoaconitate hydratase family protein  44.16 
 
 		 424 aa  326  6e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27842  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0741  homoaconitate hydratase family protein  44.57 
 
 		 432 aa  324  1e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375835  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1167  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.34 
 
 		 415 aa  324  2e-87  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3602  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  45.06 
 
 		 417 aa  322  8e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.187655 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1053  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.32 
 
 		 421 aa  322  9.000000000000001e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0634  3-isopropylmalate dehydratase  47.97 
 
 		 403 aa  322  9.000000000000001e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0544933  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0420  3-isopropylmalate dehydratase  40.85 
 
 		 422 aa  322  9.999999999999999e-87  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0665356 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>