More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0129 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0129  homoaconitate hydratase family protein  100 
 
 
418 aa  857    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.525388  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1366  3-isopropylmalate dehydratase  56.7 
 
 
420 aa  489  1e-137  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1100  3-isopropylmalate dehydratase  50.6 
 
 
418 aa  443  1e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1704  homoaconitate hydratase family protein  49.28 
 
 
419 aa  439  9.999999999999999e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1466  homoaconitate hydratase family protein  50.24 
 
 
429 aa  430  1e-119  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0167474  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2263  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  51.81 
 
 
413 aa  427  1e-118  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1961  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  53.01 
 
 
413 aa  425  1e-117  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.344282  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1630  3-isopropylmalate dehydratase  47.97 
 
 
418 aa  419  1e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0376  3-isopropylmalate dehydratase  46.54 
 
 
416 aa  419  1e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0471  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  47.88 
 
 
424 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.699773  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2338  homoaconitate hydratase family protein  46.3 
 
 
418 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2762  3-isopropylmalate dehydratase  51.33 
 
 
413 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.452591  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1191  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  47.86 
 
 
424 aa  412  1e-114  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1588  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  48.09 
 
 
419 aa  414  1e-114  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0402  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  48.1 
 
 
418 aa  411  1e-114  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.344506 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0436  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  47.17 
 
 
424 aa  411  1e-113  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.560563  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1520  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  46.7 
 
 
424 aa  410  1e-113  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.984893  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0399  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  46.7 
 
 
424 aa  409  1e-113  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.320252  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1036  homoaconitate hydratase family protein  47.26 
 
 
418 aa  409  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0289  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  48.24 
 
 
425 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2485  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  45.37 
 
 
424 aa  404  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.836058  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0519  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  47.13 
 
 
424 aa  402  1e-111  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000192959  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0098  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  47.02 
 
 
418 aa  403  1e-111  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2167  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  48.11 
 
 
431 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0788  3-isopropylmalate dehydratase  53.11 
 
 
382 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0356  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.29 
 
 
420 aa  396  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.928431  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0990  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  46.78 
 
 
423 aa  396  1e-109  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0724  homoaconitate hydratase family protein  46.78 
 
 
418 aa  396  1e-109  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.694886  normal  0.102444 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10870  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  46.67 
 
 
420 aa  398  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0286  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.5 
 
 
418 aa  392  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1194  homoaconitate hydratase family protein  46.3 
 
 
418 aa  394  1e-108  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0596  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  45.11 
 
 
420 aa  392  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000659262  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0646  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  48.34 
 
 
418 aa  391  1e-107  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00455068  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2101  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  46.17 
 
 
429 aa  390  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0493977  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1883  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  48.23 
 
 
428 aa  390  1e-107  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0621  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  48.1 
 
 
418 aa  389  1e-107  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0188797  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2142  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  45.58 
 
 
419 aa  389  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.245729  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0448  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  47.38 
 
 
417 aa  386  1e-106  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0311  3-isopropylmalate dehydratase  48.1 
 
 
421 aa  386  1e-106  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_390  aconitase/homoaconitase/3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  47.38 
 
 
417 aa  387  1e-106  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2211  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  45.82 
 
 
419 aa  385  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00871543  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0015  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  46.3 
 
 
418 aa  384  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2075  3-isopropylmalate dehydratase  45.45 
 
 
416 aa  382  1e-105  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0476  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  46.06 
 
 
431 aa  382  1e-105  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0146744  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0789  homoaconitate hydratase family protein  45.82 
 
 
418 aa  382  1e-105  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0425  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  47.38 
 
 
431 aa  383  1e-105  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0828  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  45.67 
 
 
416 aa  379  1e-104  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2254  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  45 
 
 
421 aa  379  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0747  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.95 
 
 
416 aa  375  1e-103  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0126  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  45.11 
 
 
419 aa  377  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_732  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  45.67 
 
 
417 aa  377  1e-103  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.999081  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0227  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  45 
 
 
421 aa  374  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0383  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  46.06 
 
 
417 aa  374  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2220  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  43.13 
 
 
415 aa  375  1e-102  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0366  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  46.06 
 
 
417 aa  373  1e-102  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0583  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  43.65 
 
 
422 aa  369  1e-101  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00310931  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2361  homoaconitate hydratase family protein  46.41 
 
 
417 aa  371  1e-101  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.859627 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0185  homoaconitate hydratase family protein  44.15 
 
 
419 aa  367  1e-100  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.576372  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3516  3-isopropylmalate dehydratase  43.44 
 
 
410 aa  368  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1030  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  43.1 
 
 
431 aa  367  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000620705 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1053  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.42 
 
 
421 aa  363  2e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3474  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.18 
 
 
419 aa  363  2e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0568206  hitchhiker  0.00508785 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1458  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.33 
 
 
419 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.888399  normal  0.260054 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1949  homoaconitate hydratase family protein  45.71 
 
 
417 aa  357  9.999999999999999e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0420  3-isopropylmalate dehydratase  42.69 
 
 
422 aa  355  6.999999999999999e-97  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0665356 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1742  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.96 
 
 
420 aa  355  1e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.482523  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0741  homoaconitate hydratase family protein  43.19 
 
 
432 aa  355  1e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375835  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1102  3-isopropylmalate dehydratase  42.65 
 
 
437 aa  353  2e-96  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2987  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  42.24 
 
 
419 aa  352  8e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3029  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  42.24 
 
 
419 aa  352  8e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.367513 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3219  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.01 
 
 
418 aa  351  1e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2194  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  43.13 
 
 
421 aa  350  2e-95  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.454447  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2728  3-isopropylmalate dehydratase  45 
 
 
416 aa  350  2e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0442  3-isopropylmalate dehydratase  45.24 
 
 
423 aa  350  3e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0357426 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1610  homoaconitate hydratase family protein  40.67 
 
 
417 aa  350  4e-95  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1900  3-isopropylmalate dehydratase  41.8 
 
 
431 aa  349  6e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3356  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  42.62 
 
 
421 aa  349  6e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0390  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.38 
 
 
419 aa  349  7e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04370  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  41.25 
 
 
423 aa  347  2e-94  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.910728 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1622  homoaconitate hydratase family protein  42.34 
 
 
418 aa  347  2e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0738  homoaconitate hydratase family protein  40.65 
 
 
432 aa  346  4e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2175  homoaconitate hydratase family protein  41.11 
 
 
431 aa  345  6e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0601  3-isopropylmalate dehydratase  41.11 
 
 
431 aa  343  5e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2017  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.28 
 
 
419 aa  342  1e-92  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3302  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.88 
 
 
421 aa  342  1e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.879653  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0275  3-isopropylmalate dehydratase  43.84 
 
 
415 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.772667  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0599  3-isopropylmalate dehydratase  46.6 
 
 
403 aa  339  4e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.588182  normal  0.202427 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2159  3-isopropylmalate dehydratase  42.45 
 
 
398 aa  340  4e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.219475 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0848  homoaconitate hydratase family protein  40.37 
 
 
431 aa  339  5e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.288921  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0737  homoaconitate hydratase family protein  41.57 
 
 
431 aa  338  9.999999999999999e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0195  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.86 
 
 
421 aa  336  3.9999999999999995e-91  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1722  homoaconitate hydratase family protein  41.11 
 
 
432 aa  336  5e-91  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.410724 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0124  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.04 
 
 
419 aa  335  7.999999999999999e-91  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1167  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  44.87 
 
 
415 aa  335  7.999999999999999e-91  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1800  3-isopropylmalate dehydratase  44.98 
 
 
404 aa  334  1e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.947019  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0608  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  42.89 
 
 
421 aa  333  4e-90  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0634  3-isopropylmalate dehydratase  45.93 
 
 
403 aa  332  7.000000000000001e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0544933  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3602  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  43.68 
 
 
417 aa  332  8e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.187655 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2259  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  42.08 
 
 
421 aa  332  9e-90  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000792323  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0607  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  45.08 
 
 
392 aa  332  9e-90  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.181914 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>